Forensische DNA-Analytik: methodische, spurenkundliche und populationsgenetische Betrachtungen unter besonderer Berücksichtigung mitochondrialer DNA-Polymorphismen
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INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS.1
1
EINLEITUNG-.-.^.3
.3
.3
.3
.4
.7
.12
.13
.14
14
YY14
.16
.16
.17
.21
.24
.24
.25
1
.
1
ALLGEMEINER UEBERBLICK .
1.2 ENTWICKLUNG DER FORENSISCHEN SEROLOGIE.
1.2.1 PROTEINPOLYMORPHISMEN.
1.2.2 NUKLEAERE DNA-POLYMORPHISMEN.
1.2.2.1 MINISATELLITEN.
1.2.2.2 MIKROSATELLITEN.
1.2.2.3 Y-CHROMOSOMALE STR-SYSTEME.
1.2.2.4 HOMOLOGE DNA-POLYMORPHISMEN ZWISCHEN X- UND Y- CHROMOSOM.
1.2.2.5 RAPD-PCR.
1.2.3 MITOCHONDRIALE DNA - POLYMORPHISMEN.
1.2.3.1 STRUKTURELLER AUFBAU DER MITOCHONDRIALEN DNA.
1.2.3.2 REPLIKATION UND TRANSKRIPTION DER MITOCHONDRIALEN DNA.
1.2.3.3 BESONDERE EIGENSCHAFTEN DER MITOCHONDRIALEN DNA.
1.2.3.4 MITOCHONDRIALE DNA IN DER SPURENKUNDE.
1.2.3.5 MITOCHONDRIALE DNA UND DIE EVOLUTION DES MENSCHEN.
1.3
AUFGABENSTELLUNG.
1.3.1 MITOCHONDRIALE DNA
.
1.3.2 SHORT TANDEM REPEATS.
1.3.3 DNA-ISOLATIONSMETHODEN.26
2 ABKUERZUNGEN.-28
3 MATERIAL UND METHODEN
.M.M.YY.M.~.~.~.
30
3.1 MATERIAL.30
3.1.1 GERAETE.30
3.1.2 VERBRAUCHSMATERIALIEN.31
3.1.3 CHEMIKALIEN.32
3.1.4 BENOETIGTE PUFFER.
3.1.5 OLIGONUKLEOTIDE.
3.1.6 BIOLOGISCHES MATERIAL.
3.2 METHODEN.
3.2.1 DNA-EXTRAKTION
.
3.2.1.1 CHELEXEXTRAKTION (WALSH ET AL. 1991).
3.2.1.2 PHENOL-CHLOROFORM-EXTRAKTION (HOFF-OLSEN ET AL. 1999).
3.2.1.3 DNA-EXTRAKTION MIT PEQGOLD TRIFAST
YY
(PEQLAB/ERLANGEN).
3.2.1.4 DNA-EXTRAKTION AUS VOLLBLUT (MILLER ET AL. 1988).
3.2.1.5 DNA-EXTRAKTIONSPROTOKOLLE AUS PARAFFIN .
3.2.1.6 DNA-EXTRAKTION AUS KNOCHENMATERIAL.
3.2.1.7 DNA-EXTRAKTION AUS URIN.
3.2.2 DNA-AUFREINIGUNG
.
3.2.2.1 DNA-AUFREINIGUNG MITTELS DIATOMEENERDE (GUENTHER ET AL. 1995).
3.2.2.2 AUFREINIGUNG VON PCR-PRODUKTEN.
3.2.2.3 AUFREINIGUNG VON SEQUENZIERUNGSPRODUKTEN.
3.2.3 DNA - KONZENTRATIONSBESTIMMUNG.47
3.2.4 POLYMERASEKETTENREAKTION (PCR).48
3.2.5 SEQUENZIERUNG.51
3.2.6 RESTRIKTIONSVERDAU
.52
3.2.7 DNA-AUFTRENNUNG.53
3.2.7.1 POLYACRYLAMID-GEL-ELEKTROPHORESE (PAGE).53
3.2.7.2 HOCHAUFLOESENDE KAPILLARELEKTROPHORESE.55
3.2.8 HAPLOGRUPPENZUORDNUNG MITOCHONDRIALER SEQUENZEN.58
3.2.9 STATISTISCHE ERFASSUNG MITOCHONDRIALER SEQUENZEN.59
3.2.10 HETEROZYGOTENRATE UND DISKRIMINATIONSSTAERKE BEI NUKLEAEREN
DNA-POLYMORPHISMEN.60
4 ERGEBNISSE.61
4.1 MITOCHONDRIALE DNA.61
4.1.1 INTERPRETATION PROBLEMATISCHER SEQUENZEN.61
4.1.2 SEQUENZPOLYMORPHISMEN IN EINER DEUTSCHEN BEVOELKERUNGSSTICHPROBE.65
1
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
HTTP://D-NB.INFO/965149803
4.1.3 SEQUENZPOLYMORPHISMEN IN ANDEREN POPULATIONSSTICHPROBEN
.
70
4.1.4 ANWENDUNGSBEISPIELFIIR MITOCHONDRIALE DNA IN DER SPURENKUNDE
.
72
4.1.5 UNTERSUCHUNG WEITERER NICHT KODIERENDER MITOCHONDRIALER BEREICHE
.
74
4.1.6 MUTATIONSHAEUFIGKEITEN BEI DER MITOCHONDRIALEN DNA
.
75
4.1.7 SPEZIESBESTIMMUNG MITTELS DES MITOCHONDRIALEN CYTOCHROM B GENES
.
75
4.2
ETABLIERUNG VON STR-SYSTEMEN.78
4.2.1 DER GESCHLECHTSMARKER AMELOGENIN
.
78
4.2.2 AUTOSOMALE STR-SYSTEME
.
79
4.2.2.1 D3S1358.80
4.2.2.2 D8S1179.81
4.2.2.3D18S51. 82
4.2.2.4D21S11.83
4.2.2.5 STATISTISCHE AUSWERTUNG.85
4.2.3 DAS GONOSOMALE STR-SYSTEM DYS 385
.
85
4.2.4 DER AMPFLSTR* PROFILER* MULTIPLEX (ABI) UND DIE MUTATIONSRATE VON
STR-SYSTEMEN
.
87
4.3 DNA-EXTRAKTIONSMETHODEN.88
4.3.1 DNA-EXTRAKTION AUS IN PARAFFIN EINGEBETTETEM GEWEBE
.
88
4.3.2 DNA-EXTRAKTION AUS URIN
.
90
4.3.3 DNA-EXTRAKTION AUS GEWEBEN
.
92
4.3.4 DNA-EXTRAKTION AUS KNOCHENGEWEBE
.
94
5 DISKUSSION.
._._._. 96
5.1 MITOCHONDRIALE DNA.96
5.1.1 INTERPRETATION PROBLEMATISCHER SEQUENZEN
.
96
5.1.2 SEQUENZPOLYMORPHISMEN IN EINER DEUTSCHEN BEVOELKERUNGSSTICHPROBE
.
98
5.1.3 SEQUENZPOLYMORPHISMEN ANDERER POPULATIONEN
.
100
5.1.4 HAPLOGRUPPENPOLYMORPHISMEN
.
104
5.1.5 ANWENDUNGSBEISPIEL FIIR MITOCHONDRIALE DNA IN DER SPURENKUNDE
.
114
5.1.6 AUSWEITUNG DER MITOCHONDRIALEN DNA-ANALYSE AUF HVIII UND NC 1-4
.
115
5.1.7 MUTATIONSHAEUFIGKEITEN BEI DER MITOCHONDRIALEN DNA
.
116
5.1.8 SPEZIESBESTIMMUNG ANHAND DER MITOCHONDRIALEN DNA
.
116
5.2 ETABLIERUNG VON STR-SYSTEMEN.118
5.2.1 DER GESCHLECHTSMARKER AMELOGENIN
.
118
5.2.2 DIE STR-SYSTEME D3S1358, D8S1179, D18S51 UNDD21SLL
.
118
5.2.3 DAS GONOSOMALE STR-SYSTEM DYS385
.
119
5.2.4 AMPFLSTR
PROFILER* (ABI) UND DIE MUTATIONSRATE VON STR-SYSTEMEN
.
120
5.3 DNA - EXTRAKTIONSMETHODEN.122
5.3.1 DNA-EXTRAKTION AUS IN PARAFFIN EINGEBETTETEM GEWEBE
.
122
5.3.2 DNA-EXTRAKTION AUS URIN
.
124
5.3.3 DNA-EXTRAKTION AUS GEWEBEN
.
125
5.3.4 DNA-EXTRAKTION AUS KNOCHENMATERIAL
.
125
6 ZUSAMMENFASSUNG_._127
7 SUMMARY-.-----._129
8
LITERATURVERZEICHNIS.
131
9 ANHANG.---.---A-L
ANHANG I (DEUTSCHE).A-2
ANHANG II (DEUTSCHE / HV1).A-L 1
ANHANG III (TUERKEN / HV1).A-L 2
ANHANG IV (AETHIOPIER / HV L).A-13
ANHANG V (CHINESEN / HVL).A-L 4
2 |
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