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Bibliographic Details
Other Authors:	Kole, Chittaranjan (Editor)
Format:	Book
Language:	English
Published:	Berlin [u.a.] Springer Berlin 2007
Series:	Genome mapping and molecular breeding in plants 2
Subjects:	Graines oléagineuses - Cartes chromosomiques Oléagineux - Amélioration Oléagineux - Cartes chromosomiques Oilseed plants > Breeding Oilseed plants > Genome mapping Oilseeds > Genome mapping Ölpflanzenzüchtung Genanalyse Gentechnologie Ölpflanzen Genkartierung Aufsatzsammlung
Online Access:	Inhaltstext Inhaltsverzeichnis
Physical Description:	XXIV, 302 S. 35 schw.-w. Ill., 7 farb. Ill., 4 schw.-w. Fotos, 3 farb. Fotos, 31 schw.-w. graph. Darst., 4 farb. graph. Darst. 270 mm x 193 mm
ISBN:	9783540343875 3540343873

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adam_text	CONTENTS CONTRIBUTORS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . XVI ABBREVIATIONS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . XXI 1 SOYBEAN G.-J. LEE, X. WU, J. G. SHANNON, D. A. SLEPER, H. T. NGUYEN . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1.1 INTRODUCTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1.2 CONSTRUCTION OF SOYBEAN GENETIC MAPS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 1.2.1 SOYBEAN GENETIC MAP. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 1.2.2 FIRST GENERATION OF SOYBEAN MAPS CONSTRUCTED BASED ON A SINGLE POPULATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 1.2.3 INTEGRATED SOYBEAN GENETIC MAPS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 1.3 MAPPING OF GENES IN SOYBEAN. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 1.3.1 RESISTANT GENES TO SOYBEAN DISEASES. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 1.3.2 GENES FOR HERBICIDE RESISTANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 1.3.3 NODULATION GENES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 1.3.4 GENES FOR GROWTH HABIT, FLOWERING, AND MORPHOLOGY . . . . . . . . 20 1.3.5 SOYBEAN STERILITY GENES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 1.3.6 GENES FOR MINERAL TOXICITY OR DEYYCIENCY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 1.3.7 GENES FOR SOYBEAN PIGMENTATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 1.3.8 GENES FOR FATTY ACID COMPOSITION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 1.4 QTL MAPPING IN SOYBEAN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 1.4.1 PEST RESISTANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24 1.4.2 TOLERANCE TO ABIOTIC STRESSES. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 1.4.3 GROWTH AND DEVELOPMENT RESPONSES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 1.4.4 SEED COMPOSITION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 1.4.5 YIELD-RELATED TRAITS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 1.5 MARKER-ASSISTED BREEDING IN SOYBEAN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40 1.5.1 ADVANTAGES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40 1.5.2 MARKER SYSTEMS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40 1.5.3 MARKER-ASSISTED INTROGRESSION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 1.5.4 GENE PYRAMIDING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42 1.6 PROGRESS IN MAP-BASED CLONING, TRANSFORMATION, AND OTHER CANDIDATE GENE APPROACHES IN SOYBEAN . . . . . . . . . . . . . . . . . 42 1.6.1 MAP-BASED CLONING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42 1.6.2 SOYBEAN TRANSFORMATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43 1.6.3 FUNCTIONAL GENOMICS FOR CANDIDATE GENE DISCOVERY . . . . . . . . . 43 1.7 FUTURE SCOPE. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44 REFERENCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 2 OILSEED RAPE R. SNOWDON, W. LUEHS, W. FRIEDT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 2.1 INTRODUCTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 2.1.1 ORIGIN AND HISTORY OF OILSEED RAPE. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 2.1.2 BOTANICAL DESCRIPTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56 2.1.3 ECONOMIC IMPORTANCE OF OILSEED RAPE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56 2.1.4 NUTRITIONAL AND CHEMICAL COMPOSITION OF RAPESEED OIL. . . . . . 57 XII CONTENTS 2.2 BREEDING OF OILSEED RAPE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59 2.2.1 BREEDING METHODS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59 2.2.2 BREEDING FOR IMPROVED PRODUCTIVITY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59 2.2.3 IMPROVEMENT OF SEED COMPONENTS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60 2.2.4 HYBRID BREEDING AND CYTOPLASMIC MALE STERILITY SYSTEMS. . . . . 62 2.2.5 USE OF MALE STERILITY SYSTEMS IN OILSEED RAPE BREEDING . . . . . . 64 2.2.6 GENETIC DIVERSITY FOR HETEROSIS AND HYBRID BREEDING . . . . . . . . 64 2.2.7 EXPANDING THE GENETIC VARIABILITY IN OILSEED RAPE BY INTERSPECIYYC HYBRIDIZATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65 2.3 CYTOGENETIC STUDIES OF BRASSICA CROPS AND INTERSPECIYYC HYBRIDS. . . . . . 67 2.3.1 HISTORY OF CYTOGENETIC STUDIES IN BRASSICA . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67 2.4 GENETIC DIVERSITY STUDIES IN BRASSICA NAPUS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71 2.5 GENETIC MODIYYCATION: STATUS AND POTENTIAL OF TRANSGENIC BRASSICA NAPUS . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72 2.5.1 HERBICIDE TOLERANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72 2.5.2 GENETIC ENGINEERING OF FATTY ACID BIOSYNTHESIS . . . . . . . . . . . . . 73 2.6 MOLECULAR MARKERS AND GENETIC MAPPING. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77 2.6.1 USE OF ISOENZYMES IN OILSEED RAPE BREEDING . . . . . . . . . . . . . . . 77 2.6.2 BRASSICA NAPUS GENETIC MAPS: FROM RFLP TO PCR MARKERS . . . 77 2.6.3 MAPPING OF GENES AND QTLS FOR MORPHOLOGICAL AND QUALITY TRAITS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 2.6.4 MAPPING OF GENES AND QTL FOR DISEASE RESISTANCE . . . . . . . . . . 91 2.6.5 MAPPING QTLS FOR ABIOTIC STRESS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92 2.6.6 TOWARDS AN INTEGRATED B. NAPUS GENETIC MAP . . . . . . . . . . . . . . . 93 2.7 COMPARATIVE GENOMIC STUDIES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94 2.8 PHYSICAL MAPPING AND GENOMICS TOOLS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98 2.8.1 PHYSICAL MAPPING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98 2.8.2 PUBLIC GENOME RESOURCES: THE MULTINATIONAL BRASSICA GENOME PROJECT. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100 2.8.3 GENOME SEQUENCING IN B. OLERACEA AND B. RAPA . . . . . . . . . . . . . . 100 2.9 OUTLOOK . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103 REFERENCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103 3 PEANUT S. L. DWIVEDI, D.J. BERTIOLI, J. H. CROUCH, J. F. VALLS, H. D. UPADHYAYA, A. FAVERO, M. MORETZSOHN, A. H. PATERSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 3.1 INTRODUCTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 3.1.1 ORIGIN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 3.1.2 BOTANICAL TYPES AND DISTRIBUTION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 3.1.3 CROP PRODUCTION AND USES. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116 3.1.4 IMPROVED QUALITY REQUIREMENTS: REDUCED ALLERGENICITY AND TOXICITY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 3.2 GENETIC RESOURCES IN PEANUT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 3.2.1 WILD ARACHIS SPECIES AND INTERSPECIYYC GENE INTROGRESSION INTO CULTIVATED PEANUT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 3.2.2 CULTIVATED GERMPLASM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119 3.2.3 CORE COLLECTIONS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119 3.3 APPROPRIATE GERMPLASM AND EVALUATION SYSTEMS FOR MAPPING ECONOMICALLY IMPORTANT TRAITS IN PEANUT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 3.3.1 PHENOTYPIC SCREENS, RESISTANCE/TOLERANCE MECHANISM, AND GENETICS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 CONTENTS XIII 3.3.2 GERMPLASM WITH BENEYYCIAL TRAITS FOR MAPPING AND GENETIC ENHANCEMENT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126 3.4 GENOMIC RESOURCES IN PEANUT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 3.4.1 DNA MARKERS (RFLPS, RAPDS, AFLPS, SSRS) . . . . . . . . . . . . . . . 128 3.4.2 MOLECULAR DIVERSITY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 3.4.3 MAPPING POPULATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 3.4.4 GENETIC LINKAGE MAP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 3.4.5 COMPARATIVE MAPPING WITH MODEL GENOMES. . . . . . . . . . . . . . . . 133 3.4.6 BAC LIBRARIES AND NEW GENERATION MARKERS . . . . . . . . . . . . . . . . 133 3.5 SUCCESSES AND LIMITATIONS OF CONVENTIONAL BREEDING IN PEANUT . . . . . . . 136 3.6 BIOTECHNOLOGICAL APPLICATIONS TO GENETIC ENHANCEMENT IN PEANUT . . . . 137 3.6.1 MARKER/TRAIT ASSOCIATIONS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 137 3.6.2 UNLOCKING THE GENETIC VARIATION FROM WILD GENETIC RESOURCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 137 3.6.3 TRANSGENICS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 3.7 CONCLUSIONS AND FUTURE OUTLOOK . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 REFERENCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 4 SUNFLOWER N. PANIEGO, R. HEINZ, P. FERNANDEZ, P. TALIA, V. NISHINAKAMASU, H. ESTEBAN HOPP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 4.1 INTRODUCTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 4.1.1 BRIEF HISTORY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 4.1.2 BOTANICAL DESCRIPTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 4.1.3 ECONOMIC IMPORTANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 4.1.4 CONVENTIONAL BREEDING. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 4.2 MOLECULAR MARKERS AND GENETIC MAPS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 4.3 GENOMICS AND TRANSCRIPTOMICS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 4.4 STRUCTURAL ANALYSIS BY IN SITU HYBRIDIZATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 163 4.5 RESISTANCE GENES IN CULTIVATED AND WILD SUNYYOWERS . . . . . . . . . . . . . . . . 164 4.6 QTL ANALYSIS FOR DEVELOPMENTAL AND AGRONOMIC TRAITS . . . . . . . . . . . . . 168 4.7 IN VITRO TISSUE-CULTURE-AIDED BREEDING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 169 4.8 GENETIC TRANSFORMATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 4.8.1 TRANSGENIC TRAITS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 4.8.2 TRANSGENIC SUNYYOWERS: BIOSAFETY CONCERNS . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 REFERENCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 5 INDIAN MUSTARD D. EDWARDS, P. A. SALISBURY, W. A. BURTON, C. J. HOPKINS, J. BATLEY . . . . . . . . . . 179 5.1 INTRODUCTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179 5.1.1 BRIEF HISTORY OF BRASSICA JUNCEA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179 5.1.2 BOTANICAL DESCRIPTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179 5.1.3 ECONOMIC IMPORTANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180 5.1.4 BREEDING OBJECTIVES AND PROGRESS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 181 5.1.5 OVERCOMING LIMITATIONS OF CLASSICAL ENDEAVOURS . . . . . . . . . . . . 183 5.1.6 CLASSICAL MAPPING EFFORTS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 185 5.1.7 UTILITY OF MOLECULAR MAPPING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 185 5.2 CONSTRUCTION OF GENETIC MAPS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 186 5.2.1 GENETIC MAPPING IN B. JUNCEA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 186 5.2.2 FIRST-GENERATION MAPS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 186 5.2.3 SECOND-GENERATION MAPS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188 XIV CONTENTS 5.2.4 COMPARATIVE MAPPING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 193 5.3 GENE MAPPING AND MARKER-ASSISTED SELECTION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 195 5.3.1 WHITE RUST RESISTANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 195 5.3.2 SEED COAT COLOR. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 197 5.3.3 FATTY ACID/OIL CONTENT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 198 5.3.4 GLUCOSINOLATE CONTENT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201 5.4 MARKER-ASSISTED BREEDING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 202 5.5 TRANSGENE-ASSISTED BREEDING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 203 5.6 ADVANCED WORKS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 203 5.6.1 GENE DISCOVERY AND EXPRESSION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 203 5.7 FUTURE SCOPE OF WORKS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 204 REFERENCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 205 6 BRASSICARAPA P. QUIJADA J. CAO, X. WANG, M. HIRAI, C. KOLE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211 6.1 INTRODUCTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211 6.1.1 HISTORY OF THE CROP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211 6.1.2 BOTANICAL DESCRIPTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211 6.1.3 ECONOMIC IMPORTANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213 6.1.4 BREEDING OBJECTIVES AND ACHIEVEMENTS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213 6.2 CONSTRUCTION OF GENETIC MAPS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 215 6.2.1 BRIEF HISTORY OF MAPPING EFFORTS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 215 6.2.2 MAPPING POPULATIONS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 216 6.2.3 MAPPING RESOURCES. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 217 6.2.4 GENETIC MAPS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 218 6.2.5 COMPARATIVE MAPPING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 221 6.3 GENE MAPPING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 224 6.3.1 SEED COAT COLOR. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 224 6.3.2 DISEASE RESISTANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 227 6.3.3 VERNALIZATION REQUIREMENTS AND FLOWERING TIME . . . . . . . . . . . . 229 6.3.4 FATTY ACID CONTENT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 231 6.3.5 SELF-INCOMPATIBILITY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 231 6.3.6 DWARYYSM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 232 6.3.7 MARKERS LINKED TO MICROSPORE EMBRYOGENIC ABILITY . . . . . . . . . 233 6.4 QTL MAPPING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 233 6.4.1 MORPHOLOGICAL TRAITS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 233 6.4.2 HEAT RESISTANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 236 6.4.3 RESISTANCE TO CLUBROOT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 236 6.4.4 RESISTANCE TO WHITE RUST . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 236 6.4.5 LINOLENIC ACID CONTENT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 237 6.4.6 FLOWERING TIME . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 239 6.4.7 ABIOTIC STRESSES: WINTER SURVIVAL AND FREEZING TOLERANCE . . . . . 240 6.4.8 MENDELIZATION OF QTLS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 242 6.5 MARKER-ASSISTED BREEDING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243 6.5.1 MARKER CONVERSIONS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243 6.5.2 GERMPLASM SCREENING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243 6.5.3 MARKER-ASSISTED SELECTION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246 6.5.4 MARKER-ASSISTED INTROGRESSION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248 6.5.5 GENE PYRAMIDING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250 6.6 MAP-BASED CLONING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 251 6.6.1 PRINCIPLES OF MAP-BASED CLONING. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 251 CONTENTS XV 6.6.2 GENETIC RESOURCES AND MAPPING POPULATIONS . . . . . . . . . . . . . . . 252 6.6.3 BAC LIBRARIES. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 252 6.6.4 OUTLOOK. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 253 6.7 FUTURE SCOPE OF WORKS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 253 REFERENCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254 7 BLACK MUSTARD S. DAS, U. LAGERCRANTZ, M. LASCOUX . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265 7.1 INTRODUCTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265 7.1.1 TAXONOMY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265 7.1.2 GENETIC RELATIONSHIP AND EVOLUTION OF BRASSICA SPECIES. . . . . . . 265 7.1.3 BREEDING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 266 7.2 DNA MARKER TECHNOLOGY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267 7.3 GENETIC LINKAGE MAPPING IN BRASSICA NIGRA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267 7.3.1 GENETIC MAPS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267 7.3.2 COMPARATIVE MAPPING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269 7.4 MAPPING OF FLOWERING-TIME TRAIT IN BRASSICA NIGRA . . . . . . . . . . . . . . . . . 270 7.5 FUTURE SCOPE OF WORK . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271 REFERENCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 272 8 FLAX C.A. CULLIS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275 8.1 INTRODUCTION. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275 8.1.1 ORIGIN AND HISTORY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275 8.1.2 BIOLOGICAL DESCRIPTIONS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275 8.1.3 KARYOTYPE. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 277 8.1.4 GENOME SIZE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278 8.1.5 ECONOMIC IMPORTANCE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278 8.1.6 BREEDING OBJECTIVES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 280 8.2 CONSTRUCTION OF GENETIC MAPS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 282 8.2.1 CLASSICAL MAPPING . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 282 8.2.2 MOLECULAR MAPS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285 8.3 GERMPLASM IDENTIYYCATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287 8.3.1 GERMPLASM CHARACTERIZATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287 8.3.2 MOLECULAR MARKERS FOR GERMPLASM IDENTIYYCATION. . . . . . . . . . . . 289 8.3.3 INDUCING NEW VARIABILITY OR TRAITS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 290 8.4 GENE DISCOVERY . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 291 8.5 QUANTITATIVE TRAIT LOCI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 291 8.6 FUTURE SCOPE OF WORKS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 291 REFERENCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 292 SUBJECT INDEX 297
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