Isolierung, Identifizierung und Lokalisierung von diazotrophen Bakterien aus der C4-Rohstoffpflanze Miscanthus:
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| Language: | German |
| Published: |
Aachen
Shaker
2003
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| Series: | Berichte aus der Biologie
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| Item Description: | Zugl.: München, Univ., Diss., 2002 |
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INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGEN
_
A.
EINLEITUNG
1
1.
AZOSPIRFLLUM
-
EIN
"PIONIER
"
DER
PFLANZENWACHSTUMSSTIMULIERENDEN
BAKTERIEN
2
2.
ENDOPHYTISCHE
DIAZOTROPHE
BAKTERIEN
3
3.
MISCANTHUS
-
EINE
ROHSTOFFPFLANZE
5
4.
BEDEUTUNG
MOLEKULARER
METHODEN
IN
DER
MIKROBIELLEN
OEKOLOGIE
7
5.
ZIELSETZUNG
8
B.
MATERIAL
UND
METHODEN
9
1.
VERWENDETE
ORGANISMEN
UND
KULTURMEDIEN
9
1.1.
BAKTERIENSTAEMME
9
1.2.
NAEHRMEDIEN
10
2.
VERWENDETE
LOESUNGEN
13
2.1.
PBS
(PHOSPHATE
BUFFERED
SALINE)
(HARLOW
UND
LANE,
1988)13
2.2.
LOESUNGEN
FUER
AZOSPIRILLUM
MINIMALMEDIUM
_
14
2.3.
SPURENELEMENT-LOESUNG
1
(FUER
N-FREIE
MEDIEN)
14
2.4.
VITAMIN-LOESUNG
(FUER
N-FREIE
MEDIEN)
15
2.5.
SPURENELEMENT-LOESUNG
2
(FUER
HOAGLANDMEDIUM)
15
2.6.
EISEN(III)-LOESUNG
(FUER
HOAGLANDMEDIUM)
15
2.7.
TE-PUFFER
(SAMBROOK
ET
AL.,
1989)15
2.8.
MOPS-PUFFER
15
2.9.
CARBONAT
BUFFER
(CB)
15
2.10.
EXTRAKTIONSPUFFER
(DE
MOT
ET
AL.,
1989)16
2.11.
LOESUNGSMITTEL
16
3.
MOLEKULARE
SONDEN
16
3.1.
ANTIKOERPER
16
3.2.
RRNA-SONDEN
17
4.
ISOLIERUNG
VON
DIAZOTROPHEN
BAKTERIEN
19
INHALTSVERZEICHNIS
4.1.
ISOLIERUNGSMETHODE
(DOEBEREINER,
1995)19
4.2.
BESTIMMUNG
DER
KEIMZAHL
DIAZOTROPHER
BAKTERIEN
20
4.3.
OBERFLAECHENSTERILISIERUNG
MIT
CHLORAMIN-T-LOESUNG
(DOEBEREINER
ET
AL.,
1995A)
ZUR
ISOLIERUNG
VON
ENDOPHYTISCHEN
BAKTERIEN
20
5.
PHYSIOLOGISCHE
CHARAKTERISIERUNG
21
5.1.
KOMMERZIELLE
TESTSYSTEME
21
5.2.
PHYSIOLOGISCHE
TESTS
21
6.
NUKLEINSAEUREISOLIERUNG
23
6.1.
DNA-PRAEPARATION
NACH
MARMUR
(1961,
MODIFIZIERT
VON
MAYER
UND
SCHLEIFER,
1978)23
6.2.
RNA
UND
DNA
ISOLIERUNG
NACH
OELMTLLLER
ET
AL.
(1990,
MODIFIZIERT)
24
6.3.
DNA
UND
RNA
ISOLIERUNG
MIT
DEM
QIAGEN-SCHNELLKIT
25
6.4.
QUANTIFIZIERUNG
DER
RNA
UND
DNA
26
7.
IN
VLTRO-AMPLIFLKATION
VON
DNA
MITTELS
POLYMERASE-KETTENREAKTION
(PCR)
27
7.1.
INTER-LINEPCR(SMIDAERO/.,
1996;
VERAENDERT
NACH
KIRCHHOF
ET
AL.,
1997A)
28
7.2.
NIFD-PCR
(STOLTZFUS
ET
AL.,
1997)29
7.3.
16S
RDNA
AMPLIFLZIERUNG
(NACH
MARCHESI
ET
AL.,
1998)
30
7.4.
ISOLIERUNG,
REINIGUNG
UND
KONZENTRIERUNG
VON
PCR-PRODUKTEN
31
8.
THERMISCHE G+C-GEHALTSBESTIMMUNG GENOMISCHER
DNA
31
9.
HYBRIDISIERUNGSSTRATEGIEN
31
9.1.
HYBRIDISIERUNG
MEMBRANGEBUNDENER
NUKLEINSAEUREN
31
9.2.
IN
SITU
EINZELZELLHYBRIDISIERUNG
33
10.
MIKROSKOPIE
UND
BILDVERARBEITUNG
36
10.1.
EPIFLUORESZENZMIKROSKOPIE
36
10.2.
KONFOKALE
LASERSCANNING-MIKROSKOPIE
37
11.
IMMUNOLOGISCHE
TECHNIKEN
38
11.1.
HERSTELLUNG
VON
POLYKLONALEN
ANTISEREN
38
11.2.
AUFREINIGUNG
DER
POLYKLONALEN
ANTISEREN
(FLATTEN,
1996)39
11.3.
CHARAKTERISIERUNG
DER
POLYKLONALEN
ANTISEREN
41
11.4.
IMMUNODETEKTION
44
11.5.
IMMUNOGOLDMARKIERUNG
48
11.6.
IMMUNOLOGISCHE
IN
SITU
FLUORESZENZMARKIERUNG
50
INHALTSVERZEICHNIS
12.
INOKULATIONSVERSUCHE
51
C.
ERGEBNISSE
53
1.
ISOLIERUNG
DIAZOTROPHER
BAKTERIEN
53
1.1.
KEIMZAHLEN
OHNE
OBERFLAECHENSTERILISATION
53
1.2.
ANPASSUNG
DER
METHODE
ZUR
OBERFLAECHENSTERILISIERUNG
MIT
CHLORAMIN-T
54
2.
IDENTIFIZIERUNG
DER
GEWONNENEN
ISOLATE
55
2.1.
EINORDNUNG
DER
ISOLATE
MIT
RIBOSOMALEN
OLIGONUKLEOTIDSONDEN
56
2.2.
DUGANELLA
SP.-ISOLATE
58
2.3.
COMOMONAS-VERWANDTE
ISOLATE
59
3.
CHARAKTERISIERUNG
VON
HERBASNLRULUM
SP.-ISOLATE
65
3.1.
PHYLOGENETISCHE
ZUORDNUNG
66
3.2.
PHYSIOLOGISCHE
CHARAKTERISIERUNG
-
KOHLENSTOFFVERWERTUNGSMUSTER
67
3.3.
STICKSTOFFLXIENMGSKAPAZITAET
71
3.4.
PCR-FINGERPRINTS
72
3.5.
ELEKTRONENMIKROSKOPIE
73
4.
CHARAKTERISIERUNG
VON
AZOSDIRILLUM
SP.-ISOLATEN
74
4.1.
PHYLOGENETISCHE
CHARAKTERISIERUNG
75
4.2.
PHYSIOLOGISCHE
CHARAKTERISIERUNG
78
4.3.
STICKSTOFFIXIERUNGSKAPAZITAET
85
5.
IMMUNOLOGISCHE DETEKTION
VON
HERBASNIRILLUM
FRISINGENSE
90
5.1.
POLYKLONALE
ANTISEREN
SPEZIFISCH
FLLR
HERBASPIRILLUM
FRISINGENSE
90
5.2.
LOKALISIERUNG
VON
DIAZOTROPHEN
BAKTERIEN
98
6.
INOKULATION
VON
MISCANTHUS-JUNENFLANZEN
IM
AXENISCHEN
MODELLSYSSTEM
109
D.
DISKUSSION
113
1.
ISOLIERUNG
VON
AEROBEN
DIAZOTROPHEN
BAKTERIEN
AUS
BODEN,
RHIZOSPHAERE
UND
PFLANZENGEWEBE
113
2.
AZOSNLRILLUM
DOEBEREINERAE
SP.
NOV.,
EIN
NEUES,
AUS
MLSCANTHUS
ISOLIERTES
STICKSTOFFLXIERENDES
BAKTERIUM
116
INHALTSVERZEICHNIS
2.1.
ARTBESCHREIBUNG
VON
AZOSPIRILLUM
DOEBEREINERAE
SP.
NOV.
116
2.2.
PHYLOGENETISCHE
EINORDNUNG
VON
AZOSPIRILLUM
DOEBEREINERAE
117
2.3.
PHYSIOLOGISCHE
EIGENSCHAFTEN
VON
AZOSPIRILLUM
DOEBEREINERAE
120
2.4
STICKSTOFFIXIERUNGSFAEHIGKEIT
VON
AZOSPIRILLUM
DOEBEREINERAE
121
3.
ZUORDNUNG
EINER
GRUPPE
VON
HERBASNIRILLUM
SP.
ISOLATEN
ZU
HERBASNIRILLUM
FRISINGENSE
.
EINEM
AUS
MISCANTHUS
-GEWEBE
ISOLIERTEN
ENDOPHYTISCHEN
DIAZOTROPHEN
BAKTERIUM
124
4.
BESIEDLUNG
VON
MISCANTHUS
DURCH
HERBASNIRILLUM FRISINGENSE
IM
MODELSYSTEM
UNTER
VERWENDUNG
IMMUNOLOGISCHER
METHODEN
129
4.1.
CHARAKTERISIERUNG
SPEZIFISCHER
POLYKLONALER
ANTISEREN
ZUR
DETEKTION
VON
77.
FRISINGENSE
130
4.2.
UNTERSUCHUNG
DER
BESIEDLUNG
VON
MISCANTHUS
DURCH
HERBASPIRILLUM
FRISINGENSE
IM
MODELLSYSTEM
132
5.
AUSWIRKUNG
DER
INOKULIERUNG MIT
AUSGEWHHLTEN
BAKTERIELLEN
ISOLATEN
AUF
DAS
WACHSTUM
VON
MISCANTHUS-PFLANZEN
AUS
GEWEBEKULTUR
136
E.
ZUSAMMENFASSUNG
141
F.
LITERATURVERZEICHNIS
143
G.
ANHANG
137
1.
16S
RDNA-SEQUENZEN
157
1.1.
16S
RDNA-TEILSEQUENZ
DES
ISOLATES
GSF64
157
1.2.
16S
RDNA
TEILSEQUENZ
DES
ISOLATES
MB31A
157
2.
PUBLIKATIONSLISTE
158
LEBENSLAUF
159 |
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| series2 | Berichte aus der Biologie |
| spelling | Eckert, Barbara Verfasser aut Isolierung, Identifizierung und Lokalisierung von diazotrophen Bakterien aus der C4-Rohstoffpflanze Miscanthus Barbara Eckert Aachen Shaker 2003 159 S. Ill., graph. Darst. : 21 cm, 253 gr. txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Berichte aus der Biologie Zugl.: München, Univ., Diss., 2002 Isolierung Mikrobiologie (DE-588)4193882-3 gnd rswk-swf Systematik (DE-588)4128136-6 gnd rswk-swf Stickstofffixierende Bakterien (DE-588)4270189-2 gnd rswk-swf Miscanthus (DE-588)4388274-2 gnd rswk-swf (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content Miscanthus (DE-588)4388274-2 s Stickstofffixierende Bakterien (DE-588)4270189-2 s Isolierung Mikrobiologie (DE-588)4193882-3 s DE-604 Systematik (DE-588)4128136-6 s DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=010197525&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
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