Untersuchungen zur Ökologie Ammoniak-oxidierender Bakterien:
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| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
1996
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| Beschreibung: | Hamburg, Univ., Diss., 1996 |
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INHALTSVERZEICHNIS
SEITE
1.
ZUSAMMENFASSUNG
.
1
2.
EINLEITUNG
.
3
3.
MATERIAL
UND
METHODEN
.
12
3.1
CHEMIKALIEN
UND
ENZYME
.
12
3.2
TECHNISCHE
GERAETE
.
12
3.3
BAKTERIENSTAEMME
.
14
3.4
KULTURBEDINGUNGEN
.
15
3.4.1
NAEHRMEDIEN
.
15
3.4.2
KULTURFUEHRUNG
.
16
3.4.2.1
ANZUCHT
.
16
3.4.2.2
REINHEITSKONTROLLE
.
17
3.4.2.3
ABERNTEN
DER
ARBEITSKULTUREN
.
17
3.5
ZELLZAHLBESTIMMUNGEN
IN
WASSER
UND
SEDIMENTPROBEN
DER
ELBE
.
17
3.5.1
PROBENNAHME
.
17
3.5.2
AUFARBEITUNG
DER
PROBEN
.
18
3.5.3
TROCKENGEWICHTSBESTIMMUNGEN
.
19
3.5.4
ZELLZAHLBESTIMMUNGEN
MIT
DER
MPN-METHODE
.
19
3.5.5
AKTIVITAETSMESSUNGEN
.20
3.6
ISOLIERUNG
VON
AMMONIAK
OXIDIERENDEN
BAKTERIEN
.
20
3.7
PHYSIOLOGISCHE
UNTERSUCHUNGEN
.
21
3.7.1
AMMONIUMBESTIMMUNG
.
21
3.7.2
NITRITBESTIMMUNG
.
22
3.7.3
TOLERANZ
GEGENUEBER
DER
NACI
UND
NH
4
CI-KONZENTRATION
.
22
3.7.4
TOLERANZ
GEGENUEBER
SCHWERMETALLEN
.
23
3.7.5
HARNSTOFFABBAU
.
23
3.7.6
WACHSTUM
BEI
NIEDRIGEN
TEMPERATUREN
.
24
3.7.7
ANHEFTUNG
AN
OBERFLAECHEN
.
24
3.7.8
BESTIMMUNG
DER
K
S
-WERTE
.
25
3.7.8.1
PROTEINBESTIMMUNG
.
25
3.7.8.2
SAUERSTOFFZEHRUNG
IN
ABHAENGIGKEIT
VON
DER
SUBSTRATKONZENTRATION
.
26
INHALTSVERZEICHNIS
3.8
DNA-PRAEPARATION
.
27
3.8.1
ISOLIERUNG
UND
REINIGUNG
VON
GENOMISCHER
DNA
.
27
3.8.2
BESTIMMUNG
DER
DNA-KONZENTRATION
.29
3.9
BESTIMMUNG
DER
G+C-GEHALTE
DER
DNA
.
29
3.10
DNA-DNA-HYBRIDISIERUNG
.
30
3.11
AMPLIFIKATION
DER
16S
RRNA-GENE
.
30
3.11.1
PCR
.
30
3.11.2
REINIGUNG
DER
PCR-PRODUKTE
.
34
3.11.3
AGAROSEGELELEKTROPHORESE
.34
3.12
SEQUENZIERUNG
DER
DURCH
PCR
AMPLIFIZIERTEN
16S
RDNA
.
35
3.12.1
SEQUENZIERUNG
MIT
RADIOAKTIVER
MARKIERUNG
.
36
3.12.1.1
SEQUENZREAKTIONEN
.
36
3.12.1.2
POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE
.
39
3.12.1.3
AUTORADIOGRAPHIE
.
41
3.12.2
SEQUENZIERUNG
MIT
FLUORESZENZMARKIERUNG
.
41
3.12.2.1
CYCLE
SEQUENCING
.
41
3.12.2.2
REINIGUNG
DER
PROBEN
NACH
DEM
CYCLE
SEQUENCING
.
43
3.12.2.3
SEQUENZANALYSE
MIT
FLUORESZENZMARKIERTEN
DNA-FRAGMENTEN
.
44
3.12.3
AUSWERTUNG
DER
SEQUENZANALYSEN
.
44
4.
ERGEBNISSE
.
45
4.1
VERBREITUNGSMUSTER
VON
AMMONIAKOXIDANTEN
IN
DER
TIDE-ELBE
.
45
4.1.1
ZELLZAHLEN
DER
AMMONIAKOXIDANTEN
IM
WASSERKOERPER
.
45
4.1.2
ZELLZAHLEN
DER
AMMONIAKOXIDANTEN
IM
SALZGRADIENTEN
.
48
4.1.3
ZELLZAHLEN
DER
AMMONIAKOXIDANTEN
IN
SEDIMENTEN
.
49
4.2
ARTENBESTAND
DER
AMMONIAKOXIDANTEN
IN
DER
TIDE-ELBE
.
51
4.2.1
ISOLIERUNG
VON
AMMONIAKOXIDANTEN
.
51
4.2.2
TAXONOMISCHE
EINORDNUNG
.
52
4.2.2.1
G+C-WERTE
.
53
4.2.2.2
DNA-DNA-HYBRIDISIERUNGEN
.
54
4.2.3
PHYSIOLOGISCHE
CHARAKTERISIERUNG
.56
4.2.3.1
SUBSTRATTOLERANZ
.
56
4.2.3.2
SALZTOLERANZ
.
58
4.2.3.3
UREASEAKTIVITAET
.60
4.2.3.4
TEMPERATURABHAENGIGES
WACHSTUM
.
61
4.2.3.5
ZUSAMMENFASSUNG
DER
ERGEBNISSE
DER
PHAENOTYPISCHEN
CHARAKTERISIERUNG
DER
ELB-ISOLATE
.
61
INHALTSVERZEICHNIS
4.3
PHYLOGENETISCHE
UNTERSUCHUNGEN
DER
AUS
DER
TIDE-ELBE
ISOLIERTEN
STAEMME
DER
AMMONIAKOXIDANTEN
.
63
4.3.1
PCR-AMPLIFIKATION
DER
16S
RRNA-GENE
.
63
4.3.2
SEQUENZANALYSEN
PCR-AMPLIFIZIERTER
16S
RDNA
.
64
4.3.3
AUSWAHL
DES
BEREICHES
DER
16S
RRNA
FUER
DIE
TEILSEQUENZIERUNG
.
65
4.3.4
TEILSEQUENZIERUNG
DER
16S
RRNA-GENAMPLIFIKATE
.
65
4.3.5
VERGLEICH
DER
ERMITTELTEN
TEILSEQUENZEN
.
68
4.3.6
EINORDNUNG
DER
NEUEN
ARTEN
IN
DEN
STAMMBAUM
DER
AMMONIAK
OXIDANTEN
.
74
4.4
OEKOPHYSIOLOGISCHE
UNTERSUCHUNGEN
AUF
DER
BASIS
PHYLOGENE
TISCHER
VERWANDTSCHAFTSBEZIEHUNGEN
.
76
4.4.1
ANHEFTUNG
AN
OBERFLAECHEN
.
76
4.4.2
TOLERANZ
GEGENUEBER
SCHWERMETALLEN
.
82
4.4.3
KJ-WERTE
.
85
5.
DISKUSSION
.
89
6.
LITERATURVERZEICHNIS
.
99
VEROEFFENTLICHUNGEN |
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