Genetische Identifizierung von Fischökotypen:
Gespeichert in:
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| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
1996
|
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| Beschreibung: | München, Techn. Univ., Diss., 1996. - Untersuchung an Fischpopulationen in Main und Donau |
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INHALTSVERZEICHNIS
1
INHALTSVERZEICHNIS
1.
EINLEITUNG
.
1
2.
LITERATURUEBERSICHT
.
2
2.1.
GENETIK
DER
FISCHE
.
2
2.1.1.
DAS
GENOM
DER
FISCHE
DER
FAMILIE
CYPRINIDAE
2
2.1.2.
BEKANNTE
DNA-SEQUENZEN
BEI
DEN
CYPRINIDEN
.
3
2.1.2.1.
ALLGEMEINER
UEBERBLICK
.
3
2.1.2.2.
AUFBAU
DER
MITOCHONDRIALEN
DNA
.
3
2.1.2.3.
DAS
WACHSTUMSHORMONGEN
DER
CYPRINIDAE
.
5
2.1.3.
GENKARTIERUNG
BEI
FISCHEN
.
6
2.1.4.
UMWELTBEDINGTE
VORAUSSETZUNGEN
FUER
DIE
GE
NETISCHE
ENTWICKLUNG
DER
FISCHPOPULATIONEN
IN
MAIN UND
DONAU
.
7
2.2.
METHODEN
ZUR
DARSTELLUNG
GENETISCHER
POLY
MORPHISMEN
BEI
FISCHEN
8
2.2.1.
ALLOZYMANALYSE
.
8
2.2.2.
MITOCHONDRIALE
DNA
.
10
2.2.3.
NUKLEAERE
DNA
.
15
2.2.3.1.
DNA-FINGERPRINTING
.
.
.
15
2.2.3.2.
MIKROSATELLITEN
.
17
2.2.3.3.
RAPD
.
19
2.2.3.4.
DCP
(DNA
CONFORMATIONAL
POLYMORPHISM)
ANA
LYSEMETHODEN
24
2.2.3.4.1.
HETERODUPLEXANALYSE
.
24
2.2.3.4.2.
SSCP
(SINGLE
STRAND
CONFORMATION
POLYMOR
PHISM)
27
3.
MATERIAL
UND
METHODEN
.
30
3.1.
MATERIAL
.
30
3.1.1.
GERAETE
.
30
3.1.2.
VERBRAUCHSMATERIAL
.
31
3.1.3.
LOESUNGEN
.
35
3.1.4.
PRIMER
.
36
3.1.5.
FISCHE
.
38
3.2.
METHODEN
.
41
3.2.1.
PRAEPARATION
VON
DNA
AUS
MUSKELGEWEBE
.
41
INHALTSVERZEICHNIS
3.2.2.
RAPD-FINGERPRINTING
.
42
3.2.3.
RAMPO-FINGERPRINTING
.
42
3.2.3.1.
SOUTHERN
TRANSFER
.
42
3.2.3.2.
HYBRIDISIERUNG
MIT
EINER
(CA)
10
-SONDE
.
42
3.2.3.3.
DETEKTION
DER
POSITIVEN
FRAGMENTE
AUF
DER
MEMBRAN
.
43
3.2.4.
VORGANGSWEISE
BEI
DER
MARKERSUCHE
MIT
RAPD
UND
RAMPO
.
44
3.2.5.
NACHWEISMETHODEN
FUER
POLYMORPHISMEN
IN
DE
FINIERTEN
DNA-SEQUENZABSCHNITTEN
.
45
3.2.5.1.
PUNKTMUTATION
IM
INTRON
IV
DES
WACHSTUMS
HORMONGENES
DER
LAUBE
.
45
3.2.5.2.
PUNKTMUTATION
IN
EINER
RAPD-SEQUENZ
VON
PRIMER
RAPD19
BEI
DER
LAUBE
.
46
3.2.5.3. POLYMORPHISMEN,
DIE
AUFGRUND
DER
SEQUENZIE
RUNG
EINES
FRAGMENTES
DES
PRIMERS
RAPD21
GEFUNDEN
WURDEN
.
47
3.2.5.3.1.
NACHWEIS
EINER
DELETION
BEI
DER
BRACHSE
.
.
47
3.2.5.3.2.
POLYMORPHISMUS
AN
EINEM
WEITEREN
LOCUS
BEI
DER
AMPLIFIKATION
MIT
DEN
PRIMERN
PERLSATL
UND
PERLSAT2
BEI
DER
BRACHSE
.
48
3.2.5.4.
HETERODUPLEXANALYSE
DES
INTRONS
IV
DES
WACHSTUMSHORMONGENES
DER
BRACHSE
.
48
3.2.5.5.
POLYMORPHISMENSUCHE
MIT
DER
SSCP-METHODE
(SINGLE
STRAND
CONFORMATION
POLYMORPHISM)
.
49
3.2.5.6.
VERWENDUNG
VON
MIKROSATELLITEN-PRIMERN
AN
DERER
ARTEN
.
50
3.2.6.
KLONIERUNG
VON
RAPD-FRAGMENTEN
.
50
3.2.6.1.
BESCHREIBUNG
DER
VORGEHENSWEISE
.
50
3.2.6.2.
KLONIERUNG
EINES
RAPD-FRAGMENTES
DES
PRI
MERS
RAPD
19
VON
LAUBEN-DNA
.
52
3.2.6.3.
KLONIERUNG
EINES
RAPD-FRAGMENTES
DES
PRI
MERS
RAPD21
VON
PERLFISCH-DNA
.
56
3.2.7.
SEQUENZIERUNG
VON
PLASMIDEN
.
.
57
3.2.7.1.
SEQUENZIERUNG
MIT
5
'[
35
S]-MARKIERTEM
DATP
.
57
3.2.7.2.
SEQUENZIERUNG
MIT
SEQUENZIERAUTOMATEN
.
58
3.2.8.
SEQUENZIERUNG
VON
PCR-PRODUKTEN
.
59
INHALTSVERZEICHNIS
III
3.2.9.
SILBERFAERBUNG
.
60
3.2.10.
STATISTISCHE AUSWERTUNG
.
60
3.2.10.1.
BERECHNUNG
VON
ALLELFREQUENZEN
AUS
BANDEN
FREQUENZEN
VON
RAPD-FRAGMENTEN
.
60
3.2.10.1.1.
DIE
METHODE
NACH
NEI
UND
TAKEZAKI
(1994)
.
.
60
3.2.10.1.2.
DIE
METHODE
NACH
LYNCH
UND
MILLIGAN
(1994)
.
61
3.2.10.2.
ERMITTLUNG
DER
ALLELFREQUENZEN
UND
DER
VA
RIANZ
DER
ALLEIFREQUENZEN
VON
CODOMINANTEN
MARKERN
.
61
3.2.10.3.
TEST
AUF
UNTERSCHIEDLICHE
ALLELFREQUENZEN
IN
ZWEI
POPULATIONEN
NACH
NEI
(1987)
.
62
3.2.10.4.
TEST
AUF
ABWEICHUNG
VOM
HARDY-WEINBERG
GLEICHGEWICHT
.
62
3.2.10.4.1.
X
2
-TEST
.
62
3.2.10.4.2.
EXAKT-TEST
.
63
3.2.10.5.
SCHAETZUNG
DER
GENETISCHEN
DISTANZ
UND
KON
STRUKTION
PHYLOGENETISCHER
BAEUME
.
64
3.2.10.6.
BERECHNUNG
DES
ZEITPUNKTES
DER
TRENNUNG
ZWEIER
ARTEN
.
64
4.
ERGEBNISSE
.
65
4.1.
MARKERGEWINNUNG
.
65
4.1.1.
MARKERGEWINNUNG
DURCH
RAPD
(RANDOM
AMPLI
FIED
POLYMORPHIC
DNA)
.
65
4.1.2.
MARKERGEWINNUNG
MITTELS
RAMPO
(RANDOM
AM
PLIFIED
MICROSATELLITE
POLYMORPHISM)
.
73
4.1.3.
MARKERDEFINITION
DURCH
DIE
SEQUENZIERUNG
VON
RAPD-FRAGMENTEN
.
76
4.1.3.1.
SEQUENZIERUNG
DES
GLEICHEN
RAPD-FRAGMENTES
VON
VERSCHIEDENEN
INDIVIDUEN
.
76
4.1.3.2.
KONSTRUKTION
EINES
MIKROSATELLITEN
AUS
EI
NEM
RAPD-FRAGMENT
.
80
4.1.4.
SEQUENZIERUNG
EINES
TEILES
DES
CYTOCHROM
B
GENES
.
84
4.1.5.
ERGEBNISSE
DER
SSCP-ANALYSE
VON
PCR
PRODUKTEN
.
85
4.1.6.
ANWENDUNG
VON
MIKROSATELLITENPRIMERN
ANDE
RER
ARTEN
BEI
LAUBE,
BRACHSE,
AITEL
ODER
IV
INHALTSVERZEICHNIS
PERLFISCH
.
86
4.1.7.
ZUSAMMENSTELLUNG
DER
POLYMORPHEN
MARKER
FUER
LEUCISCINAE
.
86
4.2.
ANWENDUNG
MOLEKULARGENETISCHER
MARKER
ZUR
DIFFERENZIERUNG
VON
FISCHPOPULATIONEN
.
88
4.2.1.
MOLEKULARGENETISCHE
MARKER
FUER
DIE
LAUBE
ZUR
CHARAKTERISIERUNG
VERSCHIEDENER
POPULA
TIONEN
AUS
MAIN UND
DONAU
.
88
4.2.1.1.
FREQUENZEN
DER
MARKERVARIANTEN
.
88
4.2.1.2.
STATISTISCHE
AUSWERTUNG
.
90
4.2.1.2.1.
SCHAETZUNG
DER
ALLEIFREQUENZEN
.
90
4.2.1.2.2.
HARDY-WEINBERG-GLEICHGEWICHT
.
93
4.2.1.2.3.
UNTERSCHIEDE
ZWISCHEN
DEN
POPULATIONEN
.
94
4.2.1.2.4.
GENETISCHE
DISTANZEN
UND
PHYLOGENIE
.
96
4.2.2.
MOLEKULARGENETISCHE
MARKER
IN
BRACHSEN
AUS
MAIN
UND
DONAU
.
97
4.2.2.1.
ERGEBNISSE
DER
FREQUENZBESTIMMUNG
.
97
4.2.2.2.
STATISTISCHE
AUSWERTUNG
.
99
4.2.2.2.1.
SCHAETZUNG
DER
ALLELFREQUENZEN
.
99
4.2.2.2.2.
HARDY-WEINBERG-GLEICHGEWICHT
.
100
4.2.2.2.3.
UNTERSCHIEDE
ZWISCHEN
DEN
POPULATIONEN
.
.
101
4.2.2.2.4.
GENETISCHE
DISTANZEN
UND
PHYLOGENIE
.
.
.
103
4.3.
MODELL
ZUR
ZUWEISUNG
EINZELNER
FISCHE
ODER
KLEINER
STICHPROBEN
ZU
BESTIMMTEN
FISCH
POPULATIONEN
.
104
4.4.
DARSTELLUNG
DER
VERWANDTSCHAFTSBEZIEHUNGEN
ZWISCHEN
DEN
UNTERSUCHTEN
FISCHARTEN
AUF
GRUND
VON
DNA-SEQUENZEN
.
109
5.
DISKUSSION
.
116
5.1.
MARKERGEWINNUNG
.
116
5.1.1.
RAPD-MARKER
.
116
5.1.2.
RAMPO-MARKER
.
117
5.1.3.
SEQUENZIERUNG
VON
RAPD-FRAGMENTEN
.
118
5.1.4.
UNTERSUCHUNG
DES
CYTOCHROM
B-GENES
.
121
5.1.5.
VERWENDUNG
VON
MIKROSATELLITENPRIMERN
ANDE
RER
ARTEN
.
121
5.2.
VERGLEICHENDE
BEURTEILUNG
GENETISCHER
ME
INHALTSVERZEICHNIS
V
THODEN
.
123
5.2.1.
ISOZYMANALYSE
.
123
5.2.2.
RFLP-ANALYSE
VON
MTDNA
.
124
5.2.3.
MULTILOCUS
FINGERPRINTING
.
125
5.2.4.
MIKROSATELLITEN
.
126
5.2.5.
RAPD
.
127
5.2.6.
SEQUENZIERUNG
.
128
5.3.
DIFFERENZIERUNG
VON
LAUBEN
UND
BRACHSEN
AUS
VERSCHIEDENEN
MAIN
UND
DONAUPOPULATIONEN
128
5.3.1.
LAUBEN
.
128
5.3.2.
BRACHSEN
.
130
5.4.
ZUWEISUNG
VON
FISCHEN
ZU
BESTIMMTEN
FISCH
POPULATIONEN
132
6.
ZUSAMMENFASSUNG
.
134
7.
ABKUERZUNGEN
.
137
8.
LITERATURVERZEICHNIS
.
138 |
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