Versuche zur Differenzierung von Unterpopulationen von Plasmopara halstedii, dem Falschen Mehltau der Sonnenblume, mit molekularbiologischen Techniken:
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| Published: |
Beuren ; Stuttgart
Grauer
2001
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| adam_text | Titel: Versuche zur Differenzierung von Unterpopulationen von Plasmopara halstedii, dem Falschen Mehltau de
Autor: Intelmann, Frederik
Jahr: 2001
Inhalt
Abkürzungen und Symbole
1 Einleitung ............................................................1
.1 Geschichte und Biologie des Pathogens..................................1
.2 Sonnenblumenanbau und Bekämpfung des Pathogens........................3
.3 Differenzierung unterschiedlich virulenter Untergruppen („Pathotypen ) des
Pathogens ........................................................4
.4 Problematik der Differentiallinientests ...................................5
.5 Alternative Differenzierungsmethoden und derzeitiger Stand der Forschung.......6
.6 Ziele dieser Arbeit ..................................................7
.7 RFLP-Anah/se des mitochondrialen Genoms ..............................8
1.8 PCR-Fingerprinting .................................................8
1.9 Inhalte dieser Arbeit................................................13
2 Material und Methoden.................................................15
2.1 Chemikalien- und Gerätehersteiler, Software ............................. 15
2.2 Gewinnung von Zoosporangien von Plasmopara halstedii................... 18
2.3 Isolation und Restriktionsverdau der mitochondrialen DNA von Plasmopara
hahtedii......................................................... 19
2.4 PCR mit Mikrosatelliten- und Simple-Sequence-Primern .................... 24
2.5 PCR-Amplifikation der ITS- und IGS-Region ............................ 29
2.6 Restriktionsverdau der IGS-Region.................................... 30
2.7 Gelelektrophorese ................................................. 31
2.8 Bilddokumentation und Auswertung ................................... 33
2.9 Hybridisierungen mit DNA-Fragmenten aus Plasmopara hahtedii............. 34
3 Ergebnisse...........................................................37
3.1 Analyse der mitochondrialen DNA von Plasmopara hahtedii.................37
3.2 PCR-Fingerprinting mit Mikrosatelliten- und Simple-Sequence-Primern ........47
3.3 Analyse der ribosomalen DNA von Plasmopara hahtedii....................98
3.4 Dot Bkrt-Hybridisierungen mit DNA-Fragmenten aus Plasmopara hahtedii.....108
4 Diskussion..........................................................115
4.1 RFLP-Analyse der mitochondrialen DNA von Plasmopara hahtedii ..........115
4.2 PCR-Fingerprinting mit Mikrosatelliten- und Simple-Sequence-Primern und
Analyse der ribosomalen DNA.......................................116
4.3 Dot Bkrt-Hybridisieningen mh DNA-Fragmenten von Plasmopara hahtedii .... 121
4.4 Fazit der vorgestellten Versuche und Ausblick...........................124
5 Zusammenfassung....................................................125
Literatur ............................................................. 127
Anhang: Tabellen und Listen..............................................139
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