Analyse von Kandidatengenen für Schlachtkörperleistung und Fleischqualität beim Schwein:
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| Published: |
Berlin
Tenea-Verl.
2003
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|---|---|
| adam_text | Titel: Analyse von Kandidatengenen für Schlachtkörperleistung und Fleischqualität beim Schwein
Autor: Sternstein, Ina
Jahr: 2003
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
1 Einleitung 1
2 Literaturübersicht 3
2.1 Kandidatengene und QTL-Analysen 3
2.1.1 Definition und Bedeutung von Kandidatengenen 4
2.1.2 Tierzüchterisch relevante Kandidatengene 6
2.1.3 QTL-Effekte und markergestützte Selektion 8
2.2 Funktion, Bedeutung und Genstruktur ausgewählter Kandidaten-
gene für Schlachtkörperleistung und Fleischqualität 16
2.2.1 Alpha-Actin(ACTAI) 16
2.2.2 Alpha-Actinin (ACTN2) 17
2.2.3 Brain-natriuretic polypeptide 1 (BNP1) 19
2.2.4 Myogenin (MYOG) 21
2.2.5 Octamer-specific transcription-factor 1 (OCT1) 23
2.2.6 Pituitary-specific transcription-factor 1 (PIT1) 24
2.3 Schlachtkörperleistung und Fleischqualität 26
2.4 Vergleichende Genkartierung 29
32
32
32
33
38
38
42
3 Material und Methoden
3.1 Material
3.1 .1 Tiermaterial
3.1 .2 Erfaßte Merkmale
3.1 .3 Labormaterial
3.1 .4 Puffer und Lösungen
3.1 .5 Geräte und Zubehör
Inhaltsverzeichnis
Methoden 43
Datenbankrecherchen 44
DNA-Isolierung 44
Labormethoden zur Darstellung der Genvarianten 44
3.2.3.1 Amplifizierung der Genfragmente mittels PCR 44
3.2.3.2 Restriktionsbedingungen für die Darstellung der PCR-RFLPs von
ACTA1, MYOG, OCT1 und PIT1 48
3.2.3.3 Polyacrylamid-Gelelektrophorese zur Darstellung von PCR-RFLPs
und Mikrosatelliten (ACTA1, BNP1) 49
3.2.3.4 Agarose-Gelelektrophorese zur Darstellung von PCR-RFLPs
(MYOG, OCT1, PIT1) 52
3.2.3.5 MDE-Gelelektrophorese zur Auftrennung von SSCPs (ACTN2) 54
3.2.4 Biostatistische Auswertungen 56
4 Ergebnisse 60
4.1 Einordnung des Promotionsvorhabens in das
Gesamtforschungsprojekt zur Kandidatengenanalytik beim Schwein 60
Informativität des Tiermaterials 61
Ergebnisse der Genotypisierungen 62
ACTA1-Locus 62
ACTN2-Locus 63
BNP1-Locus 65
MYOG-Locus 66
OCT1-Locus 67
PIT1-Locus 68
Phänotypische Merkmale in den F2-Generationen der
Ressourcefamilien 69
Inhaltsverzeichnis
4.5 Beziehungen von Kandidatengenvarianten zu phänotypischen
Leistungsmerkmalen 74
4.5.1 Alpha-Actin (ACTA1) 74
4.5.2 Alpha-Actinin2 (ACTN2) 76
4.5.3 Brain-natriuretic polypeptide 1 (BNP1) 81
4.5.4 Myogenin (MYOG) 86
4.5.5 Octamer-specific transcription-factor 1 (OCT1) 88
4.5.6 Pituitary-spedfictranscription-factori (PIT1) 89
4.6 Zusammenfassende Ergebnissdarstellung der
Kandidatengenanalysen 92
4.7 Ergebnisse der Kopplungsanalysen und QTL-Effekte im
Chromosom 14 96
Diskussion 102
5.1 Tiermaterial und phänotypische Leistungskriterien 103
5.2 Darstellung der Genvarianten und Genotypisierung des
Tiermaterials 104
5.3 Effekte der Genvarianten 109
5.4 Kopplungs-und QTL-Analysen 114
5.5 Bewertung der Forschungsergebnisse der Kandidatengenanalyse 117
5.6 Entwicklungsmöglichkeiten bei den Laborarbeiten 119
5.7 Schlußfolgerungen und Ausblick 121
III
Inhaltsverzeichnis
6 Zusammenfassung 125
7 Literaturverzeichnis 127
8 Abbildungsverzeichnis 143
9 Tabellenverzeichnis 146
10 Anhang 149
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