In-Vitro- und In-Silico-Analyse des RANTES Promotors in einer humanen Mesangialzelllinie:
Gespeichert in:
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2003
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I
NHALT
INHALT
.
5
ZUSAMMENFASSUNG
.
7
EINLEITUNG
.
9
RANTES,
EIN
BAUSTEIN
IM
KOMPLEXEN
NETZWERK
DER
MEDIATOREN
DES
IMMUNSYSTEMS
.
10
DIE
STRUKTUR
VON
RANTES
.
12
DIE
EXPRESSION
VON
RANTES
IN
VERSCHIEDENEN
GEWEBEN
.
13
BIOLOGISCHE
EIGENSCHAFTEN
VON
RANTES
.
14
CHEMOTAXIS
UND
HAPTOTAXIS
.
14
REKRUTIERUNG
VON
LEUKOZYTEN
AUS
DEM
BLUTSTROM
INS
GEWEBE
.
14
ZELLAKTIVIERUNG
DURCH
RANTES
.
16
RANTES
REZEPTOREN
.
17
BEDEUTUNG
VON
RANTES
FUER
DIE
ENTSTEHUNG
VON
KRANKHEITEN
.
18
TRANSPLANTAT-ABSTOSSUNG
.
19
GLOMERULONEPHRITIS
.
21
GENOMISCHE
ORGANISATION
DES
RANTES
GENS
.
24
TRANSKRIPTIONELLE
REGULATION
DES
RANTES
GENS
.
25
T-LYMPHOZYTEN
.25
MONOZYTEN
.27
ASTROZYTEN
.
28
FIBROBLASTEN
.
28
DAS
ZYTOKIN
TNFA
.
28
DAS
ZYTOKIN
IFNY
.
30
DIE
FUNKTIONEN
DER
ZYTOKINE
TNFA
UND
IFNY
IM
KONTEXT
IMMUNOLOGISCHER
REAKTIONEN
IM
MESANGIUM
.
31
FRAGESTELLUNG
UND
EXPERIMENTELLE
STRATEGIE
.33
EXPERIMENTELLE
STRATEGIE:
.
34
MATERIAL
UND
METHODEN:
.
.V.
.
35
VORBEMERKUNG
.35
ZELLKULTUR
.
.
.35
DIE
IHMC-ZELLLINIE
.
35
KULTURBEDINGUNGEN
.36
VORGEHEN
ZUR
VERMEIDUNG
VON
EINFLUESSEN
DURCH
MYCOPLASMENKONTAMMATION
.
37
ELISA
.37
RNA-PRAEPARATION
.38
ANALYTISCHES
RNA-GEL
.
39
RNASE
PROTECTION
ASSAY
.
40
BENUTZTE
PLASMIDE:
.
41
REPORTERGEN-KONSTRUKTE:
.
41
DAS
REPORTERGENKONSTRUKT
-974
RANTES
(RFL)
.
42
WEITERE
PLASMIDE
(-434,
-280,
-228, -194,
-145,
-128)
.
44
ERZEUGUNG
VON
MUTATIONEN
IN
R(D)
.
44
DER
VEKTOR
PRL-TK
(PROMEGA)
.
46
SEQUENZIERUNG
VON
PLASMID-DNA
.
47
PRAEPARATION
VON
PLASMID-DNA
FLLR
TRANSFEKTIONSEXPERIMENTE
.
47
DAS
DUAL-LIGHT
ASSAY
SYSTEM
(PROMEGA)
.
48
TRANSFEKTION
.
49
PRAEPARATION
VON
KEMEXTRAKTEN:
.
50
BESTIMMUNG
DER
PROTEIN-KONZENTRATION
IM
KEMEXTRAKT
.
51
DNASE
1
FOOTPRINT
.
52
DAS
PRINZIP
DES
DNASE
FOOTPRINTINGS:
.
52
MARKIERUNG
DER
SONDE
.53
DNA-BINDUNGSREAKTION:
.53
VERDAU
MIT
DNASEL
.
54
AUFREINIGUNG
UND
ANALYSE
DER
SPALTPRODUKTE
.54
HERSTELLUNG
EINER
A/G-LEITER
.55
EMSA
.
55
HYBRIDISIERUNG
DER
OLIGONUKLEOTIDE
ZU
DOPPELSTRANG-DNA
.
56
MARKIERUNG
DER
SONDEN
.57
DNA-BINDUNGSREAKTION
.58
INHALT
KOMPETITION
.59
SUPERSHIFT
.
59
TROCKNEN
UND
EXPONIEREN
DES
GELS
.
60
SOFTWARE
ZUR
FN-SMCO-ANALYSE
DER
PROMOTOR-REGIONEN
.
60
SONSTIGE
MATERIALIEN
.
61
CHEMIKALIEN,
ENZYME
UND
RADIOAKTIVITAET
.
61
KULTURMEDIEN
.
62
ALLGEMEIN
VERWENDETE
LOESUNGEN
UND
PUFFER
.
62
LOESUNGEN
FILR
DIE
ANALYSE
VON
RNA
.
63
LOESUNGEN
FILR
DIE
HERSTELLUNG
VON
KEMEXTRAKTEN
.
64
LOESUNGEN
FILR
DNASE
IFOOTPRINTING-EXPGUEVCWXTE
.
64
LOESUNGEN
FILR
DEN
RANTES-ELISA
.
65
BAKTERIENSTAEMME
.
65
GERAETE
.
66
ERGEBNISSE
.
67
RANTES
ELISA
.
67
RNASE
PROTECTION
ASSAY
.
68
TRANSIENTE
TRANSFEKTION
MIT
PGI3-RFL
.
69
TRANSFEKTION
VON
IHMC
MIT
RANTES-PROMOTOR
-
DELETIONSSERIEN
.
YY.
.
70
DNASEL
FOOTPNNTING
.
72
ANALYSE
VON
SITE
R(D)
.73
ANALYSE
DER
REGION
R(G)
.76
SUCHE
WEITERER
IN
IHMC
FILR
DIE
ANTWORT
AUF
TNFA
UND
IFN?
RELEVANTER
SITES
.
78
ANALYSE
VON
REGION
R(A/B)
.
79
ERSTELLUNG
VON
COMPUTERMODELLEN
DES
RANTES
PROMOTORS
IN
IHMC
UND
DATENBANKSUCHE
NACH
AEHNLICH
ORGANISIERTEN
PROMOTOREN
.
82
DISKUSSION
.
87
REGULATION
DER
RANTES-EXPRESSION
IN
VERSCHIEDENEN
GEWEBEN
.
87
RANTES
EXPRESSION
DER
IHMC-ZELLINE
.
88
DIE
RANTES
EXPRESSION
DURCH
IHMC
WIRD
DURCH
STIMULATION
MIT
TNFA
UND
IFNY
AUF
STUFE
DER
TRANSKRIPTION
HOCHREGULIERT
.
88
DIE
REGION
R(D)
.
90
DIE
REGION
R(G)
.
7.
.
90
DIE
REGION
R(A/B)
.
91
UEBERGEORDNETE
STRUKTUREN
DES
RANTES
PROMOTORS
.
92
DIE
IN-SILICO-ANALYSE
DES
RANTES
PROMOTORS
.
94
AUSBLICK
.
95
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
.
96
ABBILDUNGSVERZEICHNIS
.
98
LITERATURVERZEICHNIS
.
100
CURRICULUM
VITAE
.
116
PERSOENLICHE
DATEN:
.
116
SCHULBILDUNG:
.
1
16
UNIVERSITAETSAUSBILDUNG:
.
116
VEROEFFENTLICHUNGEN:
.
1
16
VORTRAEGE:
.
116
POSTER:
.
1
17
PROMOTION:
.
117
-
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6
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