Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik: Computersimulationen am Modellsystem Insulin
Gespeichert in:
| 1. Verfasser: | |
|---|---|
| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
1997
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | Aachen, Techn. Hochsch., Habil.-Schr., 1997 |
| Beschreibung: | 148 Bl. Ill., graph. Darst. |
Internformat
MARC
| LEADER | 00000nam a2200000 c 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | BV011365578 | ||
| 003 | DE-604 | ||
| 007 | t | ||
| 008 | 970528s1997 gw ad|| m||| 00||| ger d | ||
| 016 | 7 | |a 950186449 |2 DE-101 | |
| 035 | |a (OCoLC)64543145 | ||
| 035 | |a (DE-599)BVBBV011365578 | ||
| 040 | |a DE-604 |b ger |e rakddb | ||
| 041 | 0 | |a ger | |
| 044 | |a gw |c DE | ||
| 049 | |a DE-19 |a DE-11 | ||
| 100 | 1 | |a Krüger, Peter |e Verfasser |4 aut | |
| 245 | 1 | 0 | |a Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik |b Computersimulationen am Modellsystem Insulin |c vorgelegt von Peter Krüger |
| 264 | 1 | |c 1997 | |
| 300 | |a 148 Bl. |b Ill., graph. Darst. | ||
| 336 | |b txt |2 rdacontent | ||
| 337 | |b n |2 rdamedia | ||
| 338 | |b nc |2 rdacarrier | ||
| 500 | |a Aachen, Techn. Hochsch., Habil.-Schr., 1997 | ||
| 650 | 0 | 7 | |a Insulin |0 (DE-588)4027221-7 |2 gnd |9 rswk-swf |
| 650 | 0 | 7 | |a Molekulardynamik |0 (DE-588)4170370-4 |2 gnd |9 rswk-swf |
| 655 | 7 | |0 (DE-588)4113937-9 |a Hochschulschrift |2 gnd-content | |
| 689 | 0 | 0 | |a Insulin |0 (DE-588)4027221-7 |D s |
| 689 | 0 | 1 | |a Molekulardynamik |0 (DE-588)4170370-4 |D s |
| 689 | 0 | |5 DE-604 | |
| 856 | 4 | 2 | |m DNB Datenaustausch |q application/pdf |u http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=007638607&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA |3 Inhaltsverzeichnis |
| 943 | 1 | |a oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-007638607 | |
Datensatz im Suchindex
| _version_ | 1812453229479329792 |
|---|---|
| adam_text |
INHALTSVERZEICHNIS
1 EINLEITUNG 8
1.1 MOEGLICHKEITEN UND ZIELE VON SINRALATIONSRECHNUNGEN. 8
1.2 PROTEINE UND DYNAMIK. 9
1.3 INSULIN ALS EXEMPLARISCHER FALL. 10
2 METHODEN 12
2.1 MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATION ALS METHODE. 12
2.1.1 ENERGIEPOTENTIAL. 13
2.1.2 INTEGRATION DER BEWEGUNGSGLEICHUNG. 14
2.1.3 METHODE DER ZWANGSKRAEFTE SHAKE. 15
2.1.4 BERECHNUNG DER NICHTBINDENDEN WECHSELWIRKUNGEN.15
2.1.5 TEMPERATURBAD. 16
2.1.6 ENERGIEMINIMIERUNG . 17
2.2 BERECHNUNG VON KONFORMATIONSUEBERGAENGEN. 19
2.2.1 ZIELSETZUNG. 19
2.2.2 STAND DER FORSCHUNG. 19
2.2.3 TARGETED ENERGY MINIMIZATION (TEM).22
2.2.4 TARGETED MOLECULAR DYNAMICS (TMD).24
2.2.5 'LEAP-FROG'-ALGORITHMUS MIT ZWANGSKRAEFTEN.26
2.2.6 THERMODYNAMISCHE INTEGRATION UND TMD.27
2.2.7 BERECHNUNG DER FREIEN ENERGIE MITTELS DER ZWANGSKRAEFTE . 29
2.3 DAS PROGRAMMPAKET SIMLYS.31
2.3.1 ZIEL DER PROGRAMMENTWICKLUNG. 31
4
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
HTTP://D-NB.INFO/950186449
INHALTSVERZEICHNIS
5
2.3.2 GRUNDLEGENDER PROGRAMMAUFBAU.32
2.3.3 SEQUENTIELLE 'KEY'-FILES.35
2.3.4 GRUPPEN-'KEY'-FILES.35
2.3.5 FUNKTIONEN DES PROGRAMMS SIMLYS.38
2.4 ALLGEMEINE ABKUERZUNGEN.38
3 DYNAMIK DES INSULINMOLEKUELS IN LOESUNG 39
3.1 PROBLEMSTELLUNG.39
3.2 BESCHREIBUNG DER INSULINSTRUKTUR.41
3.2.1 DAS WILDTYP-INSULIN. 41
3.2.2 DES[(B26-30)-PENTAPEPTID]INSULIN (DPI) .45
3.3 DURCHFUEHRUNG DER BERECHNUNGEN.48
3.4 ERGEBNISSE UND DISKUSSION.49
3.4.1 POTENTIELLE ENERGIE.49
3.4.2 RMS-POSITIONSDIFFERENZEN IM ZEITVERLAUF.49
3.4.3 RMS-POSITIONSDIFFERENZEN DER GEMITTELTEN STRUKTUREN.52
3.4.4 PROTONEN-ABSTANDSVERLETZUNGEN.53
3.4.5 VERGLEICH DER SIMULATIONEN MIT DEM EXPERIMENT.54
3.4.6 AMID-H/D-AUSTAUSCHEXPERIMENTE.54
3.4.7 WASSERSTOFFBRUECKEN MIT DEM LOESUNGSMITTEL.57
3.4.8 VERGLEICH MIT NOE-PROTONENABSTAENDEN.58
3.4.9 POSITIONSDIFFERENZEN IN DEN SEKUNDAERSTRUKTUR-ELEMENTEN . 60
3.4.10 POSITIONSDIFFERENZEN DER TRANSIENTEN STRUKTUREN .62
3.5 SCHLUSSFOLGERUNGEN.65
4 DYNAMIK DES AL-B29-VERBRUECKTEN INSULINS 67
4.1 PROBLEMSTELLUNG.67
4.1.1 STRUKTURELLE VORAUSSETZUNGEN DER REZEPTORBINDUNG.67
4.1.2 FLEXIBILITAET DER C-TERMINALEN B-KETTE . .69
4.2 DURCHFUEHRUNG DER BERECHNUNGEN.72
4.3 ERGEBNISSE UND DISKUSSION.75
INHALTSVERZEICHNIS
6
4.3.1 POTENTIELLE ENERGIE.75
4.3.2 RMS-POSITIONSDIFFERENZEN.75
4.3.3 ABSTAND A1-B30.79
4.3.4 WASSERSTOFFBRUECKEN.80
V
4.3.5 POSITIONSDIFFERENZEN NACH W
EGNAHME DER BRUECKE.80
4.3.6 RMS-FLUKTUATIONEN.81
4.3.7 ERREICHBARE OBERFLAECHE.82
4.4 SCHLUSSFOLGERUNGEN.84
5 SIMULATION EINES KONFORMATIONSUEBERGANGES _ 85
5.1 PROBLEMSTELLUNG.85
5.1.1 KONFORMATIONSUEBERGAENGE IN PROTEINEN.85
5.1.2 MOEGLICHKEITEN DER BERECHNUNG.86
5.2 DAS GEGENWAERTIGE MODELL DES T-R-UBERGANGES.87
5.2.1 SITUATION IM KRISTALL.87
5.2.2 SITUATION IN LOESUNG.90
5.2.3 PHENOLISCHE UND ANIONISCHE LIGANDEN .93
5.2.4 KOOPERATIVST . 94
5.3 SIMULATIONSRECHNUNGEN ZUR ANALYSE DES KONFORMATIONSUEBERGANGES . . 94
5.3.1 SIMULATION DES MONOMEREN UND HEXAMEREN.95
5.3.2 ZIEL DER ANALYSE.95
5.4 DURCHFUEHRUNG DER BERECHNUNGEN.95
5.5 ERGEBNISSE UND DISKUSSION.98
5.5.1 POTENTIELLE ENERGIEN TEM.98
5.5.2 POTENTIELLE ENERGIEN TMD. 100
5.5.3 KONFORMATIONSRAUM TEM.102
5.5.4 KONFORMATIONSRAUM TMD.103
5.5.5 HAUPTKETTENDIEDERWINKEL TEM .103
5.5.6 HAUPTKETTENDIEDERWINKEL TMD.106
5.5.7 GRAPHISCHE DARSTELLUNG DER TRANSFORMATION TEM.106
INHALTSVERZEICHNIS
7
5.5.8 GRAPHISCHE DARSTELLUNG DER TRANSFORMATION TMD.110
5.6 SCHLUSSFOLGERUNGEN.113
6 BERECHNUNG DER FREIEN ENERGIE 115
6.1 ZIELSETZUNG .\.115
6.2 DURCHFUEHRUNG DER BERECHNUNGEN. 116
6.3 ERGEBNISSE UND DISKUSSION.117
6.4 SCHLUSSFOLGERUNGEN.121
7 SCHLUSSBETRACHTUNG
123 |
| any_adam_object | 1 |
| author | Krüger, Peter |
| author_facet | Krüger, Peter |
| author_role | aut |
| author_sort | Krüger, Peter |
| author_variant | p k pk |
| building | Verbundindex |
| bvnumber | BV011365578 |
| ctrlnum | (OCoLC)64543145 (DE-599)BVBBV011365578 |
| format | Book |
| fullrecord | <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><collection xmlns="http://www.loc.gov/MARC21/slim"><record><leader>00000nam a2200000 c 4500</leader><controlfield tag="001">BV011365578</controlfield><controlfield tag="003">DE-604</controlfield><controlfield tag="007">t</controlfield><controlfield tag="008">970528s1997 gw ad|| m||| 00||| ger d</controlfield><datafield tag="016" ind1="7" ind2=" "><subfield code="a">950186449</subfield><subfield code="2">DE-101</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(OCoLC)64543145</subfield></datafield><datafield tag="035" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">(DE-599)BVBBV011365578</subfield></datafield><datafield tag="040" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">DE-604</subfield><subfield code="b">ger</subfield><subfield code="e">rakddb</subfield></datafield><datafield tag="041" ind1="0" ind2=" "><subfield code="a">ger</subfield></datafield><datafield tag="044" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">gw</subfield><subfield code="c">DE</subfield></datafield><datafield tag="049" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">DE-19</subfield><subfield code="a">DE-11</subfield></datafield><datafield tag="100" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Krüger, Peter</subfield><subfield code="e">Verfasser</subfield><subfield code="4">aut</subfield></datafield><datafield tag="245" ind1="1" ind2="0"><subfield code="a">Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik</subfield><subfield code="b">Computersimulationen am Modellsystem Insulin</subfield><subfield code="c">vorgelegt von Peter Krüger</subfield></datafield><datafield tag="264" ind1=" " ind2="1"><subfield code="c">1997</subfield></datafield><datafield tag="300" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">148 Bl.</subfield><subfield code="b">Ill., graph. Darst.</subfield></datafield><datafield tag="336" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">txt</subfield><subfield code="2">rdacontent</subfield></datafield><datafield tag="337" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">n</subfield><subfield code="2">rdamedia</subfield></datafield><datafield tag="338" ind1=" " ind2=" "><subfield code="b">nc</subfield><subfield code="2">rdacarrier</subfield></datafield><datafield tag="500" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Aachen, Techn. Hochsch., Habil.-Schr., 1997</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1="0" ind2="7"><subfield code="a">Insulin</subfield><subfield code="0">(DE-588)4027221-7</subfield><subfield code="2">gnd</subfield><subfield code="9">rswk-swf</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1="0" ind2="7"><subfield code="a">Molekulardynamik</subfield><subfield code="0">(DE-588)4170370-4</subfield><subfield code="2">gnd</subfield><subfield code="9">rswk-swf</subfield></datafield><datafield tag="655" ind1=" " ind2="7"><subfield code="0">(DE-588)4113937-9</subfield><subfield code="a">Hochschulschrift</subfield><subfield code="2">gnd-content</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="0"><subfield code="a">Insulin</subfield><subfield code="0">(DE-588)4027221-7</subfield><subfield code="D">s</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2="1"><subfield code="a">Molekulardynamik</subfield><subfield code="0">(DE-588)4170370-4</subfield><subfield code="D">s</subfield></datafield><datafield tag="689" ind1="0" ind2=" "><subfield code="5">DE-604</subfield></datafield><datafield tag="856" ind1="4" ind2="2"><subfield code="m">DNB Datenaustausch</subfield><subfield code="q">application/pdf</subfield><subfield code="u">http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=007638607&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA</subfield><subfield code="3">Inhaltsverzeichnis</subfield></datafield><datafield tag="943" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-007638607</subfield></datafield></record></collection> |
| genre | (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content |
| genre_facet | Hochschulschrift |
| id | DE-604.BV011365578 |
| illustrated | Illustrated |
| indexdate | 2024-10-09T16:08:12Z |
| institution | BVB |
| language | German |
| oai_aleph_id | oai:aleph.bib-bvb.de:BVB01-007638607 |
| oclc_num | 64543145 |
| open_access_boolean | |
| owner | DE-19 DE-BY-UBM DE-11 |
| owner_facet | DE-19 DE-BY-UBM DE-11 |
| physical | 148 Bl. Ill., graph. Darst. |
| publishDate | 1997 |
| publishDateSearch | 1997 |
| publishDateSort | 1997 |
| record_format | marc |
| spelling | Krüger, Peter Verfasser aut Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik Computersimulationen am Modellsystem Insulin vorgelegt von Peter Krüger 1997 148 Bl. Ill., graph. Darst. txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Aachen, Techn. Hochsch., Habil.-Schr., 1997 Insulin (DE-588)4027221-7 gnd rswk-swf Molekulardynamik (DE-588)4170370-4 gnd rswk-swf (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content Insulin (DE-588)4027221-7 s Molekulardynamik (DE-588)4170370-4 s DE-604 DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=007638607&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
| spellingShingle | Krüger, Peter Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik Computersimulationen am Modellsystem Insulin Insulin (DE-588)4027221-7 gnd Molekulardynamik (DE-588)4170370-4 gnd |
| subject_GND | (DE-588)4027221-7 (DE-588)4170370-4 (DE-588)4113937-9 |
| title | Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik Computersimulationen am Modellsystem Insulin |
| title_auth | Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik Computersimulationen am Modellsystem Insulin |
| title_exact_search | Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik Computersimulationen am Modellsystem Insulin |
| title_full | Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik Computersimulationen am Modellsystem Insulin vorgelegt von Peter Krüger |
| title_fullStr | Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik Computersimulationen am Modellsystem Insulin vorgelegt von Peter Krüger |
| title_full_unstemmed | Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik Computersimulationen am Modellsystem Insulin vorgelegt von Peter Krüger |
| title_short | Strukturell und funktionell relevante Proteindynamik |
| title_sort | strukturell und funktionell relevante proteindynamik computersimulationen am modellsystem insulin |
| title_sub | Computersimulationen am Modellsystem Insulin |
| topic | Insulin (DE-588)4027221-7 gnd Molekulardynamik (DE-588)4170370-4 gnd |
| topic_facet | Insulin Molekulardynamik Hochschulschrift |
| url | http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=007638607&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA |
| work_keys_str_mv | AT krugerpeter strukturellundfunktionellrelevanteproteindynamikcomputersimulationenammodellsysteminsulin |