Genetische Kartierungsfunktionen: Herleitung, Unterschiede und Anwendung auf Typisierungsergebnisse für das Rind
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1997
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INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS
SEITE
1
EINLEITUNG
1
2
LITERATURUEBERSICHT
2
2.1
ARTEN
VON
GENOMKARTEN
2
2.1.1
PHYSISCHE
KARTEN
2
2.1.2
GENETISCHE
KARTEN
3
2.2
ZENTRALE
BEGRIFFE
4
2.2.1
MEIOSE
4
2.2.2
DISTANZMASSE
6
2.2.3
KARTIERUNGSFUNKTIONEN
UND
INTERFERENZ
8
2.3
MULTILOCUS-ANALYSEN
14
2.4
SPERMIENTYPISIERUNG
14
2.5
STATISTISCHE
METHODEN
'
15
2.5.1
DER
EM-ALGORITHMUS
15
2.5.2
BOOTSTRAPPING
16
2.5.3
LIKELIHOOD-QUOTIENTEN-TEST
UND
LOD
SCORE
17
2.5.4
DISKRIMINANZANALYSE
18
2.5.5
METHODE
DER
KLEINSTEN
QUADRATE 19
2.6
INTERPOLATION
19
3
THEORIE
DER
KARTIERUNGSFUNKTIONEN
21
3.1
KEINE
INTERFERENZ
21
3.2
INTERFERENZ
22
3.2.1
DIFFERENTIALGLEICHUNGSMETHODE
23
3.2.2
CROSSING-OVER-FORMATIONSMETHODE
26
3.3
NUR
CHROMATID-INTERFERENZ
46
3.4
MULTILOCUS-EIGNUNG
47
4
MATERIAL
50
4.1
DATENSTRUKTUR
50
4.2
MARKER
51
5
METHODEN
55
5.1
DATENERHEBUNG
55
5.2
GAMETENWAHRSCHEINLICHKEITEN
57
5.3
LIKELIHOOD
59
5.4
DER
EM-ALGORITHMUS
59
5.5
STATISTISCHE
METHODEN
62
5.5.1
BOOTSTRAPPING
62
5.5.2
LIKELIHOOD-QUOTIENTEN-TEST
UND
LOD
SCORE
63
5.5.3
DISKRIMINANZANALYSE
64
5.5.4
METHODE
DER
KLEINSTEN
QUADRATE
64
5.6
TECHNISCHE
ANGABEN
65
U
6
ERGEBNISSE
67
6.1
ANALYSE
DER
DATEN
67
6.1.1
WAHL
DER
KARTIERUNGSFUNKTION
UND
ZUGEHOERIGE
SUPPORTINTERVALLE
67
6.1.2
PARAMETER
DER
KARTIERUNGSFUNKTIONEN
70
6.1.3
KARTIERUNGSABSTAND
71
6.1.4
BOOTSTRAPPING
73
6.1.5
OPTIMALE
KARTIERUNGSFUNKTION
75
6.2
EIGENER
ANSATZ
80
6.2.1
COUNT-LOCATION-PROZESS
83
6.2.2
VERGLEICH
DER
FUNKTIONEN
86
7
DISKUSSION
87
7.1
EIGNUNG
DER
KARTIERUNGSFUNKTIONEN
87
7.2
BEWERTUNG
DER
EIGENEN
UNTERSUCHUNGEN
89
7.2.1
VERGLEICH
MIT
ANDEREN
ARBEITEN
89
7.2.2
BESTIMMUNG
DER
OPTIMALEN
KARTIERUNGSFUNKTION
90
7.2.3
EINSCHAETZUNG
DER
VERWENDETEN
STATISTISCHEN
METHODEN
91
7.3
ERSTELLEN
EIGENER
FUNKTIONEN
92
7.4
BESTIMMUNG
DER
KARTIERUNGSFUNKTION
IN
RINDERDATENSAETZEN
93
7.5
BEDEUTUNG
KORREKTER
KARTIERUNGSFUNKTIONEN
94
7.5.1
EINFLUSS
VERSCHIEDENER
KARTIERUNGSFUNKTIONEN
AUF
DIE
QTL-KARTIERUNG
94
7.5.2
KOPPLUNGSANALYSEN
95
8
ZUSAMMENFASSUNG
98
9
LITERATURVERZEICHNIS
100
10
ANHANG
108 |
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