Neue Wege zu räumlichen Molekülmodellen:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
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1993
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INHALTSVERZEICHNIS
1.
COMPUTER-MODELLIERUNG
RAEUMLICHER
MOLEKUELSTRUKTUREN
1
1.1.
GENERIERUNG
VON
3D-STRUKTUREN
-
EIN
KLASSISCHES
PROBLEM
DER
COMPUTERCHEMIE?
1
1.2.
KONZEPTIONELLE
PROBLEME
BEI
DER
3D-STRUKTURGENERIERUNG
2
1.3.
ANFORDERUNGEN
AN
EINEN
3D-STRUKTURGENERATOR
6
1.4.
CORINA
-
AUTOMATISCHE
GENERIERUNG
VON
3D
ATOMKOORDINATEN
FUER
ORGANISCHE
MOLEKUELE
8
2.
UEBERSICHT
UEBER
BESTEHENDE
ALGORITHMEN
UND
PROGRAMME
9
2.1.
KLASSIFIZIERUNG
VON
KONZEPTEN
9
2.2.
REGELBASIERTE
METHODEN
11
2.3.
DATENBASIERTE
METHODEN
20
3.
PRINZIPIEN
DES
PROGRAMMS
CORINA
25
4.
GRUNDOPERATIONEN
27
4.1.
BINDUNGSLAENGEN
27
4.2.
KONJUGIERTE
SYSTEME
27
4.3.
ATOMTYPEN
UND
BINDUNGSWINKEL
31
4.4.
STEREODESKRIPTOREN
32
4.5.
RINGERKENNUNG
40
4.6.
FRAGMENTIERUNG
42
5.
KLEINE
RINGE
43
5.1.
ERZEUGUNG
FEHLENDER
STEREODESKRIPTOREN
AN
BRUECKENKOPFATOMEN
44
5.2.
RINGMUSTER
48
5.3.
KONFORMATIONSANALYSE
51
5.4.
KONFORMATIONS-HASHCODES
53
5.5.
BEWERTUNG
DER
KONFORMATIONEN
56
5.6.
VERGLEICH
MIT
KRISTALLSTRUKTUREN
58
6.
STARRE
MAKROCYCLEN:
SUPERSTRUKTURPRINZIP
65
6.1.
GRUNDIDEE
65
6.2.
PRINZIPIEN
DER
REDUKTION
66
6.3.
ERZEUGUNG
DER
DREIDIMENSIONALEN
SUPERSTRUKTUR
69
6.4.
AUFFUELLEN
DER
KETTEN
70
6.5.
EINPASSEN
VON
KLEINRINGSYSTEMEN
71
6.6.
PROGRAMMABLAUF
73
6.7.
ANWENDUNGSBEISPIELE
74
7.
FLEXIBLE
MAKROCYCLEN:
POLYGONMUSTER
ZUR
KONFORMATIONSANALYSE
77
7.1.
PARADOXE
ERGEBNISSE
MIT
DEM
SUPERSTRUKTURPRINZIP
77
7.2.
LINEAMOTATIONEN
ZUR
BESCHREIBUNG
VON
RINGKONFORMATIONEN
78
'
7.3.
TRANSFORMATION
ID
-
3D
80
7.4.
ENERGETISCHE
BEWERTUNG
DER
ID-NOTATIONEN
81
7.5.
VERGLEICH
MIT
ANDEREN
METHODEN
85
7.6.
ERWEITERUNG
AUF
VERBINDUNGEN
MIT
HETEROATOMEN
86
8.
PSEUDOKRAFTFELD
93
8.1.
POTENTIALE
93
8.2.
KRAFTKONSTANTEN.
99
8.3.
OPTIMIERUNGSVERFAHREN
100
8.4.
VERGLEICH
MIT
EINEM
HERKOEMMLICHEN
KRAFTFELD
101
9.
BEHANDLUNG
ACYCLISCHER
MOLEKUELTEILE
104
9.1.
PRINZIP
DER
LAENGSTEN
PFADE
104
9.2.
BEGRENZTE
KONFORMATIONSANALYSE
105
10.
VERGLEICH
MIT
ANDEREN
3D-STRUKTURGENERATOREN
UNTER
VERWENDUNG
EXPERIMENTELLER
STRUKTURDATEN
108
YY
10.1.
DATENSATZ
108
10.2.
BEWERTUNGSVERFAHREN
109
10.3.
PROGRAMMLAEUFE
111
10.4.
ERGEBNISSE
113
11.
GENETISCHE
ALGORITHMEN
ZUR
LOESUNG
NICHTLINEARER
OPTIMIERUNGSPROBLEME
121
11.1.
GENETISCHE
ALGORITHMEN
121
11.2.
ANPASSUNG
DES
PSEUDOKRAFTFELDES
AN
EIN
HERKOEMMLICHES
KRAFTFELD
126
11.3.
ANPASSUNG
DER
BINDUNGSLAENGEN
IN
KONJUGIERTEN
SYSTEMEN
AN
EXPERIMENTELLE
DATEN
131
12.
IMPLEMENTIERUNG
133
13.
MODELLIERUNG
VON
WIRT-GAST-KOMPLEXEN
134
13.1.
EINLEITUNG
134
13.2.
AUTOMATISCHE
VORHERSAGE
DER
WIRT-GAST-STRUKTUR
134
13.3.
KOMPLEXIERUNG
VON
ADAMANTAN
DURCH
EINEN
POLYMAKROCYCLUS
136
13.4.
MOLEKULARE
ERKENNUNG
DURCH
WASSERSTOFFBRUECKEN
137
13.5.
SCHLUSSFOLGERUNG
142
14.
ZUSAMMENFASSUNG
143
15.
REFERENZEN
145
ANHANG
-
151
A
BINDUNGSLAENGEN
151
B
HMO-PARAMETER
153
C
BINDUNGSWINKEL
155
D
KRISTALLSTRUKTURDATEN
156
E
DATENSATZ
VON
RINGSTRUKTUREN
ZUR
ENTWICKLUNG
DES
PSEUDOKRAFTFELDES
159 |
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