Bioinformatische Datenintegration und Analyse der Eigenschaften molekularer Interaktionen:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
2012
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INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS II
ZUSAMMENFASSUNG IV
ABSTRACT V
EIGENE PUBLIKATIONEN VI
KAPITEL 1 EINLEITUNG 1
1.1 PROTEIN-PROTEIN-INTERAKTIONEN 2
1.2 PROTEIN-WIRKSTOFF-INTERAKTIONEN 6
1.3 ZIELSETZUNG DER ARBEIT 8
KAPITEL 2 METHODEN UND ERGEBNISSE 10
2.1 PROTEIN-PROTEIN-INTERAKTIONEN 10
2.1.1 ERSTELLEN EINER BIBLIOTHEK VON MAKROMOLEKUEL-INTERAKTIONSFLAECHEN 10
ORIGINALARTIKEL: JAIL: A STRUCTURE-BASED INTERFACE LIBRARY FOR
MACROMOLECULES 12
2.1.2 ANALYSE VON PROTEIN-INTERAKTIONSFLAECHEN 16
ORIGINALARTIKEL: STRUCTURAL FEATURES AND EVOLUTION O F PROTEIN-PROTEIN
INTERACTIONS 18
2.1.3 ERSTELLEN WISSENSBASIERTER INTERAKTIONSPOTENTIALE 28
ORIGINALARTIKEL: DEVELOPMENT O F IMMUNE-SPECIFIC INTERACTION
POTENTIALS AND THEIR APPLICATION IN THE MULTI-AGENT-SYSTEM VACCLMM 30
2.2 PROTEIN-WIRKSTOFF-INTERAKTIONEN 4 1
2.2.1 ERSTELLEN EINER RESSOURCE FUER PROTEIN-WIRKSTOFF-INTERAKTIONEN 4 1
ORIGINALARTIKEL: PROMISCUOUS: A DATABASE F O R NETWORK-BASED
DRUGREPOSITIONING 43
2.2.2 ANALYSE PROMISKUITIVER UND NICHT-PROMISKUITIVER WIRKSTOFFE 50
EINGEREICHTES MANUSKRIPT: POLYPHARMACOLOGY O F DRUGS: ANALYSING
MOLECULAR AND NETWORK PROPERTIES 52
2.2.3 INTERAKTIVE VISUALISIERUNG KOMPLEXER NETZWERKE 6 1
II
HTTP://D-NB.INFO/1033557315
IMAGE 2
ORIGINALARTIKEL: COBWEB: A JAVA APPLET F O R NETWORK EXPLORATION AND
VISUALISATION 63
2.2.4 BERUECKSICHTIGUNG QUANTITATIVER DATEN BEI
PROTEIN-WIRKSTOFF-INTERAKTIONEN 65
ORIGINALARTIKEL: SUPERTARGET GOES QUANTITATIVE: UPDATE ON DRUGTARGET
INTERACTIONS 66
KAPITEL 3 DISKUSSION 7 1
3.1 BEREITSTELLEN UND AUSWERTEN STRUKTURELLER INFORMATIONEN UEBER
PROTEIN-
PROTEIN-INTERAKTIONEN 7 1
3.1.1 AKQUISITION STRUKTURELLER INFORMATIONEN UEBER
MAKROMOLEKUELINTERAKTIONSFLAECHEN 7 1
3.1.2 STRUKTURELLE UND EVOLUTIONAERE EIGENSCHAFTEN VON
PROTEININTERAKTIONSFLAECHEN 72
3.1.3 ANWENDUNG WISSENSBASIERTER INTERAKTIONSPOTENTIALE ZUR
BINDUNGSVORHERSAGE 73
3.2 KONZEPTION UND AUSWERTUNG MOLEKULARER INTERAKTIONSNETZWERKE 74
3.2.1 DATENINTEGRATION ZUR GENERIERUNG EINES KOMPLEXEN MOLEKULAREN
INTERAKTIONSNETZWERKS 74
3.2.2 PROMISKUITAET VON WIRKSTOFFEN 76
3.2.3 INTERAKTIVE NETZWERKDARSTELLUNG HOCHGRADIG VERKNUEPFTER DATEN 78
3.3 FAZIT UND AUSBLICK 79
VERZEICHNISSE 8 1
LITERATURVERZEICHNIS 8 1
ABBILDUNGSVERZEICHNIS 85
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 86
ANHAENGE 87
ANHANG A DANKSAGUNG 87
ANHANG B LEBENSLAUF 88
SELBSTAENDIGKEITSERKLAERUNG 90
III
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