Molekulare epidemiologische Untersuchungen von klinischen Escherichia coli-Isolaten unterschiedlicher Wirtstierspezies:
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Berlin
Mensch und Buch Verl.
2011
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INHALTSVERZEICHNIS
1. EINLEITUNG 9
2. SCHRIFTTUM 12
2.1. PATHOVARE VON ESCHERICHIA COLI 12
2.1.1. UEBERSICHT 12
2.1.2. INTESTINAL PATHOGENE E. COLI 15
2.1.2.1. SHIGA-TOXIN-BILDENDE E COLI (STEC) 15
EPIDEMIOLOGIE 15
KLINISCHES BILD EINER STEC-INFEKTION 16
VIRULENZFAKTOREN 17
SHIGA-TOXIN 17
LOCUS OF ENTEROCYTE EFFACEMENT (LEE) 18
INTIMIN 19
HITZESTABILES ENTEROTOXIN EAST1 19
ENTEROHAEMOLYSIN EHEC-HLY 20
EXTRAZELLULAERE SERIN-PROTEASE ESPP 20
PATHOGENESE 20
2.1.2.2. ENTEROPATHOGENE E. COLI (EPEC) 21
EPIDEMIOLOGIE 21
KLINISCHES BILD EINER EPEC-INFEKTION 22
VIRULENZFAKTOREN 22
EPEC ADHERENCE FACTOR (EAF) PLASMID 22
BUNDLE-FORMING PILI (BFP) 23
LOCUS OF ENTEROCYTE EFFACEMENT 24
ESPA-FILAMENTE 24
PATHOGENESE 24
2.1.2.3. ENTEROTOXISCHE E COFF (ETEC) 25
EPIDEMIOLOGIE 25
KLINISCHES BILD EINER ETEC-INFEKTION 26
VIRULENZFAKTOREN 27
HITZELABILES ENTEROTOXIN (LT) 27
HITZESTABILES ENTEROTOXIN (ST) 27
KOLONISATIONSFAKTOREN 28
PATHOGENESE 29
2.1.3. EXTRAINTESTINAL PATHOGENE E COLI 30
2.1.3.1. UROPATHOGENE E COLI (UPEC) 30
3
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN HTTP://D-NB.INFO/101152855X
DIGITALISIERT DURCH
IMAGE 2
INHALTSVERZEICHNIS
EPIDEMIOLOGIE 30
KLINISCHES BILD EINER UPEC-INFEKTION 31
VIRULENZFAKTOREN 32
ADHAESINE 32
P-FIMBRIEN 33
F1C-UND S-FIMBRIEN 34
DR-ADHAESINE 34
TYP 1-FIMBRIEN 35
TOXINE 36
ALPHA-HAEMOLYSIN 36
ZYTOTOXISCHERNEKROSEFAKTOR(ZNF)1/2 37
SEKRETIERTES AUTOTRANSPORTER TOXIN 38
EISENAKQUISITIONSSYSTEME 38
AEROBAKTIN 39
SERUMRESISTENZFAKTOREN 39
KAPSELANTIGENE 40
O-ANTIGENE 41
ANDERE SERUMRESISTENZFAKTOREN 41
PATHOGENESE 42
2.2. VERWANDTSCHAFTSANALYSE 43
2.2.1. MULTILOKUS-SEQUENZTYPISIERUNG(MLST) 43
3. MATERIAL UND METHODEN 48
3.1. MATERIAL 48
3.1.1. BAKTERIENSTAEMME 48
3.1.1.1. VERWENDETE E CO//-LSOLATE 48
3.1.1.2. REFERENZ-UND KONTROLLSTAEMME 48
3.1.2. GERAETE UND LABORMATERIAL 50
3.1.3. CHEMIKALIEN 50
3.1.4. LOESUNGEN 51
3.1.5. NAEHRMEDIEN 52
3.1.6. OLIGONUKLEOTID-PRIMER FUER DIE PCR-AMPLIFIKATION 52
3.2. METHODEN 59
3.2.1. VERWENDETE E CO//-LSOLATE 59
3.2.1.1. ISOLIERUNG VON E COLI 59
3.2.1.2. ANZUCHT 59
3.2.1.3. ASSERVIERUNG 59
3.2.2. O-SEROTYPISIERUNG 59
IMAGE 3
INHALTSVERZEICHNIS
3.2.3. AUFREINIGUNG DER DNS 59
3.2.4. KONZENTRATIONSBESTIMMUNG DER DNS 60
3.2.5. POLYMERASE-KETTENREAKTION 60
3.2.6. PCR ZUM NACHWEIS DER VIRULENZ-ASSOZIIERTEN GENE (VAGE) 61
3.2.7. AGAROSE-GELELEKTROPHORESE 62
3.2.8. MULTILOKUS-SEQUENZTYPISIERUNG(MLST) 63
3.2.8.1. PRINZIP 63
3.2.8.2. DATENBANK 63
3.2.8.3. PCR ZUR AMPLIFIZIERUNG DER GENABSCHNITTE FUER DIE MLST 64
3.2.8.4. DARSTELLUNG DER AMPLIFIKATE MITTELS AGAROSE-GELELEKTROPHORESE
64
3.2.8.5. DNS-SEQUENZANALYSE 64
3.2.8.6. COMPUTERGESTUETZTE ANALYSE DER MLST-DATEN 65
3.2.9. STATISTISCHE AUSWERTUNG 65
4. ERGEBNISSE 66
4.1. O-SEROTYPISIERUNG 66
4.1.1. O-SEROTYPEN DER E. CO//-LSOLATE VOM KLEINTIER 66
4.1.1.1. VERGLEICH DER SEROTYPEN DER E. CO//-LSOLATE AUS DEM GIT UND DEM
UGT 67
4.2. VIRULENZGENOTYPISIERUNG 67
4.2.1. VIRULENZ-ASSOZIIERTE GENE DER E CO//-LSOLATE VOM KLEINTIER 67
4.2.1.1. VERGLEICH DER VAGE DER E CO//-LSOLATE AUS DEM GIT UND DEM UGT
VON HUND
UND KATZE 69
4.2.2. VIRULENZ-ASSOZIIERTE GENE DER E CO//-LSOLATE VOM SCHWEIN 70
4.2.2.1. VERGLEICH DER VAGE DER E CO//-LSOLATE AUS DEM GIT UND DEM UGT
DES
SCHWEINS 72
4.2.3. VIRULENZ-ASSOZIIERTE GENE DER E CO//-LSOLATE VOM RIND 74
4.2.4. VERGLEICH ALLER E CO//-LSOLATE AUS DEM GASTROINTESTINALTRAKT 76
4.2.5. VERGLEICH ALLER E CO//-LSOLATE AUS DEM UROGENITALTRAKT 79
4.3. MULTILOKUS-SEQUENZTYPISIERUNG(MLST) 81
4.3.1 SEQUENZTYPEN DER E CO/Z-LSOLATE VOM KLEINTIER 82
4.3.1.1. VERGLEICH DER STEN DER E. CO//-LSOLATE AUS DEM GIT UND DEM UGT
VON HUND
UND KATZE 83
4.3.2. SEQUENZTYPEN DER E CO//-LSOLATE VOM SCHWEIN 83
4.3.2.1. VERGLEICH DER STEN DER E COTF-LSOLATE AUS DEM GIT UND DEM UGT
DES
SCHWEINS 84
4.3.3. SEQUENZTYPEN DER E CO//-LSOLATE VOM RIND 85
4.3.4. VERGLEICH ALLER E. CO//-LSOLATE AUS DEM GASTROINTESTINALTRAKT 86
4.3.5. VERGLEICH ALLER E CO//-LSOLATE AUS DEM UROGENITALTRAKT 87
IMAGE 4
INHALTSVERZEICHNIS
4.4. ZUSAMMENHANG ZWISCHEN O-SEROTYPEN UND VIRULENZ-ASSOZIIERTEN GENEN
DER E COLI- ISOLATE VOM KLEINTIER 88
4.5. ZUSAMMENHANG ZWISCHEN O-SEROTYPEN UND SEQUENZTYPEN 89
4.5.1. ZUSAMMENHANG ZWISCHEN O-SEROTYPEN UND STEN DER E CO//-LSOLATE VOM
KLEINTIER
89
4.6. ZUSAMMENHANG ZWISCHEN VIRULENZ-ASSOZIIERTEN GENEN UND SEQUENZTYPEN
90
4.6.1. ZUSAMMENHANG ZWISCHEN VAGEN UND STEN DER E CO//-LSOLATE VOM
KLEINTIER....90
4.6.2. ZUSAMMENHANG ZWISCHEN VAGEN UND STEN DER E. CO//-LSOLATE VOM
SCHWEIN ...92
4.6.3. ZUSAMMENHANG ZWISCHEN VAGEN UND STEN DER E CO//-LSOLATE VOM RIND
92
5. DISKUSSION 93
5.1. HABITATSPEZIFITAET DER ISOLATE VOM MENSCHEN 93
5.2. HABITATSPEZIFITAET UND ZOONOSEPOTENTIAL DER ISOLATE VOM KLEINTIER 97
5.2.1. HABITATSPEZIFITAET 102
5.2.2. ZOONOSEPOTENTIAL 103
5.3. HABITATSPEZIFITAET UND ZOONOSEPOTENTIAL DER ISOLATE VOM SCHWEIN 105
5.3.1. HABITATSPEZIFITAET 106
5.3.2. ZOONOSEPOTENTIAL 108
5.4. HABITATSPEZIFITAET UND ZOONOSEPOTENTIAL DER ISOLATE VOM RIND 111
5.4.1. HABITATSPEZIFITAET 112
5.4.2. ZOONOSEPOTENTIAL 113
5.5. FAZIT 115
6. ZUSAMMENFASSUNG 117
7. SUMMARY 119
8. LITERATURVERZEICHNIS 120
9. DANKSAGUNG 149
10. SELBSTAENDIGKEITSERKLAERUNG 150
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