Experimentelle Grundlagenuntersuchung zur Klonalität von multifokalen Urothelkarzinomen mittels Human Androgen Receptor Assay (HUMARA):
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
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2008
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|---|---|
| adam_text | GLIEDERUNG
1. Einleitung
1.1 Das Krebsproblem
1.2 Einführung in die Biologie solider Neoplasien
1.3 Harnblasencarcinom
1.3.1 Epidemiologie, Risikofaktoren und Klinik
1.3.2 Pathologie und Pathogenese
2. Fragestellungen und Zielsetzungen
2.1 Klonalität von soliden Neoplasien
2.1.1 Head and Neck Squamous Cell Carcinoma (HNSCC)
2.1.2 Urothelcarcinom
2.2 Verteilung der Patches in der gesunden Harnblase
2.3 Verteilung der Patches um ein Urothelcarcinom
2.4 Pooling
2.5 Etablierung des Human Androgen Receptor Assay (HUMARA) an Paraffin
3. Materialien und Methoden
3.1 DNA-Material
3.1.1 upn_lp und -g: Informativität und Gesamtmapping
3.1.2 upn_2p: Tumormapping und HUMARA-Etablierung
3.1.3 upn_3p: HUMARA-Etablierung
3.1.4 upn_4 H2p: Informativität
3.1.5 upn_5 A2p: Informativität
3.2 DNA-Gewinnung und —Isolierung aus Paraffinmaterial
3.2.1 Schnittpräparate, Mikrodissektion, Verdau und Isolierung
3.2.2 Variationen und Besonderheiten
3.3 DNA-Gewinnung aus Gefriermaterial
3.3.1 Schnittpräparate, Mikrodissektion und Verdau
3.3.2 Variationen und Besonderheiten
3.4 Anfertigung von HE-Schnitten
3.5 Prüfung des gewonnenen Materials
3.5.1 Standard-PCR
3.5.2 Agarose-Gelelektrophorese
3.6 HUMARA-Ductus
3.6.1 Historie und Prin2ip
3.6.2 Reagenzien
3.6.3 Standardprotokoll
3.6.4 Probleme und Variationen
3.7 PAA-Gelelektrophorese und Silberfärbung
3.7.1 Historie und Prinzip des PAA-Gels
3.7.2 Silberfärbung
4. Experimente
4.1 Etablierung des HUMARA am Paraffin
4.2 DNA-Menge
4.3 Informativität der untersuchten Präparate
4.3.1 upn_lp
4.3.2 upn_2p
4.3.3 upn_4 H2p
4.3.4 upn_5 A2p
4.4 Pooling-Untersuchung
4.5 Mapping von upn_lp und upn_lg mit HUMARA
4.6 Mapping von upn_2p mit HUMARA
5. Ergebnisse
5.1 Etablierung von HUMARA am Paraffinmaterial
5.2 DNA-Menge
5.3 Informativität des untersuchten Materials
5.4 Pooling-Untersuchung
5.5 Mapping der gesamten Blase upn_l
5.5.1 Alle Ergebnisse upn_lp
5.5.2 Alle Ergebnisse upn_lg
5.5.3 Graphische Zusammenstellung
5.6 Tumor-Mapping von upn_2p
6. Diskussion
6.1 Etablierung von HUMARA am Paraffinmaterial
6.2 DNA-Menge
6.3 Informativität des untersuchten Materials
6.4 Pooling-Untersuchung
6.5 Mapping der gesamten Blase upn_lp und g
6.6 Tumor-Mapping von upn_2p
6.7 Das Krebsproblem
6.8 Zusammenfassung
7. Literatur- und Abbildungsverzeichnis
8. Anhang
11.1 Organische und anorganische Chemikalien und Substan2en
11.2 Geräte und sonstiges Labormaterial
11.3 Protokolle
11.3.1 HE-Färbung
11.3.2 Mikrodissektion
11.3.3 DNA-Isolierung
11.3.4 Agarose-Gel
11.3.5 HUMARA-Ductus
11.3.6 PAA-Gel und Silberfärbung
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GLIEDERUNG
1. Einleitung
1.1 Das Krebsproblem
1.2 Einführung in die Biologie solider Neoplasien
1.3 Harnblasencarcinom
1.3.1 Epidemiologie, Risikofaktoren und Klinik
1.3.2 Pathologie und Pathogenese
2. Fragestellungen und Zielsetzungen
2.1 Klonalität von soliden Neoplasien
2.1.1 Head and Neck Squamous Cell Carcinoma (HNSCC)
2.1.2 Urothelcarcinom
2.2 Verteilung der Patches in der gesunden Harnblase
2.3 Verteilung der Patches um ein Urothelcarcinom
2.4 Pooling
2.5 Etablierung des Human Androgen Receptor Assay (HUMARA) an Paraffin
3. Materialien und Methoden
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3.2.2 Variationen und Besonderheiten
3.3 DNA-Gewinnung aus Gefriermaterial
3.3.1 Schnittpräparate, Mikrodissektion und Verdau
3.3.2 Variationen und Besonderheiten
3.4 Anfertigung von HE-Schnitten
3.5 Prüfung des gewonnenen Materials
3.5.1 Standard-PCR
3.5.2 Agarose-Gelelektrophorese
3.6 HUMARA-Ductus
3.6.1 Historie und Prin2ip
3.6.2 Reagenzien
3.6.3 Standardprotokoll
3.6.4 Probleme und Variationen
3.7 PAA-Gelelektrophorese und Silberfärbung
3.7.1 Historie und Prinzip des PAA-Gels
3.7.2 Silberfärbung
4. Experimente
4.1 Etablierung des HUMARA am Paraffin
4.2 DNA-Menge
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4.5 Mapping von upn_lp und upn_lg mit HUMARA
4.6 Mapping von upn_2p mit HUMARA
5. Ergebnisse
5.1 Etablierung von HUMARA am Paraffinmaterial
5.2 DNA-Menge
5.3 Informativität des untersuchten Materials
5.4 Pooling-Untersuchung
5.5 Mapping der gesamten Blase upn_l
5.5.1 Alle Ergebnisse upn_lp
5.5.2 Alle Ergebnisse upn_lg
5.5.3 Graphische Zusammenstellung
5.6 Tumor-Mapping von upn_2p
6. Diskussion
6.1 Etablierung von HUMARA am Paraffinmaterial
6.2 DNA-Menge
6.3 Informativität des untersuchten Materials
6.4 Pooling-Untersuchung
6.5 Mapping der gesamten Blase upn_lp und g
6.6 Tumor-Mapping von upn_2p
6.7 Das Krebsproblem
6.8 Zusammenfassung
7. Literatur- und Abbildungsverzeichnis
8. Anhang
11.1 Organische und anorganische Chemikalien und Substan2en
11.2 Geräte und sonstiges Labormaterial
11.3 Protokolle
11.3.1 HE-Färbung
11.3.2 Mikrodissektion
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