Quantitative trait loci (QTL) für die Resistenz/Empfindlichkeit gegenüber Actinobacillus pleuropneumoniae beim Schwein:
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| Published: |
Gießen, Lahn
VVB Laufersweiler Verlag
2016
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INHALTSVERZEICHNIS.........................................................................................................................I
ABBILDUNGSVERZEICHNIS..............................................................................................................IV
T
ABELLENVERZEICHNIS....................................................................................................................V
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS............................................................................................................
VI
1
EINLEITUNG............................................................................................................................
1
2
LITERATURUEBERSICHT.................................................................................................................3
2.1 ACTINOBACILLUS
SPP........................................................................................................3
2.1.1 ACTINOBACILLUS PLEUROPNEUMONIAE
..........................................................................
3
2.1.2 KLINIK UND
PATHOLOGIE............................................................................................14
2.1.3 IMMUNOLOGIE UND
ABWEHR....................................................................................
15
2.1.4
BEKAEMPFUNG..........................................................................................................16
2.2
KRANKHEITSRESISTENZ....................................................................................................
18
2.2.1 NATUERLICHE KRANKHEITSRESISTENZEN BEI NUTZTIEREN
................................................
20
2.2.2 NATUERLICHE KRANKHEITSRESISTENZEN BEIM SCHWEIN
.................................................
21
2.3 QUANTITATIVE TRAIT LOCI (QTL)
..................................................................................
29
2.3.1
HINTERGRUND............................................................................................................29
2.3.2 DURCHFUEHRUNG DER QTL-ANALYSE
..........................................................................
31
2.3.3 TIERMODELL UND FAMILIENDESIGNS
..........................................................................
31
2.3.4 AUFZUCHT, INFEKTION UND PHAENOTYPBESTIMMUNG
....................................................
34
2.3.5
GENMARKER.............................................................................................................34
2.3.6 GENETISEHE
KARTE...................................................................................................
38
2.3.7
QTL-KARTIERUNG....................................................................................................
40
2.4 QTL-STUDIEN BEI LANDWIRTSCHAFTLICHEN
NUTZTIEREN................................ 42
2.4.1 QTL-STUDIEN BEIM
SCHWEIN.................................................................................43
2.4.2 QTL-STUDIEN FUER
KRANKHEITSRESISTENZ...................................................................
43
3 MATERIAL UND
METHODEN....................................................................................................
47
3.1 V
ERSUCHSTIERE............................................................................................................
48
3.1.1 INFORMATIVE
TIERFAMILIE........................................................................................
48
3.1.2 INFEKTION DER
FR-TIERE...........................................................................................
49
3.2 PHAENOTYP-DATENERHEBUNG UND
PROBENGEWINNUNG.....................................................49
3.2.1 KLINISCHE
UNTERSUCHUNG.......................................................................................
50
3.2.2 PATHOLOGISCHE
UNTERSUCHUNG................................................................................
50
3.2.3 RESPIRATORY HEALTH
SCORE.......................................................................................
50
3.2.4 MIKROBIOLOGISCHE
UNTERSUCHUNG...........................................................................
51
3.3 MATERIAL FUER DIE EIGENEN
UNTERSUCHUNGEN.................................................................51
3.3.1 GERAETE UND
LABORMATERIALIEN.................................................................................
51
3.3.2
CHEMIKALIEN............................................................................................................52
3.3.3 LOESUNGEN UND
PUFFER.............................................................................................
52
3.3.4 COMPUTERPROGRAMME UND
DATENBANKEN................................................................53
3.4 METHODEN FUER DIE EIGENEN
UNTERSUCHUNGEN...............................................................54
3.4.1
DNA-EXTRAKTION...................................................................................................
54
3.4.2
MIKROSATELLITENMARKER...........................................................................................
55
3.4.3 POLYMERASE-KETTENREAKTION
(PCR)........................................................................56
3.4.4
FRAGMENTLAENGENANALYSE.........................................................................................
59
3.4.5 STATISTISCHE
AUSWERTUNG........................................................................................
63
4
ERGEBNISSE..........................................................................................................................65
4.1
PHAENOTYP.....................................................................................................................65
4.2
GENOTYPEN...................................................................................................................65
4.2.1
MIKROSATELLITENANALYSE...........................................................................................
65
4.2.2 KOPPLUNGSKARTE DER INFORMATIVEN
MARKER.............................................................70
4.3
QTL-KARTIERUNG.........................................................................................................
70
4.3.1
UEBERSICHT................................................................................................................
70
4.3.2 QTL FUER DEN KLINISCHEN
SCORE..............................................................................74
4.3.3 QTL FUER RESPIRATORY HEALTH
SCORE........................................................................74
4.3.4 QTL FUER BILDGEBENDE
VERFAHREN............................................................................74
4.3.5 QTL FUER TODESFAELLE, SEKTIONS- UND RE-ISOLATIONS-SCORE
......................................
75
4.3.6 QTL FUER
RHS*.......................................................................................................
75
4.4
PHAENOTYPEN-ASSOZIATIONS-ANALYSE............................................................................75
5
DISKUSSION.........................................................................................................................77
5.1 PCR UND
GELELEKTROPHORESE......................................................................................
77
5.2
MARKER........................................................................................................................78
5.3 GEWAEHLTE METHODE:
QTL-ANALYSE............................................................................79
5.4
QTL-ERGEBNISSE........................................................................................................
80
5.4.1 EINZELBETRACHTUNG DER ERMITTELTEN
QTL.................................................................82
5.4.2 ZWISCHENFAZIT ZUR
QTL-ANALYSE...........................................................................92
5.4.3 KOMBINATION POSITIONIER UND FUNKTIONELLER STUDIEN
..........................................
93
5.5 MARKER-PHAENOTYP-ASSOZIATIONEN................................... 94
5.6
FAZIT...........................................................................................................................94
6
ZUSAMMENFASSUNG.............................................................................................................96
7
SUMMARY............................................................................................................................98
8
LITERATURVERZEICHNIS.........................................................................................................
100
9
ANHANG............................................................................................................................
141
DANKSAGUNG.............................................................................................................................
167
ERKLAERUNG.................................................................................................................................
168
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