Bedeutung von Single Nucleotid Polymorphismen im NOD2/CARD15-Gen für das Überleben nach allogener Stammzelltransplantation im Kindes- und Jugendalter:
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Berlin
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INHALTSVERZEICHNIS
1. EINLEITUNG 7
1.1 UEBERBLICK 7
1.2 KNOCHENMARKTRANSPLANTATION 8
1.2.1 HISTORIE UND GRUNDLAGEN 8
1.2.2 INDIKATIONEN ZUR ALLOGENEN STAMMZELLTRANSPLANTATION 9
1.2.3 PROBLEME UND KOMPLIKATIONEN 10
1.2.3.1 GRAFT-VERSUS-HOST-ERKRANKUNG 12
1.3 NOD2/CARD15 16
1.3.1 EXPRESSION 17
1.3.2 AUFGABE 18
1.3.3 SIGNALTRANSDUKTION 18
1.3.3.1 NOD2/CARD15 UND NF-KB 19
1.3.3.2 NOD2/CARD15 UND TOLL-LIKE-REZEPTOREN 20
1.3.4 MUTATIONEN IM NOD2/CARD15-GEN - KRANKHEITSMODELLE 21
1.3.4.1 NOD2/CARD15-MUTATIONEN UND M. CROHN 22
1.3.4.2 NOD2/CARD15-MUTATIONEN
UND ALLOGENE STAMMZELLTRANSPLANTATION 22
1.4 ZIELSETZUNG DER ARBEIT 25
2. PATIENTENKOLLEKTIV 27
3. MATERIAL UND METHODEN 35
3.1 MATERIALIEN 35
3.1.1 ARBEITSGERAETE 35
3.1.2 ARBEITS- UND VERBRAUCHSMATERIALIEN 35
3.1.3 LOESUNGEN UND REAGENZIEN 36
3.1.4 SOFTWARE 37
3.2 EXPERIMENTELLE METHODEN 38
3.2.1 DNA-ISOLATION AUS MONONUKLEAEREN ZELLEN 38
3.2.2 PHOTOMETRISCHE KONZENTRATIONSBESTIMMUNG DER DNA 39
3.2.3 DNA-SEQUENZIERUNG 39
3.2.4 PCR 40
3.2.5 REAL-TIME-PCR 42
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3.2.S.
1 ALLELDISKRIMINIERUNG MITHILFE DER TAQMAN-REALTIME-PCR. 44
3.2.5.2 MUTATIONSANALYSE DES NOD2/CARD15-GENS 45
3 J STATISTISCHE METHODEN 47
3.3.1 DESKRIPTIVE STATISTIK 47
3.3.2 UEBERLEBENSZEITANALYSE
77
48
3.3.2.1 KAPLAN-MEIER-SCHAETZER UND LOG-RANK-TEST 48
3.3.2.2 COX-REGRESSION 49
3.3.2.3 KUMULATIVE INZIDENZANALYSE UND COMPETING RISKS REGRESSION. 49
4. ERGEBNISSE 51
4.1 ALLGEMEINER UEBERBLICK UEBER DIE UNTERSUCHUNGSERGEBNISSE 51
4.1.1 MUTATIONSVERTEILUNG 51
4.1.1.1 GESAMTKOHORTE 51
4.1.1.2 *AKUTE MYELOISCHE LEUKAEMIEN"
UND *NICHT-MALIGNE ERKRANKUNGEN" 53
4.1.2 KOLLEKTIVCHARAKTERISTIKA 54
4.1.3 T RANSPLANTATIONSENDPUNKTE 55
4.2 UEBERLEBENSZEITANALYSE 56
4.2.1 GESAMTKOHORTE 57
4.2.1.1 AKUTE UND CHRONISCHE GVHD 57
4.2.1.2 TUM UND REZIDIV 60
4.2.1.3 OVERALL SURVIVAL 62
4.2.2 AKUTE MYELOISCHE LEUKAEMIE 65
4.2.2.1 AKUTE UND CHRONISCHE GVHD 65
4.2.2.2 TRM UND REZIDIV 65
4.2.2.3 OVERALL SURVIVAL 66
4.2.3 NICHT-MALIGNE ERKRANKUNGEN 68
4.2.3.1 AKUTE UND CHRONISCHE GVHD 68
4.2.3.2 TRM UND REZIDIV 70
4.2.3.3 OVERALL SURVIVAL 72
4.2.4 SPEZIELLE AUSWERTUNGEN 74
4.2.4.1 HLA-KOMPATIBILITAET UND T-ZELL-DEPLETION 74
4.2.4.2 DARMDEKONTAMINATION 74
4.2.5 ZUSAMMENFASSUNG DER UEBERLEBENSZEITANALYSE
IM HINBLICK AUF DIE GEWAEHLTEN ZIELVARIABLEN 75
5. DISKUSSION 79
5.1 METHODIK 80
5.1.1 ALLELDISKRIMINIERUNG MITTELS REAL-TIME-PCR 80
5.1.1.1 NOD2/CARD15-GENOTYPISIERUNG
MITTELS TAQMAN-REAL-TIME-PCR 81
5.1.1.2 UEBERLEBENSZEITANALYSE MITTELS COMPETING RISK REGRESSION
UND KAPLAN-MEIER-SCHAETZER 82
5.2 BEDEUTUNG VON POLYMORPHISMEN IM NOD2/CARD15-GEN
FUER ALLOGENE STAMMZELLTRANSPLANTATIONEN IM KINDESALTER 84
6. ZUSAMMENFASSUNG 93
7. ABSTRACT 95
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 97
ABBILDUNGSVERZEICHNIS 100
TABELLENVERZEICHNIS 103
LITERATURVERZEICHNIS 106
DANKSAGUNG 111
LEBENSLAUF 113
NACHWORT UND PORTRAET 117 |
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