Molekulare Analysen von plastidären "Photosynthesegenen" bei Rotalgen: ein Beitrag zur Phylogenie der rezenten Plastiden
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MOLEKULARE ANALYSEN VON PLASTIDAEREN
PHOTOSYNTHESEGENEN BEI ROTALGEN
EIN BEITRAG ZUR PHYLOGENIE DER REZENTEN PIASTIDEN
INAUGURAL-DISSERTATION ZUR ERLANGUNG DES DOKTORGRADES DER
NATURWISSENSCHAFTEN (FACHBEREICH BIOLOGIE) DER JUSTUS LIEBIG UNIVERSITAET
VORGELEGT VON ANJA EMICH AUS JUGENHEIM GIESSEN 1993
IMAGE 2
INHALTSVERZEICHNIS:
SEITE
1. EINLEITUNG 1
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7
9 9 9 9
9 9
10 10 10 10 10
11 11 11 11
11 11 12 12
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13 13 14
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2. 2.1 2.2 2.2.1
2.2.2 2.3 2.4
2.4.1 2.4.2 2.5 2.5.1 2.5.1.1
2.5.1.2 2.5.1.3 2.5.1.4 2.5.2
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2.7.5 2.8 2.9 2.9.1
2.9.2 2.9.3 2.10 2.11
2.12 2.12.1 2.12.2
MATERIAL UND METHODEN ANZUCHT UND ERNTE DER ALGEN ISOLIERUNG VON
GESAMT-DNA ISOLIERUNG VON GESAMT-DNA AUS ANTITHAMNION SPEC. ISOLIERUNG
VON GESAMT-DNA AUS GALDIERIA SPEC.
CAESIUMCHLORID-DICHTEGRADIENTEN-ZENTRIFUGATION ISOLIERUNG VON GESAMT-RNA
ISOLIERUNG VON GESAMT-RNA AUS ANTITHAMNION SPEC. ISOLIERUNG VON
GESAMT-RNA AUS GALDIERIA SPEC.
GELELEKTROPHORESE DNA-GELE BIOZYM AGAROSE LOW MELTING POINT AGAROSE
(LMP)
NUSIEVE AGAROSE PULSE FIELD GELELEKTROPHORESE RNA-GELE
HYBRIDISIERUNGEN MARKIERUNG DER SONDEN SOUTHERN UND NORTHERN BLOT
HYBRIDISIERUNGSBEDINGUNGEN
WASCHBEDINGUNGEN DETEKTION KLONIERUNG PLASTIDAERER DNA
RESTRIKTIONSENZYMATISCHER VERDAU
VORBEREITUNG DES VEKTORS LIGATION DES VEKTORS HERSTELLUNG KOMPETENTER
E.COLI ZELLEN (STAMM JM 83)
TRANSFORMATION KARTIERUNG SUBKLONIERUNG RESTRIKTIONSENZYMATISCHER VERDAU
VON PLASMID-DNA
LIGATION EINES SUBKLONS TRANSFORMATION VON SUBKLONEN GERICHTETE
DELETIONSMUTANTEN MINIPRAEPARATION VON PLASMID DNA (NACH BIRNBOIM
UND DOLY, 1979) SEQUENZIEREN VORBEREITUNG DER PROBEN
SEQUENZIERUNGSREAKTION
IMAGE 3
2.13 POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE 15
2.14 SEQUENZAUSWERTUNG 16
2.15 HAEUFIG VERWENDETE LOESUNGEN UND ARBEITSSCHRITTE 16
2.16 ALLGEMEINE ABKUERZUNGEN 17
2.17 EIN- UND DREIBUCHSTABENKODE DER AMINOSAEUREN 18
2.18 BEZUGSQUELLEN 18
3. ERGEBNISSE 19
3.1 CAESIUMCHLORID-DICHTEGRADIENTEN-ZENTRIFUGATION 19
3.1.1 CSCL-DICHTEGRADIENTEN-ZENTRIFUGATION VON ANTI- 19
THAMNION GESAMT-DNA
3.1.2 CSCL-DICHTEGRADIENTEN-ZENTRIFUGATION VON GALDIERIA 20
GESAMT-DNA
3.2 RESTRIKTIONSVERDAU VON PLASTIDEN-DNA 21
3.2.1 RESTRIKTIONSVERDAU VON ANGEREICHERTER ANTI- 21
/AAFFIMON-PLASTIDEN-DNA
3.2.2 RESTRIKTIONSVERDAU VON ANGEREICHERTER GALDIERIA- 22
PLASTIDEN-DNA
3.2.3 PULSE-FIELD-GELELEKTROPHORESE MIT RESTRIKTIONSVER- 23
DAUS VON ANGEREICHERTER GOEWIERIA-PLASTIDEN-DNA 3.3 CHARAKTERISIERUNG
EINIGER BEREICHE AUF DEM PLASTI- 24
DENGENOM VON GALDIERIA UND ANTITHAMNION 3.3.1 DAS PSAA/PSAB OPERON BEI
GALDIERIA 24
3.3.2 DAS PSBB OPERON UND DIE ANGRENZENDEN BEREICHE BEI 35
GALDIERIA
3.3.3 DAS PSBB OPERON, DAS STR OPERON UND DIE ANGREN- 41
ZENDEN BEREICHE BEI ANTITHAMNION 3.3.4 DAS PETB/PETD OPERON BEI
GALDIERIA 60
3.4 TRANSKRIPTANALYSEN 67
4. DISKUSSION 73
5. ZUSAMMENFASSUNG 85
6. LITERATURVERZEICHNIS 86
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