Röntgenstrukturanalyse von Coagulogen aus Japanischem Pfeilschwanzkrebs Tachypleus tridentatus: Röntgenstrukturanalyse von synthetischen Thrombininhibitoren im Komplex mit Thrombin
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1996
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INHALTSVERZEICHNIS
5
INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS
5
THBELLENVERZEICHNIS
8
ABBILDUNGSVERZEICHNIS
9
1
ZUSAMMENFASSUNG
11
1.1
VORBEMERKUNG
.
11
1.2
STRUKTUR
UND
FUNKTION
DES
COAGULOGENS
.
11
1.3
THROMBININHIBITOREN
.
13
1.4
VEROEFFENTLICHUNGEN
.
13
2
BIOLOGIE
UND
BIOCHEMIE
DES
PFEILSCHWANZKREBSES
14
2.1
KLASSIFIZIERUNG
.
14
2.2
DAS
HAEMOLYMPHGERINNUNGSSYSTEM
UND
SEINE
FUNKTION
.
16
2.2.1
DIE
HAEMOLYMPHE
UND
DIE
HAEMOZYTEN
.
16
2.2.2
LIMULUSIMMUNREAKTION
.
17
2.2.3
DAS
LIMULUS
GERINNUNGSYSTEM
.
17
2.2.4
LIMULUSTEST
.
19
2.2.5
COAGULOGEN
.
19
2.2.6
PARALLELITAET
ZU
GERINNUNGSSYSTEMEN
ANDERER
TIERE
.
20
3
ROENTGENSTRUKTURANALYSE
VON
COAGULOGEN
24
3.1
VORBEMERKUNG
.
24
3.2
PHYSIKALISCHE
GRUNDPRINZIPIEN
DER
KRISTALLOGRAPHIE
.
24
3.2.1
STREUUNG
VON
ELEKTROMAGNETISCHER
STRAHLUNG
DURCH
ELEKTRONEN
.
24
3.2.2
REZIPROKES
GITTER
UND
EWALDKONSTRUKTION
.
26
3.2.3
DIE
FOURIERTRANSFORMATION
UND
DAS
PHASENPROBLEM
.
26
6
INHAL
TSVERZEICHNIS
3.3
KRISTALLISATION
.
29
3.4
DATENSAMMLUNG
.
31
3.5
DATENPROZESSIERUNG
.
32
3.5.1
ALLGEMEINES
.
32
3.5.2
INDIZIERUNG
DER
DATEN,
BESTIMMUNG
VON
ZELLPARAMETERN
UND
SYM
METRIE
.
34
3.5.3
INTEGRATION
DER
DATEN
UND
VERFEINERUNG
.
35
3.5.4
DATENREDUKTION
.
35
3.6
LOESUNG
DES
PHASENPROBLEMS
.
36
3.6.1
ISOMORPHER
ERSATZ
.
36
3.6.2
HARKERKONSTRUKTION
.
37
3.6.3
PATTERSON
UND
DIFFERENZPATTERSONFUNKTION
.
38
3.6.4
VEKTORVERIFIZIERUNG
.
39
3.6.5
DIFFERENZFOURIERSYNTHESE
.
39
3.6.6
ANOMALE
PHASIERUNG
.
41
3.6.7
PHASIERUNG
DER
COAGULOGENDATEN
.
42
3.6.8
PHASENVERBESSERUNG
.
43
3.6.9
MODELLBAU
.
47
3.6.10
AUSNUTZUNG
DES
DIMERCHARAKTERS
DES
COAGULOGENS
.
47
3.6.11
PHASENKOMBINATION
MIT
MODELLPHASEN
.
49
3.6.12
VERFEINERUNG
.
51
3.7
VALIDIERUNG
DER
STRUKTUR
.
52
3.8
ANALYSE
DER
STRUKTUR
.
53
4
ERGEBNISSE
UND
DISKUSSION
55
4.1
STRUKTURBESCHREIBUNG
.
55
4.2
SELBSTAGGREGATION
VON
COAGULOGEN
.
61
4.3
ELEKTRONENMIKROSKOPIE
.
64
INHALTSVERZEICHNIS
7
4.3.1
PRAEPARATION
.
64
4.3.2
EM-MESSUNGEN
.
64
4.3.3
RESULTATE
.
65
4.4
STRUKTURVERGLEICH
VON
COAGULOGEN
MIT
ANDEREN
PROTEINEN
.
67
4.4.1
COAGULOGEN
UND
NGF
.
67
4.4.2
CYSTINKNOTEN
UND
CYSTINKNOTEN-SUPERFAMILIE
.
71
4.4.3
DIMERISIERUNG
VON
CYSTINKNOTEN-PROTEINEN
UND
COAGULOGEN
.
.
76
4.5
COAGULOGEN
UND
SPAETZLE
.
78
4.5.1
BILDUNG
DER
DORSAL-VENTRAL-ACHSE
IN
DROSOPHILA
.
78
4.5.2
STRUKTURELLE
RELEVANZ
.
79
5
THROMBIN-INHIBITOR-KOMPLEXE
82
5.1
EINLEITUNG
.
82
5.1.1
THROMBIN
UND
DIE
GERINNUNGSKASKADE
.
82
5.1.2
DAS
KATALYTISCHE
ZENTRUM
DES
THROMBINS
.
83
5.1.3
THROMBININHIBITOREN
.
85
5.2
D
UND
L-NAPAMP
.
88
5.3
STRUKTUR
DES
L-NAPAMP-THROMBINKOMPLEXES
.
88
5.3.1
STRUKTURLOESUNG
.
88
5.3.2
STRUKTURBESCHREIBUNG
.
90
5.3.3
DISKUSSION
.
92
5.4
STRUKTUR
DES
D-NAPAMP-THROMBINKOMPLEXES
.
94
6
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
96
LITERATURVERZEICHNIS
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