Allgemein transduzierende Bakteriophagen bei Salmonella typhimurium: Häufigkeit ihres Vorkommens in Naturisolaten und ihre verwandtschaftlichen Beziehungen
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
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1995
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INHALTSVERZEICHNIS
1.
ABKUERZUNGEN
1
2.
EINLEITUNG
3
2.1
DIE
ENTDECKUNG
DER
BAKTERIOPHAGEN
3
2.2
HORIZONTALER
GENTRANSFER
4
2.2.1
TRANSFORMATION
5
2.2.2
KONJUGATION
8
2.2.2.1
KONJUGATIONSSYSTEME
GRAM-NEGATIVER
BAKTERIEN
8
22.2.2
KONJUGATIONSSYSTEME
GRAM-POSITIVER
BAKTERIEN
9
2.2.2.3
POTENTIAL
KONJUGATIVER
SYSTEME
TO
2.2.3
T
RANSDUKTION
11
2.2.3.2
ALLGEMEINE
T
RANSDUKTION
13
2.3
CHARAKTERISIERUNG
VON
BAKTERIOPHAGEN
15
2.3.1
VIRUSTAXONOMIE
15
2.3.2
DIE
FAMILIE
DER
LAMBDOIDEN
16
2.3.3
DIE
THEORIE
DER
MODULAREN
EVOLUTION
17
2.3.4
DIE
PHAGEN
X,
P22
UND
ES1
8
18
2.3.5
ZIELSETZUNG
DER
ARBEIT
22
3.
MATERIAL
UND
METHODEN
25
3.1
MATERIAL
25
3.1.1
BAKTERIENSTAEMME
25
3.1.1.1
ESCHERICHIA
COLI
UND
SALMONELLA
TYPHLMURIUM
25
3.1.1.2
SALMONELLA
(NATU
RISOLATE)
26
3.1.2
BAKTERIOPHAGEN
28
3.1.3
VEKTOREN
28
3.1.4
IN
DIESER
ARBEIT
ENTSTANDENE
UND
VERWENDETE
PLASMIDE
29
3.1.5
NUKLEOTIDSEQUENZ
VERWENDETER
OLIGONUKLEOTIDE
31
3.1.6
ENZYME
UND
CHEMIKALIEN
31
3.1.6.1
ENZYME
31
3.1.6.2
CHEMIKALIEN
31
3.1.7
SONSTIGES
33
3.1.8
MEDIEN
UND
LOESUNGEN
33
3.1.8.1
MEDIEN
33
3.1.8.2
ANTIBIOTIKA
34
3.1.8.3
PUFF
ER
UND
LOESUNGEN
34
INHALTSVERZEICHNIS
3.2
METHODEN
38
3.2.1
TEST
AUF
PHAGENFREISETZUNG
38
3.2.1.1
EINZELPLAQUE-ISOLIERUNG
38
3.2.2
PHAGENVERMEHRUNG
38
3.2.2.1
FLUESSIGLYSATE
39
3.2.2.2
PLATTENLYSATE
39
3.2.3
TITERBESTIMMUNG
40
3.2.4
KONZENTRIERUNG
UND
REINIGUNG
VON
PHAGEN
40
3.2.4.1
ULTRAZENTRIFUGATION
40
3.2.4.2
CSCI-DICHTEGRADIENTENZENTRIFUGATION
40
3.2.5
ISOLIERUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
41
3.2.5.1
ISOLIERUNG
VON
PHAGEN-DNA
41
3.2.5.2
PLASMIDPRAEPARATION
NACH
KIESER
(1984)
41
3.2.5.3
PRAEPARATION
VON
PLASMID-DNA
UEBER
CSCI-GRADIENTEN
42
3.2.6
TRANSDUKTION
42
3.2.6.1
TRANSDUKTION
CHROMOSOMALER
MARKER
42
3.2.6.2
PLASMIDTRANSDUKTION
43
3.2.6.3
SPRUEHTEST
NACH
SCHMIEGER
(1971)
43
3.2.7
TRANSFORMATION
VON
BAKTERIEN
44
3.2.7.1
TRANSFONNATION
VON
ESCHERICHIA
COLI
44
3.2.7.2
TRANSFORMATION
VON
SALMONELLA
44
3.2.7.2.1
ELEKTROPORATION
44
3.2.8
GELELEKTROPHORESE
VON
NUKLEINSAEUREN
44
3.2.8.1
AGAROSE-GELELEKTROPHORESE
44
3.2.8.2
POLYACRYLAMID-GELELEKTROPHORESE
45
3.2.9
DNA-SEQUENZIERUNG
45
3.2.9.1
GERICHTETER
ABBAU
VON
DNA
MIT
EXONUKLEASE
III
45
3.2.9.2
SEQUENZIEREN
VON
DNA
46
3.2.10
ISOLIERUNG
VON
DNA-FRAGMENTEN
AUS
AGAROSE-GELEN
46
3.2.10.1
ISOLIERUNG
MIT
FLUESSIGSTICKSTOFF
NACH
TAUTZ
UND
RENZ
(1983)
46
3.2.10.2
ISOLIERUNG
MIT
SS-AGARASE
47
3.2.10.3
ISOLIERUNG
AUS
LMP-AGAROSE
MIT
NACI-PHENOL
47
3.2.11
HYBRIDISIERUNGEN
47
3.2.11.1
SOUTHERN-TRANSFER
47
3.2.11.2
DOT
BLOT
48
3.2.11.3
HYBRIDISIERUNG
48
3.2.12
YYPOLYMERASE
CHAIN
REACTION
(PCR)
"
48
INHALTSVERZEICHNIS
4.
ERGEBNISSE
49
4.1
CHARAKTERISIERUNG
DER
SALMONELLA-ISOLATE
UND
IHRER
BAKTERIOPHAGEN
49
4.1.1
RESISTENZSPEKTRUM
49
4.1.2
FREISETZUNG
VON
BAKTERIOPHAGEN
51
4.1.3
WIRTSSPEKTRUM
DER
BAKTERIOPHAGEN
53
4.1.4
IMMUNITAET
54
4.1.5
ALLGEMEINE
TRANSDUKTION
58
4.1.5.1
TRANSDUKTION
CHROMOSOMALER
GENE
59
4.1.5.2
PLASMIDTRANSDUKTION
60
4.1.6
RESTRIKTIONSANALYSE
DER
PHAGEN-DNA
60
4.1.6.1
NACHWEIS
VON
COS-ENDEN
BEIM
PHAGEN
PS37B
65
4.1.7
UNTERSUCHUNGEN
DER
PHAGENGENOME
DURCH
HYBRIDISIERUNGSEXPERIMENTE
67
4.1.7.1
SONDEN
AUS
DEM
BEREICH
DER
LYSISGENE
69
4.1.7.2
SONDEN
AUS
DEM
BEREICH
DER
REPLIKATIONSGENE
71
4.1.7.3
SONDEN
AUS
DEM
IMMUNITAETSBEREICH
72
4.1.7.4
SONDEN
AUS
DEM
BEREICH
DER
STRUKTURGENE
74
4.1.7.5
ZUSAMMENFASSENDE
DARSTELLUNG
DER
HYBRIDISIERUNGSDATEN
75
4.2
CHARAKTERISIERUNG
DES
PHAGEN
ES1
8
77
4.2.1
RESTRIKTIONSKARTIERUNG
77
4.2.2
LYSISGENE
82
4.2.3
REPLIKATIONSGENE
85
4.3
UNTERSUCHUNGEN
ZUR
MODULTHEORIE
89
4.3.1
ISOLIERUNG
VON
REVERTIERTEN
AMBER-PHAGEN
91
4.3.2
CHARAKTERISIERUNG
DES
STROMABWAERTS
GELEGENEN
REKOMBINATIONSEREIGNISSES
93
4.3.3
CHARAKTERISIERUNG
DES
STROMAUFWAERTS
GELEGENEN
REKOMBINATIONSEREIGNISSES
98
5.
DISKUSSION
102
5.1
BEDEUTUNG
DER
ALLGEMEINEN
TRANSDUKTION
FUER
DEN
HORIZONTALEN
GENTRANSFER
102
5.2
CHARAKTERISIERUNG
DER
ISOLIERTEN
SALMONELLA-PHAGEN
111
5.3
DIAGNOSTIK
MIT
HILFE
VON
BAKTERIOPHAGEN
120
5.4
CHARAKTERISIERUNG
DES
SALMONELLA-PHAGEN
ES18
122
5.5
DIE
MODULTHEORIE
AM
BEISPIEL
DER
LYSISGENE
131
6.
ZUSAMMENFASSUNG
135
7.
ANHANG
137
8.
LITERATUR
139 |
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