Eindimensionale Oligonucleotid-Bibliotheken für medizinisch-diagnostische Anwendungen:
Gespeichert in:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
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1996
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INHALTSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG
7
2
THEORIE
11
2.1
N
UCLEINSAEUREN
11
2.1.1
NUCLEOTIDE
UND
NUCLEOSIDE
11
2
1.2
STRUKTUR
DER
NUCLEINSAEUREN
14
2.1.2.1
PRIMAERSTRUKTUR
DER
NUCLEINSAEUREN
14
2.1.2.2
SEKUNDAERSTRUKTUR
DER
NUCLEINSAEUREN
15
2.1.2.3
TERTIAER
UND
QUARTAERSTRUKTUR
DER
NUCLEINSAEUREN
18
2.1.3
KONFORMATIONSUMWANDLUNG
18
2.1.3.1
NICHTKOOPERATIVE
UMWANDLUNG
19
2.1.3.2
KOOPERATIVE
UMWANDLUNG
20
2.
1
4
NUCLEINSAEUREN
IN
IONISCHEN
LOESUNGEN
23
2.1.4.1
DEBYE-HUECKEL-THEORIE
23
2.1.4.2
SCHMELZTEMPERATUR
DER
DNA
26
2.1.5
DIE
AUSBILDUNG
DER
DOPPELHELIKALEN
STRUKTUR
28
2.2
D
IE
CHEMISCHE
S
YNTHESE
VON
N
UCLEINSAEUREN
30
2.2.1
TRAEGERMATERIALIEN
FIIR
DIE
OLIGONUCLEOTIDSYNTHESE
31
2.2.2
SCHUTZGRUPPENSTRATEGIE
32
2.2.3
PHOSPHORYLIERUNGSREAGENZ
33
2.2.4
SYNTHESEZYKLEN
33
2.2.4.1
DIE
PHOSPHODIESTERMETHODE
34
2.2.4.2
DIE
PHOSPHOTRIESTERMETHODE
35
2.2.4.3
DIE
PHOSPHITTRIESTERMETHODE
(PHOSPHORIGSAEUREESTERAMIDMETHODE)
36
2.2.4.4
H-PHOSPHONATMETHODE
37
2.3
O
LIGONUCLEOTID
-B
IBLIOTHEKEN
39
2.3.1
DEFINITION
EINER
OLIGONUCLEOTID-BIBLIOTHEK
39
2.3.2
ANORDNUNG
DER
ELEMENTE
IM
RAUM
(DAS
ARRAY)
40
2.3.3
KLASSIFIZIERUNG
NACH
VOLLSTAENDIGKEIT
40
2.3.4
MOEGLICHE
ANWENDUNGEN
VON
OLIGONUCLEOTID-BIBLIOTHEKEN
42
2.3.4.1
SEQUENCING
BY
HYBRIDIZATION
(SBH)
42
2.3.4.2
WIRKSTOFFENTWICKLUNG
42
2.3.4.3
REVERSED-DOT-BLOT
43
2.3.4.4
STRUKTURERKENNUNG
(EPITOP-MAPPING)
43
2.3.4.5
PRIMER
FIIR
PCR
UND
SEQUENZIERUNG
43
3
AUFGABENSTELLUNG
45
2
4
ERGEBNISSE
48
4.1
P
OLYPROPYLEN
-F
UNKTIONALISIERUNG
48
4.2
R
EAKTIONSKAMMER
FUER
DIE
DNA-S
YNTHESE
55
4.2.1
SYNTHESE
DER
OLIGONUCLEOTIDE
AUF
POLYPROPYLEN
UND
HYBRIDISIERUNGSVERSUCHE
MIT
DEN
FILMEN
59
4.3
E
INE
EINDIMENSIONALE
O
LIGONUCLEOTID
-B
IBLIOTHEK
MIT
UEBERLAPPENDEN
SEQUENZEN
65
4.3.1
SYNTHESEPRINZIP
FUER
DIE
BIBLIOTHEK
65
4.3.2
SYNTHESEMODUL
FUER
SEQUENZUEBERLAPPENDE
OLIGONUCLEOTIDE
66
4.3.2.1
KONSTRUKTIONSZEICHNUNG
68
4.3.2.2
FUNKTIONSWEISE
DES
SYNTHESEMODULS
70
4.3.3
EXPERIMENTE
MIT
DEM
SYNTHESEMODUL
74
4.3.3.1
ERZEUGEN
EINES
PENTADECAMERS
UND
SEINER
VERKUERZTEN
HOMOLOGEN
75
4.3.3.2
AUFLINDEN EINER
MUTATION
IM
P53
GEN
76
4.3.3.3
SYNTHESE
EINER
ALTERNIERENDEN
CT-SEQUENZ,
UM
BINDUNGSEIGENSCHAFTEN
ZU
UNTERSUCHEN
84
4.3.3.4
SYNTHESE
EINES
200-MERS
(T200)
IN
DEM
SYNTHESEMODUL
88
5
DISKUSSION
91
5.1
T
RAEGERMATERIAL
UND
N
UCLEOTIDBELADUNG
91
5.2
K
OPPLUNGSAUSBEUTEN
92
5.3
U
NTERSUCHUNG
DES
V
ERHALTENS
DER
B
IBLIOTHEK
92
5.4
V
ERWENDUNG
DER
B
IBLIOTHEKEN
IN
DER
D
IAGNOSTIK
94
5.5
W
EITERE
A
NWENDUNGSGEBIETE
94
5.6
G
EGENUEBERSTELLUNG
EINDIMENSIONAL
/
ZWEIDIMENSIONAL
95
6
DURCHFUEHRUNG
DER
EXPERIMENTE
97
6.1
V
ERWENDETE
G
ERAETE
UND
M
ATERIALIEN
97
6.2
V
ERWENDETE
C
HEMIKALIEN
UND
L
OESUNGEN
98
6.2.
1
BEZUGSQUELLEN
98
6.2.2
PUFFERLOESUNGEN
99
6.3
P
OLYPROPYLEN
-F
UNKTTONALISIERUNG
101
6.3.1
BESTIMMUNG
DER
BELADUNGSDICHTE
101
6.3.2
PROGRAMMIERTE
ROUTINEN
DER
SYNTHESEAUTOMATEN
103
6.3.3
ROUTINE
FUER
DEN
ABI
SYNTHESIZER
103
6.3.4
ROUTINEN
FUER
DEN
ECOSYN
D300
104
6.4
E
XPERIMENTELLE
A
NGABEN
ZU
DEN
H
YBRIDISIERUNGSVERSUCHEN
UND
S
YNTHESEN
HO
6.4.1
HYBRIDISIERUNGSVERSUCHE
110
6.4.2
SYNTHESE
DES
T
2
OO
OLIGONUCLEOTIDS
112
7
ZUSAMMENFASSUNG
113
7.1
A
USGANGSPUNKT
113
7.2
Z
IELSETZUNG
113
7.3
R
ESULTATE
113
7.3.1
FUNKTIONALISIERUNG
DES
TRAEGERS
113
7
3.2
SYNTHESEKAMMERN
114
7.3.3
EINDIMENSIONALE
OLIGONUCLEOTID-BIBLIOTHEKEN
114
7.3.4
SYNTHESE
EINES
T200
OLIGONUCLEOTIDS
115
8
LITERATUR
117
DANK
125
LEBENSLAUF
127 |
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