Untersuchungen zur Struktur und DNA-Bindung des Proteins FIS aus Escherichia coli:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
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1996
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INHALTSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG
1
1.1
DNA-PROTEIN-WECHSELWIRKUNG
ALS
MOLEKULARE
ERKENNUNG
.
1
1.2
GEBOGENE
DNA-STRUKTUREN
.
5
1.3
DAS
DNA-BINDENDE
PROTEIN
FIS
.
7
1.4
AUSGANGSPUNKT
UND
GLIEDERUNG
DIESER
ARBEIT
.
11
2
MATERIALIEN
UND
METHODEN
12
2.1
MATERIALIEN
.
12
2.2
BIOCHEMISCHE
METHODEN
.
13
2.3
MOLEKULARBIOLOGISCHE
METHODEN
.
17
2.4
SPEKTROSKOPIE
.
21
2.5
KRISTALLISATION
.
22
2.6
KRISTALLOGRAPHISCHE
METHODEN
.
24
3
KRISTALLSTRUKTUREN
VON
FISA26
UND
FIS-AA26
29
3.1
KRISTALLISATION
UND
MESSUNG
VON
BEUGUNGSDATEN
.
29
3.2
STRUKTURLOESUNG
.
31
3.3
KRISTALLOGRAPHISCHE
VERFEINERUNG
.
37
3.4
KRISTALLPACKUNGEN
.
40
3.5
HAUPTKETTENVERIAUF
UND
TEMPERATURFAKTOREN
.
41
3.6
STRUKTUR
DER
C-TERMINALEN
DNA-BINDENDEN
DOMAENE
.
43
3.7
HYDROPHOBE
WECHSELWIRKUNGEN
.
44
3.8
DISKUSSION
.
47
4
KOOPERATIVE
BINDUNG
VON
FIS
AN
DNA
50
4.1
DIMER-DIMER-WECHSELWIRKUNGEN
IM
KRISTALL
.
50
4.2
MODELL
AUF
BASIS
DER
KRISTALLSTRUKTUR
VON
FISA26
.
52
4.3
VERGLEICH
MIT
ANDEREN
DNA-PROTEIN-KOMPLEXEN
.
54
4.4
DOCKING
STUDIEN
.
55
4.5
DISKUSSION
.
58
5
SEQUENZSPEZIFITAET
DER
DNA-BINDUNG
VON
FIS
61
5.1
SYNTHESE
DER
DNA
MIT
GEMISCHTER
SEQUENZ
.
61
5.2
CHARAKTERISIERUNG
DER
SEQUENZGEMISCHE
.
62
5.3
PCR-AMPLIFIKATION
.
64
5.4
GELRETARDIERUNGSVERSUCHC
.
66
5.5
IMMOBILISIERTES
FIS
.
68
5.6
SELEKTIONSVERSUCHE
.
69
5.7
BINDUNG
UND
KRUEMMUNG
DER
SELEKTIERTEN
DNA
.
70
5.8
QUANTITATIVE
SEQUENZANALYSE
.
74
5.9
DISKUSSION
.
79
6
BINDUNGSKONSTANTEN
DES
FIS-DNA-KOMPLEXES
82
6.1
ZWEI-ZUSTANDS-MODELL
.
82
6.2
MEBPRINZIP
.
85
6.3
PRAEPARATION
VON
TYYPTOPHANMUTANTEN
.
85
6.4
SPEKTROSKOPISCHE
EIGENSCHAFTEN
VON
FIS
UND
DNA
.
86
6.5
BINDUNGSKONSTANTEN
DES
FIS99W-DNA-KOMPLEXES
.
.
88
6.6
BINDUNGSKONSTANTEN
DES
FIS83W-DNA-KOMPLEXES
.
92
6.7
DISKUSSION
.
94
7
KOKRISTALLISATIONSSTUDIEN
97
7.1
LAENGE
UND
SEQUENZ
DER
EINGESETZTEN
DNA
.
97
7.2
VERSUCHSREIHE
FUER
DIE
REKRISTALLISATION
.
99
7.3
KOKRISTALLISATIONSANSAETZE
.
101
7.4
DISKUSSION
.
102
8
AUSBLICK
104
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
106
LITERATUR
107 |
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