Wissensbasiertes Protein-Protein-Docking:
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| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
1997
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| Beschreibung: | Bielefeld, Univ., Diss., 1997 |
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INHALTSVERZEICHNIS
1 EINLEITUNG 1
1.1 ZIELSETZUNG . 3
1.2 UEBERBLICK. -. 3
2 DAS PROTEIN-DOCKING 7
2.1 PROTEINE UND PROTEINDATEN. 8
2.1.1 BESCHREIBUNG DER PROTEINSTRUKTUREN. 10
2.1.2 EXPERIMENTELLE STRUKTURAUFKLAERUNG. 14
2.1.3 DIE BROOKHAVEN-PROTEINDATENBANK. 19
2.1.4 WECHSELWIRKUNGEN ZWISCHEN PROTEINEN. 20
2.2 DAS PROTEIN-DOCKING-PROBLEM IM UEBERBLICK. 22
3 SEGMENTIERUNG BIOMOLEKULARER OBERFLAECHEN 31
3.1 PROTEINOBERFLAECHENDEFINITION. 33
3.2 STATISTISCHE SEGMENTIERUNGSTECHNIK. 38
3.2.1 MERKMALSBERECHNUNG. 38
3.2.2 DAS KLASSIFIZIERUNGSVERFAHREN. 47
3.2.3 REGIONENWACHSTUMSVERFAHREN. 50
3.2.4 ERGEBNISSE. 53
3.3 GEOMETRISCHE SEGMENTIERUNGSTECHNIK. 56
III
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
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3.4 RESUEMEE
58
4 DAS DOCKINGSYSTEM
BL
4.1 DAS SEMANTISCHE NETZWERKSYSTEM ERNEST. 62
4.2 PROBLEMIDENTIFIKATION UND KONZEPTIONELLE ARBEITEN. 66
4.3 IMPLEMENTIERUNGEN. 72
\
4.3.1 METHODEN. 73
4.3.2 WISSENSBASIS . 81
4.3.3 KONTROLLE. 89
4.3.4 ERGEBNISSE. 96
5 EXPERIMENTELLE UNTERSUCHUNGEN M
5.1 DURCHFUEHRUNG EINES YYLEAVE-ONE-OUT"-TESTS . UL
5.2 DAS DOCKINGNETZ ZUR GEOMETRISCHEN SEGMENTIERUNG. 114
5.2.1 BESCHREIBUNG DER SYSTEMMODIFIKATIONEN. 114
5.2.2 EVALUIERUNG DER BEWERTUNGSFUNKTIONEN. 117
5.3 DISKUSSION. U9
6 ZUSAMMENFASSUNG 123
IV |
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