Der Experimentator: Microarrays:
Gespeichert in:
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| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
München
Elsevier, Spektrum Akad. Verl.
2004
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| Ausgabe: | 1. Aufl. |
| Schriftenreihe: | Der Experimentator
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| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | XV, 212 S. Ill., graph. Darst. |
| ISBN: | 3827414385 |
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| adam_text | HANS-JOACHIM MUELLER, THOMAS ROEDER SILFI MICROARRAYS ELSEVIER SPEKTRUM
AKADEMISCHER VERLAG .SPEKTRUM K-/L AKADEMISCHER VERLAG
INHALTSVERZEICHNIS DANKSAGUNG V VORWORT VII ABKUERZUNGEN IX 1 EINLEITUNG
1 1.1 TERMINOLOGIE 2 1.2 ENTWICKLUNG DER MICROARRAYS 3 2 ANWENDUNGEN 7
2.1 WISSENSCHAFTLICHE FRAGESTELLUNG 7 2.2 DAS PHARMAZEUTISCHE ZIEL 10
2.3 DIE ANFORDERUNGEN DER BIOTECHNOLOGISCHEN FIRMEN 12 3 TECHNOLOGIE 15
3.1 PROTEIN-MICROARRAYS 15 3.1.1 GEN-UND PROTEINEXPRESSION 15 3.1.2
PROTEINALLERLEI: VOM MOLEKUEL ZUM BIOCHIP 24 3.1.3 PROTEINCHIPS 40 3.2
NUCLEINSAEURE-MICROARRAYS 54 3.2.1 HYBRIDISIERUNGSSONDEN 55 3.2.2 GERINGE
RNA-MENGEN, WAS NUN? 62 3.2.3 HERSTELLUNG VON DNA-MICROARRAYS 70 3.3
MICROARRAY-DETEKTION 75 3.3.1 LICHT UND STRAHLUNG 76 3.3.2 LEUCHTENDE
FLUOROPHORE 78 3.3.3 ENERGIEREICHES LASERLICHT 83 3.3.4 FUNKTIONSWEISE
DER MICROARRAY-SCANNER 86 3.3.5 FUNKTIONSWEISE DER MICROARRAY-IMAGER 90
3.3.6 DYNAMIC RANGE 91 3.3.7 PIXEL UND SPOTS 92 3.4
MICROARRAY-MARKIERUNGSSYSTEME 94 3.4.1 TYRAMIDE-SIGNAL-AMPLIFICATION 94
3.4.2 DENDRIMERE 95 3.4.3 QUANTUM-DOTS 96 3.4.4 CHEMILUMINESZENZ 98
3.4.5 RADIOAKTIVITAET 99 3.4.6 TIME-RESOLVE-FLUORESCENCE 99 4
INSTRUMENTATION UND SOFTWARE 105 4.1 MICROARRAY-SPOTTER 106 4.1.1
MECHANISCHES CONTACT-SPOTTING 109 XIV * INHALTSVERZEICHNIS 4.1.2
PIEZO-DISPENSER-TECHNOLOGIE 112 4.1.3 GRIDS UND SPOTS 115 4.2
DIGITALISIERUNG - DIE MICROARRAY-SCANNER 116 4.2.1 DER MICROARRAY-IMAGER
117 4.2.2 DER MICROARRAY-SCANNER 117 4.3 MICROARRAY-SOFTWARE UND
DOKUMENTATION 117 4.3.1 DOKUMENTATION DER MICROARRAY-EXPERIMENTE 118
4.3.2 DESIGN DES EXPERIMENTS 120 4.3.3 ABSICHERUNG DER ERGEBNISSE 121
4.3.4 MICROARRAY-SOFTWARE 123 4.3.5 VERGLEICH VON EXPRESSIONSDATEN 129
4.3.6 WEITERGEHENDE ANALYSE 130 4.4 ZUSAETZLICHES LABOR-EQUIPMENT UND
LABORANFORDERUNGEN FUER DIE MICROARRAY- APPLIKATION 136 4.4.1
VERBRAUCHSMATERIAL 136 4.4.2 WEITERE HILFREICHE LABORGERAETE 137 4.5
REINRAUM-TECHNOLOGIE 137 4.5.1 REINHEITSKLASSEN 138 4.5.2
REINRAUM-SYSTEME 139 5 DIE MICROARRAY-VERSUCHSDURCHFUEHRUNG 143 5.1
ISOLIERUNG UND VORBEREITUNG DER NUCLEINSAEUREN 143 5.1.1 ISOLIERUNG VON
RNA 143 5.1.2 MRNA-ISOLIERUNG AUS EUKARYOTEN 144 5.1.3 MRNA-ISOLIERUNG
AUS BAKTERIEN 144 5.1.4 SONDENHERSTELLUNG MITHILFE DER CDNA-SYNTHESE 145
5.1.5 HYBRIDISIERUNG AUF DEM DNA-BIOCHIP 146 5.1.6 PRAE-AMPLIFIZIERUNG
MITHILFE DER T7-RNA-POLYMERASE 146 5.1.7 KONSTRUKTION DER
MICROARRAY-PROBEN 148 5.1.8 QUANTIFIZIERUNGEN - UEBERPRUEFUNGEN -
SICHERHEITEN 149 5.1.9 HYBRIDISIEREN DER PROBEN 149 5.1.10
POLY-L-LYSIN-BESCHICHTUNG 151 5.2 PROTEINARRAY-PROTOKOLLE 151 5.2.1
PROTEINARRAY-PUFFER 152 5.2.2 NACHWEIS MIT ANTIKOERPERN 154 5.2.3
PROTEINKINASE-ARRAY: NACHWEIS MIT 33 P 155 6 HOCHDURCHSATZ-SCREENING 157
6.1 LABORAUTOMATION 158 6.1.1 LABORAUTOMATIONSSOFTWARE 160 6.1.2
PROBENAUFBEREITUNG 161 6.1.3 ANALYSE UND AUSWERTUNG 163 6.2
DRUG-TARGET-SCREENING 164 6.3 KLINISCHE CHEMIE UND GENETIC-SCREENING 165
7 DATENBANK-RECHERCHE UND PATENTE 169 7.1 DATENBANK-RECHERCHE 169
INHALTSVERZEICHNIS * XV 7.2 PATENTE 170 7.2.1 PATENT-RECHERCHE 172 7.2.2
PATENTRECHTLICH GESCHUETZTE TECHNOLOGIEN 179 7.3 MARKEN UND WARENZEICHEN
182 8 ZUKUNFTSAUSSICHTEN 185 8.1 TECHNISCHE ENTWICKLUNGEN 185 8.2
ANFORDERUNGSPROFILE 187 8.3 DER SCHLUSS VOM SCHLUSS 189 9 APPENDIX 191
9.1 ALLGEMEINE PUFFER 191. 9.1.1 SPOTTING-UND WASCHPUFFER 191 9.1.2
BLOCKLOESUNGEN 191 9.1.3 HYBRIDISIERUNGSLOESUNGEN 192 9.2 FORMELN ZUR
BERECHNUNG DER ANNEALING-TEMPERATUR VON OLIGONUCLEOTIDEN 192 9.2.1
FORMEL FUER OLIGONUCLEOTIDE BIS 15 BASEN 192 9.2.2 FORMEL FUER
OLIGONUCLEOTIDE VON 20 BIS 70 BASEN 192 9.3 MOL-ANGABEN UND BERECHNUNGEN
192 9.3.1 DEFINITION DES MOLS 192 9.3.2 DEFINITION DER MOLAREN MASSE UND
MOLARITAET 192 9.3.3 PMOL-MENGENANGABEN FUER NUCLEINSAEUREN 193 9.3.4
DEFINITION DER EINHEIT ,DALTON 194 9.3.5 PMOL-MENGENANGABEN FUER
PROTEINE UND PEPTIDE 194 9.4 KALKULATION DER MICROARRAY-SPOT-FLAECHE 195
9.5 KALKULATION DER MICROARRAY-SPOT-DICHTE 195 9.5.1 SPOT-DICHTE BEZOGEN
AUF CENTER-TO-CENTER-DISTANZ 195 9.5.2 SPOT-DICHTE BEZOGEN AUF ANZAHL
DER ABSOLUTEN SPOTS PRO CM 2 195 9.6 KALKULATION DER FLUOROPHORE- ODER
TARGET-DICHTE 196 FIRMENVERZEICHNIS 197 WEB-LINKS 201 SACHVERZEICHNIS
203
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