Phänotypische und genotypische Charakterisierung von ESBL-/AmpC-β-Laktamase- und Carbapenemase-bildenden Escherichia coli- und Klebsiella spp.-Isolaten aus klinischem Untersuchungsgut von Haustieren:
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Gießen, Lahn
VVB Laufersweiler Verlag
2017
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|---|---|
| adam_text | INHALT
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS...................................................................................................III
I
EINLEITUNG................................................................................................................1
II
LITERATURUEBERSICHT..................................................................................................3
1.
SS-LAKTAM-ANTIBIOTIKA.............................................................................................
3
1.1 CEPHALOSPORINE UND CEPHAMYCINE
................................................................
3
1.2
CARBAPENEME.................................................................................................
4
2. MECHANISMEN DER RESISTENZ VON ENTEROBACTERIACEAE GEGENUEBER
SS-LAKTAM-ANTIBIOTIKA.....................................................................................................5
2.1 SS-LAKTAMASEN MIT SCHMALEM
WIRKSPEKTRUM..................................................6
2.2 EINTEILUNG DER
SS-LAKTAMASEN..........................................................................6
2.3 SS-LAKTAMASEN MIT ERWEITERTEM SUBSTRATSPEKTRUM
.........................................
6
3. PLASMIDTYPEN BEI CARBAPENEMASE-PRODUZIERENDEN ENTEROBACTERIACEAE.. 17
4. E. COLI UND KLEBSIELLA SPP.: HAEUFIGE ESBL-/AMPC-BILDNER
..........................
19
4.1 E. COLI: INFEKTIONSMEDIZINISCHE BEDEUTUNG UND EINTEILUNG IN
........................
PHYLOGENETISCHE GRUPPEN UND
PATHOTYPEN..................................................19
4.2 KLEBSIELLA SPP.: INFEKTIONSMEDIZINISCHE
BEDEUTUNG....................................23
5. MULTILOKUS-SEQUENZTYPEN ESBL-/AMPC- UND CARBAPENEMASE-BILDENDER
E. COLI- UND KLEBSIELLA
SPP.-LSOLATE...........................................................................
24
5.1 MULTILOKUS-SEQUENZTYPEN ESBL- UND CARBAPENEMASE-BILDENDER
E.
COLI-ISOLATE................................................................................................
24
5.2 MULTILOKUS-SEQUENZTYPEN ESBL- UND CARBAPENEMASE BILDENDER
K.
PNEUMONLAE- SO ATE.................................................................................
26
III MATERIAL UND
METHODEN.......................................................................................28
1.
MATERIAL.................................................................................................................
28
1.1 CHEMIKALIEN, NAEHRMEDIEN, LOESUNGEN UND PUFFER
.......................................
26
1.2 VERWENDETE COMPUTERPROGRAMME
..............................................................
28
1.3 HERKUNFT DER E. COLI- UND KLEBSIELLA SPP.-LSOLATE
.........................................
28
1.4 VERWENDETE KONTROLL- UND REFERENZSTAEMME
...............................................
29
2.
METHODEN..............................................................................................................
29
2.1 PHAENOTYPISCHE CHARAKTERISIERUNG
................................................................
29
2.2 ASSERVIERUNG DER ISOLATE
...............................................................................
33
2.3 MOLEKULARBIOLOGISCHE
METHODEN...................................................................33
2.4 UNTERSUCHUNGEN ZUR BIOFILMBILDUNG BEI CARBAPENEMASE-BILDNERN
...........
47
2.5 STATISTISCHE
AUSWERTUNGEN...........................................................................48
IV
ERGEBNISSE...........................................................................................................50
1. HERKUNFT DER E. COLI- UND KLEBSIELLA SPP.-ISOLATE
............................................
50
1.1 HERKUNFT DER E.
CO//-LSOLATE...........................................................................50
1.2 HERKUNFT DER KLEBSIELLA SPP.-
ISOLATE.............................................................51
2. ESBL- UND AMPC-BILDENDE E. CO/I- UND KLEBSIELLA SPP.-LSOLATE
..................
52
2.1 PHAENOTYPISCHE
CHARAKTERISIERUNG.................................................................52
2.2 GENOTYPISCHE
CHARAKTERISIERUNG..................................................................57
2.3 PHYLOGENETISCHE
UNTERSUCHUNGEN................................................................67
3. CARBAPENEMASE-PRODUZIERENDE E. COLI- UND KLEBSIELLA SPP.-LSOLATE
..........
75
3.1 PHAENOTYPISCHE
CHARAKTERISIERUNG.................................................................75
3.2 GENOTYPISCHE
CHARAKTERISIERUNG..................................................................82
3.3 UNTERSUCHUNGEN ZUR PHYLOGENIE UND KLONALITAET MITTELS MLST
UND
PULSFELDGELELEKTROPHORESE.....................................................................
88
3.4 CHARAKTERISIERUNG DES
OXA-48-PLASMIDS....................................................91
3.5 EINFLUSS DES OXA-48-PLASMIDS AUF DIE FAEHIGKEIT DER BIOFILMBILDUNG
........
94
V
DISKUSSION..........................................................................................................101
1. AUFBAU DER STUDIE
.........................................................................
..................
101
2. ESBL-/AMPC-BILDENDE E. COLI- UND KLEBSIELLA SPP.-LSOLATE
........................
102
2.1 RELATIVES VORKOMMEN ESBL-/AMPC-BILDENDER E. COLI UND KLEBSIELLA SPP.
ISOLATE...........................................................................................................102
2.2 VERTEILUNG UND VERBREITUNG DER
BLA-GENE
..................................................
109
2.3 PATHOTYPEN BEI ESBL-/AMPC-BILDENDEN E.
COLI.........................................112
2.4 VORKOMMEN PLASMIDKODIERTER FLUORCHINOLONRESISTENZGENE (*PMQR*) BEI
ESBL-BILDENDEN/AMPC-VERDAECHTIGEN E. COLI UND KLEBSIELLA SPP
..............
118
3. CARBAPENEMASE-PRODUZIERENDE E. COLI- UND KLEBSIELLA SPP.-LSOLATE
.......
120
3.1 NACHWEIS VON OXA-48-BILDENDEN ENTEROBACTERIACEAE BEI TIEREN
............
120
3.2 HINWEISE AUF EINE NOSOKOMIALE AUSBREITUNG VON
CARBAPENEMASE-PRODUZIERENDEN E. COLI- UND KLEBSIELLA SPP.-ISOLATEN...
122
3.3 URSPRUNG DER OXA-48-BILDNER - EXOGEN VS. ENDOGEN
...............................
126
3.4 OXA-48-BILDNER BEI TIEREN - INFEKTION VS.
KOLONISATION............................129
3.5 EINFLUSS DES OXA-48-PLASMIDS AUF DIE BIOFILMBILDUNG VON E.
COLI
UND K. PNEUMONIAE
.....................................................................................
131
VI
ZUSAMMENFASSUNG............................................................................................134
VII
SUMMARY.............................................................................................................136
VIII
LITERATURVERZEICHNIS...........................................................................................138
IX
ANHANG................................................................................................................
159
X
ABBILDUNGSVERZEICHNIS.....................................................................................
182
XI
TABELLENVERZEICHNIS...........................................................................................183
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