Molekulare Charakterisierung des sraP-homologen Genclusters bei Koagulase-negativen Staphylokokken:
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Münster
[2021]
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|---|---|
| adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG
.....................................................................................................................
1
1.1
KOAGULASE-NEGATIVE
STAPHYLOKOKKEN:
HUMANPATHOGEN
ODER
HARMLOS
.........................
1
1.1.1
RELEVANTE
UNTERSUCHTE
VERTRETER
DER
KNS
.........................................................
2
1.1.2
KNS-INFEKTIONEN
UND
IHRE
PATHOGENESE.............................................................
4
1.2
BIOFILME
VON
KNS:
CHARAKTERISIERUNG
UND
BEDEUTUNG
..................................................
6
1.2.1
SCHRITTWEISE
BILDUNG
EINES
BAKTERIELLEN
BIOFILMS
.................................................
7
1.2.2
BIOFILM-ASSOZIIERTE
INFEKTIONEN
............................................................................
9
1.3
THROMBOZYTEN-BAKTERIEN-ASSOZIATION..........................................................................
9
1.4
SERIN-REICHE
REPEAT-PROTEINE
(SRRPS)
.....................................................................
11
1.4.1
FAMILIE
GLYKOSYLIERTER SERIN-REICHER
OBERFLAECHENPROTEINE
..................................
11
1.4.2
SRAP
-
SERINE-RICH
ADHESIN
FOR
PLATELETS
...........................................................
12
1.5
ZIELSETZUNG
UND
FRAGESTELLUNG
..................................................................................
14
2
MATERIAL
UND
METHODEN
..............................................................................................
16
2.1
MATERIAL
......................................................................................................................
16
2.1.1
CHEMIKALIEN
.....................................................................................................
17
2.1.2
ENZYME
UND
ANTIKOERPER
....................................................................................
18
2.1.3
MIKROORGANISMEN..............................................................................................
18
2.1.4 PRIMER
UND
SEQUENZIERUNGEN...........................................................................
19
2.1.5
KITS
...................................................................................................................
20
2.2
METHODEN
...................................................................................................................
21
2.2.1
ANZUCHT
UND
STAMMHALTUNG
DER
MIKROORGANISMEN
..........................................
21
2.2.2 ARBEITEN
MIT
DNA
.............................................................................................
21
2.2.3 ARBEITEN
MIT
PROTEINEN......................................................................................
24
2.2.4
BIOFILMASSAY
.....................................................................................................
26
2.2.5
THROMBOZYTEN-BAKTERIEN-ASSOZIATION...............................................................
27
2.2.6
COMPUTERBASIERTE
ANALYSE
...............................................................................
30
2.2.7
STATISTISCHE
ANALYSE
.........................................................................................
30
INHALTSVERZEICHNIS
2.2.8
ETHIKVOTUM
.......................................................................................................
31
3
ERGEBNISSE
.................................................................................................................
32
3.1
SEQUENZANALYSE
DER
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTER
....................................................
32
3.1.1
ALIGNMENTANALYSE
DER
SRAP-HOMOLOGEN
SEQUENZEN........................................
33
3.1.2
AUFTEILUNG
DES
OPERONS
FUER
DIE
PCR
UND
PRIMERKONSTRUKTION
..........................
34
3.2
PCR-SCREENING
AUF
DAS
SRAP-HOMOLOGE
GENCLUSTER
IN
KNS
......................................
35
3.2.1
PRAEVALENZ
DES
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTERS
IN
S.
EPIDERMIDIS........................
35
3.2.2
PRAEVALENZ
DES
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTERS
IN
S.
HAEMOLYTICUS
.....................
37
3.2.3
PRAEVALENZ
DES
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTERS
IN
S.
LUGDUNENSIS
.......................
39
3.3
SEQUENZANALYSE
DER
SRAP-HOMOLOGE
(S.
EPIDERMIDIS)..............................................
40
3.4
BIOFILMANALYSEN
VON
KOAGULASE-NEGATIVEN
BAKTERIENSTAEMMEN..................................
41
3.4.1
KORRELATION
DES
SRAP-HOMOLOGS
MIT
DER
BIOFILMBILDUNG
IN
S.
EPIDERMIDIS
........
42
3.4.2
KORRELATION
DES
SRAP-HOMOLOGS
MIT
DER
BIOFILMBILDUNG
IN
S.
HAEMOLYTICUS
......
45
3.5
THROMBOZYTEN-BAKTERIEN-BINDUNG
VON
S.
EPIDERMIDIS
...............................................
48
3.6
ANALYSE
GLYKOSYLIERTER
OBERFLAECHENPROTEINE
..............................................................
49
4
DISKUSSION
.................................................................................................................
51
4.1
SEQUENZVERGLEICH
DER
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTER...................................................
51
4.2
EPIDEMIOLOGIE
DES
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTERS
IN
KNS
..........................................
53
4.3 ANALYSE
DES
MODULAREN
AUFBAUS
DER
SRAP-HOMOLOGE
...............................................
55
4.4
SRAP-HOMOLOGE
IN
DER
BIOFILMBILDUNG
VON
KNS
.........................................................
58
4.4.1
KORRELATION
MIT
DER
BIOFILMPRODUKTION
IN
S.
EPIDERMIDIS
....................................
59
4.4.2
KORRELATION
MIT
DER
BIOFILMPRODUKTION
IN
S.
HAEMOLYTICUS
.................................
60
4.4.3
BERUECKSICHTIGUNG
WEITERER
EINFLUSSFAKTOREN
IN
DER
BIOFILMGENERATION
..............
61
4.5
SRAP-HOMOLOGE
BEI
DER
THROMBOZYTEN-BAKTERIEN-ASSOZIATION..................................
63
4.6 SRAP-HOMOLOGE
ALS
GLYKOPROTEINE
.............................................................................
64
4.7
LIMITATIONEN
UND
AUSBLICK
DER
ARBEIT
..........................................................................
66
5
ZUSAMMENFASSUNG
....................................................................................................
68
6
LITERATURVERZEICHNIS
....................................................................................................
70
7
DANKSAGUNG...............................................................................................................
78
INHALTSVERZEICHNIS
8
LEBENSLAUF
.................................................................................................................
79
9
ANHANG
.........................................................................................................................
I
9.1
UNTERSUCHTE
BAKTERIENISOLATE
AUS
DER
STAMMSAMMLUNG
...............................................
I
9.1.1
STAPHYLOCOCCUS
EPIDERMIDIS:
HAUT-
UND
KLINIKISOLATE
.......................................
I
9.1.2
STAPHYLOCOCCUS
HAEMOLYTICUS:
HAUT-
UND
KLINIKISOLATE
....................................
III
9.1.3
STAPHYLOCOCCUS
LUGDUNENSIS:
HAUT-
UND
KLINIKISOLATE
.......................................
IV
9.2
ALIGNMENTANALYSEN
DER
ABGELEITETEN
PROTEINSEQUENZEN
(JUSTBIO)
................................
V
9.3
ABBILDUNGEN
UND
TABELLEN
.......................................................................................
VIII
9.4
ETHIKVOTUM
..................................................................................................................
X
|
| adam_txt |
INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG
.
1
1.1
KOAGULASE-NEGATIVE
STAPHYLOKOKKEN:
HUMANPATHOGEN
ODER
HARMLOS
.
1
1.1.1
RELEVANTE
UNTERSUCHTE
VERTRETER
DER
KNS
.
2
1.1.2
KNS-INFEKTIONEN
UND
IHRE
PATHOGENESE.
4
1.2
BIOFILME
VON
KNS:
CHARAKTERISIERUNG
UND
BEDEUTUNG
.
6
1.2.1
SCHRITTWEISE
BILDUNG
EINES
BAKTERIELLEN
BIOFILMS
.
7
1.2.2
BIOFILM-ASSOZIIERTE
INFEKTIONEN
.
9
1.3
THROMBOZYTEN-BAKTERIEN-ASSOZIATION.
9
1.4
SERIN-REICHE
REPEAT-PROTEINE
(SRRPS)
.
11
1.4.1
FAMILIE
GLYKOSYLIERTER SERIN-REICHER
OBERFLAECHENPROTEINE
.
11
1.4.2
SRAP
-
SERINE-RICH
ADHESIN
FOR
PLATELETS
.
12
1.5
ZIELSETZUNG
UND
FRAGESTELLUNG
.
14
2
MATERIAL
UND
METHODEN
.
16
2.1
MATERIAL
.
16
2.1.1
CHEMIKALIEN
.
17
2.1.2
ENZYME
UND
ANTIKOERPER
.
18
2.1.3
MIKROORGANISMEN.
18
2.1.4 PRIMER
UND
SEQUENZIERUNGEN.
19
2.1.5
KITS
.
20
2.2
METHODEN
.
21
2.2.1
ANZUCHT
UND
STAMMHALTUNG
DER
MIKROORGANISMEN
.
21
2.2.2 ARBEITEN
MIT
DNA
.
21
2.2.3 ARBEITEN
MIT
PROTEINEN.
24
2.2.4
BIOFILMASSAY
.
26
2.2.5
THROMBOZYTEN-BAKTERIEN-ASSOZIATION.
27
2.2.6
COMPUTERBASIERTE
ANALYSE
.
30
2.2.7
STATISTISCHE
ANALYSE
.
30
INHALTSVERZEICHNIS
2.2.8
ETHIKVOTUM
.
31
3
ERGEBNISSE
.
32
3.1
SEQUENZANALYSE
DER
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTER
.
32
3.1.1
ALIGNMENTANALYSE
DER
SRAP-HOMOLOGEN
SEQUENZEN.
33
3.1.2
AUFTEILUNG
DES
OPERONS
FUER
DIE
PCR
UND
PRIMERKONSTRUKTION
.
34
3.2
PCR-SCREENING
AUF
DAS
SRAP-HOMOLOGE
GENCLUSTER
IN
KNS
.
35
3.2.1
PRAEVALENZ
DES
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTERS
IN
S.
EPIDERMIDIS.
35
3.2.2
PRAEVALENZ
DES
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTERS
IN
S.
HAEMOLYTICUS
.
37
3.2.3
PRAEVALENZ
DES
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTERS
IN
S.
LUGDUNENSIS
.
39
3.3
SEQUENZANALYSE
DER
SRAP-HOMOLOGE
(S.
EPIDERMIDIS).
40
3.4
BIOFILMANALYSEN
VON
KOAGULASE-NEGATIVEN
BAKTERIENSTAEMMEN.
41
3.4.1
KORRELATION
DES
SRAP-HOMOLOGS
MIT
DER
BIOFILMBILDUNG
IN
S.
EPIDERMIDIS
.
42
3.4.2
KORRELATION
DES
SRAP-HOMOLOGS
MIT
DER
BIOFILMBILDUNG
IN
S.
HAEMOLYTICUS
.
45
3.5
THROMBOZYTEN-BAKTERIEN-BINDUNG
VON
S.
EPIDERMIDIS
.
48
3.6
ANALYSE
GLYKOSYLIERTER
OBERFLAECHENPROTEINE
.
49
4
DISKUSSION
.
51
4.1
SEQUENZVERGLEICH
DER
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTER.
51
4.2
EPIDEMIOLOGIE
DES
SRAP-HOMOLOGEN
GENCLUSTERS
IN
KNS
.
53
4.3 ANALYSE
DES
MODULAREN
AUFBAUS
DER
SRAP-HOMOLOGE
.
55
4.4
SRAP-HOMOLOGE
IN
DER
BIOFILMBILDUNG
VON
KNS
.
58
4.4.1
KORRELATION
MIT
DER
BIOFILMPRODUKTION
IN
S.
EPIDERMIDIS
.
59
4.4.2
KORRELATION
MIT
DER
BIOFILMPRODUKTION
IN
S.
HAEMOLYTICUS
.
60
4.4.3
BERUECKSICHTIGUNG
WEITERER
EINFLUSSFAKTOREN
IN
DER
BIOFILMGENERATION
.
61
4.5
SRAP-HOMOLOGE
BEI
DER
THROMBOZYTEN-BAKTERIEN-ASSOZIATION.
63
4.6 SRAP-HOMOLOGE
ALS
GLYKOPROTEINE
.
64
4.7
LIMITATIONEN
UND
AUSBLICK
DER
ARBEIT
.
66
5
ZUSAMMENFASSUNG
.
68
6
LITERATURVERZEICHNIS
.
70
7
DANKSAGUNG.
78
INHALTSVERZEICHNIS
8
LEBENSLAUF
.
79
9
ANHANG
.
I
9.1
UNTERSUCHTE
BAKTERIENISOLATE
AUS
DER
STAMMSAMMLUNG
.
I
9.1.1
STAPHYLOCOCCUS
EPIDERMIDIS:
HAUT-
UND
KLINIKISOLATE
.
I
9.1.2
STAPHYLOCOCCUS
HAEMOLYTICUS:
HAUT-
UND
KLINIKISOLATE
.
III
9.1.3
STAPHYLOCOCCUS
LUGDUNENSIS:
HAUT-
UND
KLINIKISOLATE
.
IV
9.2
ALIGNMENTANALYSEN
DER
ABGELEITETEN
PROTEINSEQUENZEN
(JUSTBIO)
.
V
9.3
ABBILDUNGEN
UND
TABELLEN
.
VIII
9.4
ETHIKVOTUM
.
X |
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There is no print copy available.
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