Untersuchung des Einflusses der stressregulierten rei1 homologen Proteine auf die Physiologie und den Metabolismus von Arabidopsis thaliana:
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INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS I
ABKUERZUNGEN UND FORMATIERUNGEN IV
TABELLENVERZEICHNIS V
ABBILDUNGS VERZEICHNIS VI
1 EINLEITUNG 1
1.1 AKKLIMATISIERUNG AN KAELTE VERSUS ORGANENTWICKLUNG IN DER KAELTE 2
1.1.1 MORPHOLOGISCHE UNTERSCHIEDE 2
1.1.2 BIOCHEMISCHE UNTERSCHIEDE 3
1.1.3 TRANSKRIPTIONELLE UNTERSCHIEDE 4
1.2 KAELTESTRESS IN HEFE 5
1.2.1 DAS REILP-PROTEIN IST FUER DAS WACHSTUM VON HEFE IN DER KAELTE
NOTWENDIG 7
1.2.2 DIE ROLLE VON R E I L P IN DER ZYTOSOLISCHEN REIFUNG DER
60S-UNTEREINHEIT 8
1.3 ZIELSETZUNG 9
2 MATERIAL UND METHODEN 10
2.1 IN SILICO- ANALYSE 10
2.1.1 BASIC LOCAL ALIGNMENT SEARCH TOOL (BLAST) 10
2.1.2 CLUSTALX 10
2.1.3 PHYLIP 11
2.2 ARABIDOPSIS THALIANA ANZUCHTMETHODEN 12
2.2.1 ISOLATION HOMOZYGOTER RE/7::T-DNA-INSERTIONSLINIEN 12
2.2.2 WACHSTUMSUNTERSUCHUNG AUF AGAR-PLATTEN 12
2.2.3 WACHSTUMSBEDINGUNGEN 13
2.2.4 MORPHOMETRISCHE VERMESSUNG 13
2.3 OMICS-UNTERSUCHUNG 14
2.3.1 PROBENAUFARBEITUNG 14
2.3.2 DATENAUFARBEITUNG UND AUSWERTUNG 16
2.4 KOEXPRESSIONSANALYSE 18
2.5 HEFE-ZWEI-HYBRID-SYSTEM (Y2H) 18
2.6 HEFEKOMPLEMENTATION 19
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IMAGE 2
INHALTSVERZEICHNIS
2.7 MATERIAL 20
2.7.1 PLASMIDE 20
2.7.2 REAKTIONS-KITS 20
2.7.3 OLIGONUCLEOTIDE 21
2.7.4 HEFEN 22
3 ERGEBNISSE 23
3 . 1 IN SILICO- ANALYSE 23
3.1.1 IDENTIFIZIERUNG UND VERGLEICH VON HOMOLOGEN PROTEINSEQUENZEN DES
HEFEPROTEINS R E I L P 23
3.1.2 PHYLOGENETISCHE STAMMBAEUME 27
3.1.3 PFLANZLICHE DNA-SEQUENZANALYSE 30
3.2 MOLEKULARBIOLOGISCHE UND PHYSIOLOGISCHE ARBEITEN 32
3.2.1 IDENTIFIZIERUNG VON HOMOZYGOTEN ARCIBIDOPSIS THALIANA
T-DNAINSERTIONSMUTANTEN 32
3.2.2 EXPRESSIONSANALYSE DER ARABIDOPSIS THALIANA GENE 34
3.2.3 KEIMRATENBESTIMMUNG BEI UNTERSCHIEDLICHEN TEMPERATUREN 35
3.2.4 MORPHOMETRISCHE VERMESSUNGEN VON ARABIDOPSIS THALIANA BEI
VERSCHIEDENEN
TEMPERATUREN 38
3.3 VERGLEICHENDE SYSTEMANALYSE 52
3.3.1 AEHNLICHKEITSANALYSE DER PROBEN 55
3.3.2 UEBERREPRAESENTATIONSANALYSE DER TRANSKRIPTE 58
3.3.3 INTEGRATION VON TRANSKRIPT- UND METABOLIT-ANALYSE 60
3.3.4 ANALYSE DER RIBOSOMALEN TRANSKRIPTE 73
3.4 VERGLEICHENDE KOEXPRESSIONSANALYSE VON HEFE UND ARABIDOPSIS THALIANA
UNTER
TEMPERATUREINFLUSS 75
3.5 HEFE-ZWEI-HYBRID-SYSTEM (Y2H) 78
3.6 HEFE-KOMPLEMENTATION 82
4 DISKUSSION 85
4.1 DER STAMMBAUM REILP-HOMOLOGER PROTEINE 85
4.1.1 WARUM GIBT ES NUR EUKARYOTISCHE HOMOLOGE? 88
4.2 A U F WELCHEN EBENEN ZEIGEN REIL1 UND REIL2 EINEN FUNKTIONSERHALT IM
VERGLEICH ZUM
HEFE REILP? 88
IMAGE 3
INHALTSVERZEICHNIS
4.3 GIBT ES PFLANZEN-SPEZIFISCHE FUNKTIONEN VON REIL1 UND REIL2? 91
4.4 WELCHE METABOLISCHEN UND TRANSKRIPTIONELLEN PROZESSE FINDEN WAEHREND
DER REVERSION DER
BLATTMORPHOLOGIE STATT? 92
4.5 AUSBLICK 93
5 ZUSAMMENFASSUNG 96
6 SUMMARY 98
LITERATURVERZEICHNIS 99
ANHANG IX
EIDESSTATTLICHE ERKLAERUNG XXI
DANKSAGUNG XXII |
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