Genomweite Kartierung von QTL mit Assoziation zur Resistenz,Empfindlichkeit gegenüber Sarcocystis miescheriana beim Schwein:
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Gießen
VVB Laufersweiler
2008
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INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS III
ABBILDUNGSVERZEICHNIS V
TABELLENVERZEICHNIS VII
1. EINLEITUNG 1
2. LITERATURUEBERSICHT 3
2.1 KRANKHEITSRESISTENZ 3
2.1.1 BEDEUTUNG DER KRANKHEITSRESISTENZ FUER DIE PRAXIS 3
2.1.2 WEGE ZUR NUTZUNG VON KRANKHEITSRESISTENZEN IN DER TIERZUCHT 3
2.1.3 BEISPIELE FUER NATUERLICHE KRANKHEITSRESISTENZEN BEI NUTZTIEREN 6
2.1.4 NATUERLICHE KRANKHEITSRESISTENZEN BEIM SCHWEIN 7
2.2 GENOMANALYSE 10
2.2.1 WAS IST GENOMANALYSE? 10
2.2.2 GENOMANALYSE UND KANDIDATENGENE 11
2.2.3 POSITIONELLE UND FIMKTIONELLE GENOMANALYSE 11
2.2.4 GENOMKARTIERUNG 13
2.3 SARCOCYSTIS MIESCHERIANA 29
2.3.1 KOKZIDIEN IM UEBERBLICK 29
2.3.2 SARCOCYSTIS MIESCHERIANA 30
2.3.3 EPIDEMIOLOGIE 31
2.3.4 ENTWICKLUNG UND PATHOGENESE 32
2.3.5 INTERAKTIONEN ZWISCHEN ERREGER UND WIRT 34
2.3.6 KLINIK DER SARKOZYSTOSE 35
2.3.7 PATHOLOGIE 36
2.3.8 THERAPIE UND PROPHYLAXE 39
2.3.9 HINWEISE AUF GENETISCH BEDINGTE RESISTENZUNTERSCHIEDE 40
3. MATERIA! UND METHODEN 41
3.1 VERSUCHSTIERE / ERZEUGUNG UND BEHANDLUNG DER TIERE 42
3.1.1 ERZEUGUNG INFOMATIVER F2-FAMILIEN 42
3.1.2 HALTUNG DER F2-KREUZUNGSTIERE UND PROBENGEWINNUNG 43
3.2 GERAETE UND LABORMATERIAL 45
3.2.1 SPEZIALGERAETE 45
3.2.2 CEMIKALIEN, ENZYME UND VERBRAUCHSMATERIAL 46
3.2.3 LOESUNGEN UND PUFFER 47
3.3 BEARBEITUNG DES PROBENMATERIALS 48
3.3.1 DNA-ISOLIERUNG 48
3.3.2 DNA-MESSUNG UND QUALITAETSPRUEFUNG 49
3.4 AUSWAHL DER MIKROSATELLITENLOCI UND PRIMER 50
3.5 POLYMERASE KETTENREAKTION (PCR) 56
3.6 FRAGMENTLAENGENANALYSE 58
3.6.1 LAENGENSTANDARD 58
3.6.2 HERSTELLUNG DER GELE 60
3.6.3 PROBENVORBEREITUNG UND -AUFTRAGUNG 60
3.6.4 ELEKTROPHORESEBEDINGUNGEN 60
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DIGITALISIERT DURCH
IMAGE 2
3.6.5 AUSWERTUNG DER FRAGMENTLAENGENANALYSE 61
3.7 STATISTISCHE AUSWERTUNG 64
3.7.1 KOPPLUNGSANALYSE 64
3.7.2 QTL-KARTIERUNG 64
4. E R G E B N I S SE .....*.......***...
........................****.*****..*** *** 65
4.1 PHAENOTYP 65
4.2 GENOTYPEN 65
4.2.1 ANALYSE DER MIKROSATELLITENLOCI 65
4.2.2 KOPPLUNGSKARTEN DER CHROMOSOMEN 68
4.3 QTL-KARTIERUNG 74
4.3.1 OBERSICHT 74
4.3.2 QTL KLINISCHER MERKMALE 77
4.3.3 QTL KLINISCH-CHEMISCHER MERKMALE 79
4.3.4 QTL HAEMATOLOGISCHER MERKMALE 81
4.3.5 QTL PARASITOLOGISCHER MERKMALE 83
4.3.6 QTL IMMUNOLOGISCHER MERKMALE 86
5. DISKUSSION 90
5.1 KLINISCHE MERKMALE (REKTALTEMPERATUR UND HERZFREQUENZ) 90
5.2 KLINISCH-CHEMISCHE MERKMALE 91
5.3 HAEMATOLOGIE 92
5.4 BRADYZOITENZAHL IM MUSKELGEWEBE 93
5.5 IMMUNGLOBULINE 94
5.6 FAZIT 95
6. ZUSAMMENFASSUNG............
........................................................ 97
6. SUMMARY
......................................................................................................
100
7. LITERATURVERZEICHNIS 103
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