Untersuchung der Gene von Erythropoetin und Erythropoetin-Rezeptor als Kandidatengene für die Variabilität in der Erythropoese beim Schwein:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
Gießen, Lahn
VVB Laufersweiler Verlag
2017
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|---|---|
| adam_text | Inhaltsverzeichnis I
Inhaltsverzeichnis
Abbildungsverzeichnis V
Tabellenverzeichnis VI
Schemataverzeichnis VII
Abkürzungs Verzeichnis VIII
1 Einleitung 1
2 Literaturübersicht 3
2 1 Anämie beim Schwein 3
211 Definition Anämie 3
212 Diagnostik der Anämie beim Schwein 3
213 Erythropoese 4
214 Ursachen von Anämien beim Schwein 6
2141 Sarcocystis miescheriana 9
215 Pathogenese der Eisenmangelanämie und der Anämie als Begleiterscheinung
von chronischen Erkrankungen 12
2151 Eisenmangelanämie 12
2152 Anämie chronischer Erkrankungen 13
2 2 Variationen im roten Blutbild beim Schwein 14
221 Rasseunterschiede 14
222 Genetische Unterschiede 15
2221 Genvarianten fiir Parameter des roten Blutbilds beim Schwein 15
22211 KIT als Kandidatengen für die Blutbildung beim Schwein 16
2222 Genvarianten für Parameter des roten Blutbilds bei anderen Nutztieren 17
223 QTL- Analyse 18
2 3 Genetische Krankheitsresistenz beim Schwein 19
231 Resistenzunterschiede gegenüber S miescheriana beim Schwein 21
2 4 Erythropoetin 22
241 Aufbau und Funktion 22
242 Das Erythropoetin Gen 24
2421 Aufbau 24
2422 Regulation der Erythropetin-Genexpression 25
2423 Hypoxie-induzierbare Faktoren und ihre Beteiligung an der
Transkriptionsrate von Epo 28
Inhaltsverzeichnis
II
24231 HIF 28
24231 HNF-4 29
24232 p300/CBP 30
2424 Genetische Variabilität im EPO-Gen des Schweins 31
2 5 Erythropoetin-Rezeptor 32
251 Aufbau des Rezeptors 32
252 Signaltransduktion 33
2521 Janus-Kinase-STAT-Signalweg 33
2522 Phosphatidyinositol-3-Kinase Signalweg 33
2523 MAP-Kinase-Signalweg 34
2524 Intrazellulärer Ca2+-Einstrom 35
253 Das Erythropoetin-Rezeptor Gen 35
2531 Aufbau 35
2532 Regulation der Genexpression 36
2533 Transkriptionsfaktoren mit Beteiligung an der Transkription von EPOR 38
25331 GAT A-Transkript ions faktoren 38
25332 Spl 39
25333 SCL/TAL1 40
2534 Genetische Variabilität im EPOR-Gen beim Schwein 41
3 Material und Methoden 42
3 1 Versuchstiere 42
311 F2-Schweinepopulation 42
312 Kommerzielle Schweinepopulation 43
3 2 Material 44
321 Geräte und Labormaterial 44
322 Chemikalien und Enzyme 45
323 Lösungen und Puffer 46
324 Computerprogramme 47
325 Intemetadressen der verwendeten Datenbanken 47
3 3 Methoden 48
331 Datenbankrecherche 48
332 Primerdesign 48
333 Konzentrationsbestimmung der Primer mittels Photometrie 51
334 Probenmaterial 51
Inhaltsverzeichnis
III
3341 DNA-Extraktion 51
3342 Whole Genome Amplification 52
335 Amplifikation spezifischer EPO und EPO-Rezeptor-Sequenzen 53
3351 Polymerase Kettenreaktion (PCR) 53
336 Agarosegelelektrophorese 55
337 Vorbereitung der PCR-Amplifikate für die Sequenzierung 55
338 Sequenzierung der FO-Tiere 55
339 Identifizierung von SNPs 55
3 3 10 Identifikation der Genotypen in der Fl-Generation 56
3 3 11 Identifikation der Genotypen in der F2-Generation und der kommerziellen
Population 56
3 3 12 Primerdesign für die Pyrosequenzierung 56
3 3 13 PCR-Amplifikation für die Pyrosequenzierung 58
3 3 14 Pyrosequenzierung 58
3 4 Phänotypen 60
341 Blutentnahme 60
342 Anfertigung eines Differenzialblutbildes 60
343 Statistische Auswertung 60
344 QTL-Analyse 61
4 Ergebnisse 62
4 1 EPO 62
411 Gensequenz EPO 62
412 Alignment der Sequenzen von EPO 62
413 Genotypen 68
414 Darstellung der SNPs in EPO 70
415 Aminosäuresequenz von EPO 73
4 2 EPOR 74
421 Gensequenz EPOR 74
422 Alignment der Sequenzen von EPOR 74
423 Darstellung der SNPs in EPOR 76
4 3 Auswahl der SNPs für weitere Untersuchungen 78
4 4 Genotypen und Allelffequenzen in der F2-Generation 78
4 5 Assoziation zwischen Phänotyp und Genotyp in der F2-Generation 79
4 6 Kartierung von EPOR auf SSC 2 und Erythropoetin auf SSC3 87
Inhaltsverzeichnis
IV
4 7 QTL-Analyse 87
4 8 Auswahl der SNPs für die kommerzielle Population 92
4 9 Genotypen der kommerziellen Population 92
4 10 Assoziation zwischen Phänotyp und Genotyp in der kommerziellen Population unter
Einbeziehung von SNP ERE7 93
5 Diskussion 95
5 1 Bedeutung der genetischen Krankheitsresistenz für die Nutztierzucht 95
5 2 Die molekulare Basis der Genregulierung in der Erythropoese 96
5 3 Bekannte genetische Variationen mit Einfluss auf die Blutbildung 98
5 4 Variabilität von EPO und EPOR des Schweins im Vergleich mit anderen Tierarten
und dem Menschen 100
5 5 Vergleich der Variabilität von EPOR mit bekannten Genvarianten mit Einfluss auf
Reproduktionsparameter beim Schwein 102
5 6 Methodik 103
5 7 Folgen der gewonnenen Erkenntnisse 104
6 Zusammenfassung 106
7 Summary 108
8 Literaturverzeichnis 109
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