Molekulare Charakterisierung von Staphylococcus-aureus-Teichonsäure-Mutanten:
Gespeichert in:
1. Verfasser: | |
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Format: | Buch |
Sprache: | German |
Veröffentlicht: |
Freiburg i. Breisgau
[Selbstverl.]
2002
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Schlagworte: | |
Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
Beschreibung: | Tübingen, Univ., Diss., 2002 |
Beschreibung: | VI, 132 S., S. A - B Ill., graph. Darst. : 21 cm |
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INHALTSVERZEICHNIS
1
ZUSAMMENFASSUNG
1
2
EINLEITUNG
3
2.1
STAPHLOKOKKEN
3
2.2
BIOFILMBILDUNG
BEI
STAPHYLOKOKKEN
4
23
TEICHONSAEUREN
6
23.1
LIPOTEICHONSAEUREN
7
23.1.1
STRUKTUR
DER
LIPOTEICHONSAEUREN
7
23.1.2
BIOSYNTHESE
DER
LIPOTEICHONSAEUREN
8
2.3.1.3
FUNKTION
DER
LIPOTEICHONSAEUREN
9
2.3.2
WANDTEICHONSAEUREN
10
23.2.1
STRUKTUR
DER
WTA
BEI
STAPHYLOKOKKEN
10
23.2.2
BIOSYNTHESE
DER
WTA
BEI
S.
AUREUS
UND
B.
SUBTILIS
11
2.3.23
GENETISCHE
ORGANISATION
DER
WTA-BIOSYNTHESE
14
23.2.4
FUNKTION
DER
WTA
16
2.4
FRAGESTELLUNG
DER
VORLIEGENDEN
ARBEIT
17
3
MATERIAL
UND
METHODEN
18
3.1
MATERIAL
18
3.1.1
CHEMIKALIEN
18
3.1.2
ENZYME
19
3.1.3
SPEZIELLE
LABORGERAETE
19
3.1.4
NAEHRMEDIEN
20
3.1.5
ANTIBIOTIKA
20
3.1.6
BAKTERIENSTAEMME
UND
PLASMIDE
21
3.1.6.1
BAKTERIENSTAEMME
21
3.1.6.2
PLASMIDE
UND
PHAGEN
22
3.1.6.2.1
PLASMIDE
22
3.1.6.2.2
PHAGEN
22
3.2
METHODEN
23
3.2.1
KULTIVIERUNG
UND
STAMMHALTUNG
VON
BAKTERIEN
23
3.2.2
PROPAGIERUNG
UND
STAMMHALTUNG
VON
PHAGEN
23
3.2.3
BESTIMMUNG
UND
ERHOEHUNG
DES
PHAGENTITERS
24
3.2.4
ISOLATION
VON
PHAGENRESISTENTEN
STAPHYLOKOKKEN-TRANSPOSON-MUTANTEN
24
3.2.5
TRANSPOSON-MUTAGENESE
25
3.2.6
METHODEN
ZU
ISOLIERUNG
UND
IN
VIRRO-BEHANDLUNG
VON
DNA
26
INHALTSVERZEICHNIS
3.2.6.1
PLASMIDISOLIERUNG
AUS
E.
COLI
UND
STAPHYLOKOKKEN
26
3.2.6.2
ISOLIERUNG
CHROMOSOMALER
DNA
AUS
STAPHYLOKOKKEN
27
3.2.6.3
DNA-SEQUENZIERUNG
27
3.2.6.4
COMPUTERUNTERSTUETZTE
SEQUENZANALYSE
28
3.2.6.5
DNA-AMPLIFIKATION
DURCH
PCR
28
3.2.6.6
SYNTHETISCHE
OLIGONUCLEOTIDE
29
3.2.6.6.1
SEQUENZIERPRIMER
30
3.2.6.6.2
PCR-PRIMER
31
3.2.6.7
PHENOLEXTRAKTION
31
3.2.6.8
ETHANOLPRAEZIPITATION
32
3.2.6.9
DNA-SPALTUNG
DURCH
RESTRIKTIONSENDONUKLEASEN
32
3.2.6.10
BEHANDLUNG
VON
DNA
MIT
ALKALISCHERPHOSPHATASE
33
3.2.6.11
LIGATION
VON
DNA-FRAGMENTEN
33
3.2.6.12
AGAROSE-GELELEKTROPHORESE
33
3.2.6.13
GELELUTION
34
3.2.7
TRANSFORMATION
35
3.2.7.1
TRANSFORMATION
VON
E.
COLI
35
3.2.7.2
TRANSFORMATION
VON
5.
AUREUS
35
3.2.8
INSERTIONSINAKTIVIERUNG
VON
GENEN
IM
GENOM
VON
S.
AUREUS
36
3.2.9
METHODEN
ZUR
ISOLIERUNG
UND
DETEKTION
VON
PROTEINEN
37
3.2.9.1
ISOLIERUNG
VON
OBERFLAECHEN-ASSOZIIERTEN
PROTEINEN
AUS
37
STAPHYLOKOKKEN
3.2.9.2
ZELLAUFSCHLUSS
37
3.2.9.3
SDS-PAGE
38
3.2.9.4
PROTEINSTANDARDS
39
3.2.9.5
TEST
DER
AUTOLYTISCHEN
AKTIVITAET
VON
OBERFLAECHEN
ASSOZIIERTEN
39
PROTEINEN
IM
ZYMOGRAMM
3.2.10
TEST
AUF
BIOFILMBILDUNG
40
3.2.11
TEST
DER
INITIALEN
ADHAESION
41
3.2.12
PIA
ISOLIERUNG
VON
STAPHYLOKOKKEN
41
3.2.12.1
EXTRAKTION
VON
PIA
DURCH
ULTRASCHALLBEHANDLUNG
41
3.2.12.2
EXTRAKTION
VON
PIA
IM
ANALYTISCHEN
MASSSTAB
DURCH
ERHITZEN
42
3.2.12.3
TRANSFER
VON
PIA
AUF
NITROCELLULOSEMEMBRANEN
UND
42
IMMUNDETEKTION
3.2.13
BINDUNG
VON
CYTOCHROM
C
AN
OBERFLAECHEN
VON
STAPHYLOKOKKEN
43
3.2.14
ISOLIERUNG
VON
WANDTEICHONSAEUREN
44
3.2.14.1
HERSTELLUNG
VON
ZELLEXTRAKTEN
44
3.2.14.2
ISOLIERUNG
VON
WANDTEICHONSAEUREN
AUS
ZELLEXTRAKTEN
44
3.2.14.3
BESTIMMUNG
DES
PHOSPHATGEHALTES
ISOLIERTER
WTA
45
3.2.14.4
BESTIMMUNG
DES
N-ACETYL-GLUCOSAMIN
GEHALTES
46
ISOLIERTER
WTA
3.2.15
PLASMIDKONSTRUKTIONEN
47
3.2.15.1
INSERTIONSINAKTIVIERUNG
VON
TAGO
41
3.2.15.2
INSERTIONSINAKTIVIERUNG
VON
TAGE
48
N
INHALTSVERZEICHNIS
4
ERGEBNISSE
49
4.1
CHARAKTERISIERUNG
DER
STAPHYLOCOCCUS
AUREUS
AD/T4::SPC
MUTANTE
49
4.1.1
QUANTITATIVE
BESTIMMUNG
DER
BIOFILMBILDUNG
AN
POLYSTYROL
UND
GLAS
49
4.1.2
ISOLIERUNG
UND
DETEKTION
VON
PIA
51
4.1.3
UNTERSUCHUNG
ZUR
INITIALEN
ADHAESION
AN
POLYSTYROL
51
4.1.4
DER
EINFLUSS
VON
KATIONEN
AUF
DIE
BIOFILMBILDUNG
53
4.1.5
INTERAKTION
MIT
CYTOCHROM
C
IN
ANWESENHEIT
VON
MGCL
2
55
4.1.6
DER
EINFLUSS
VON
EDTA
AUF
DIE
BIOFILMBILDUNG
AN
POLYSTYROL
56
4.1.7
DER
EINFLUSS
VON
EDTA
AUF
DIE
INITIALE
ADHAESION
AN
POLYSTYROL
56
4.1.8
VERGLEICH
DER
OBERFLAECHEN-ASSOZIIERTEN
PROTEINE
57
4.2
IDENTIFIZIERUNG
VON
WTA-MUTANTEN
DURCH
SUCHE
NACH
59
PHAGENRESISTENTEN
S.
AUREUS
MUTANTEN
4.2.1
IDENTIFIZIERUNG
DES
TAGL3
VON
S.
AUREUS
60
4.2.1.1
VERGLEICH
DER
TAG73-SEQUENZ
MIT
DATENBANKEN
63
4.2.1.2
HYDROPHOBIZITAETSDIAGRAMM
VON
TAGL3
65
4.2.2
CHARAKTERISIERUNG
DER
PHAGENRESISTENTEN
K72
TRANSPOSON-MUTANTE
66
4.2.2.1
HYDROPHOBIZITAETSDIAGRAMM
VON
SAL
173
68
43
REPIACEMENT
VON
TAGE
DURCH
ERMB
69
4.3.1
CHARAKTERISIERUNG
VON
TAGE
AUS
S.
AUREUS
SA1
13
69
4.3.1.1
HYDROPHOBIZITAETSDIAGRAMME
VON
TAGEL
UND
TAGE2
70
4.3.1.2
KONSTRUKTION
DES
REPLACEMENTS
VON
TAGEL
UND
TAGEL
71
4.4
PHAENOTYPISCHE
CHARAKTERISIERUNG
DER
MUTANTEN
S.
AUREUS
A/UGL3::TN91
7,
S.
AUREUS
K72
UND
S.
AUREUS
ATAGE::ERMB
72
4.4.1
MUTANTEN-SPEZIFISCHE
WACHSTUMSKURVEN
73
4.4.2
UNTERSUCHUNGEN
ZUM
WTA-GEHALT
73
4.4.3
UNTERSUCHUNGEN
ZUR
BIOFILMBILDENDEN-AKTIVITAET
UND
PHAGENSENSITIVITAET
76
4.5
REPIACEMENT
VON
TAGO
DURCH
ERMB
77
4.5.1
HYDROPHOBIZITAETDIAGRAMM
VON
TAGO
78
4.5.2
KONSTRUKTION
DES
REPLACEMENTS
VON
TAGO
78
5
DISKUSSION
81
5.1
FUNKTION
DES
DLTA
IM
BEZUG
AUF
DIE
BIOFILMBILDUNG
BEI
S.AUREUS
81
5.1.1
BIOFILMBILDUNG
DER
/ZT4-MUTANTE
AN
POLYSTYROL
UND
GLAS
81
5.1.2
EINFLUSS
DER
RF/M-MUTATION
UND
DER
PIA-SYNTHESE
AUF
DIE
PRIMAERADHAESION
82
BEI
S.
AUREUS
EDLTA
5.1.3
CHARAKTERISIERUNG
DER
OBERFLAECHEN-ASSOZIIERTEN
PROTEINE
VON
S.
AUREUS
83
SA1
13EDLTA::SPC
IM
VERGLEICH
ZUM
WT
5.1.4
EINFLUSS
DER
J/M-MUTATION
AUF
DIE
OBFLAECHENSTRUKTUR
DER
MUTANTE
84
M
INHALTSVERZEICHNIS
5.2
INTERAKTIONEN
VON
IONEN,
EDTA
UND
CYTOCHROM
C
MIT
AUREUS
86
5.2.1
DER
EINFLUSS
VON
MG
2+
,
CA
2+
,
NA
+
UND
K
+
AUF
DIE
BIOFILMBILDUNG
86
5.2.2
INTERAKTION
VON
CYTOCHROM
C
IN
ANWESENHEIT
VON
MG
2+
MIT
87
S.
AUREUS
TSDLTA
5.2.3
EINFLUSS
VON
EDTA
AUF
DIE
PRIMAERADHAESION
87
53
CHARAKTERISIERUNG
PHAGENRESISTENTER
TRANSPOSON-MUTANTEN
88
5.3.1
DIE
TAG/3-TRANSPOSON-MUTANTE
88
5.3.2
DIE
K72-TRANSPOSON-MUTANTE
90
5.4
PHAENOTYPISCHE
CHARAKTERISIERUNG
VON
S.AUREUS
ATAGL3::TN9/7,
91
S.
AUREUS
K72
UND
AUREUS
AIAGEV.ERMB
53
REPLACEMENT
VON
TAGO
93
5.6
AUSBLICK
93
6
LITERATUR
95
6.1
PUBLIKATIONEN
106
7
ANHANG
107
7.1
GENOMSEQUENZ
DES
TAGL3
107
7.2
GENOMSEQUENZ
DES
SALI
73
124
73
GENOMSEQUENZ
DES
TAGEL
126
7.4
GENOMSEQUENZ
DES
TAGE2
128
7.5
GENOMSEQUENZ
DES
TAGO
130
IV |
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