Entwicklung und Anwendung von Mikrohybridisierungsverfahren zur Detektion und Identifizierung von Enterokokken in der Wasser- und Lebensmittelanalytik:
Gespeichert in:
| 1. Verfasser: | |
|---|---|
| Format: | Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
München
Verl. Dr. Hut
2002
|
| Ausgabe: | 1. Aufl. |
| Schriftenreihe: | Molekularbiologie
|
| Schlagworte: | |
| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | Zugl.: München, Techn. Univ., Diss., 2002 |
| Beschreibung: | V, 142 S. Ill., graph. Darst. : 21 cm |
| ISBN: | 3934767605 |
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I
NHALTSVERZEICHNIS
A
E
INLEITUNG
1
1
2
3
4
4.1
4.2
4.3
4.4
5
6
GESCHICHTE
UND
PHYLOGENIE
DER
ENTEROKOKKEN
1
PHYSIOLOGISCHE
CHARAKTERISTIKA
DER
ENTEROKOKKEN
4
VORKOMMEN
DER
ENTEROKOKKEN
6
BEDEUTUNG
DER
ENTEROKOKKEN
6
BEDEUTUNG
ALS
PROBIOTIKUM
6
BEDEUTUNG
ALS
LEBENSMITTELVERDERBER
7
BEDEUTUNG
ALS
PATHOGENE
7
BEDEUTUNG
IN
DER
HYGIENISCHEN
TRINKWASSER
UND
LEBENSMITTELKONTROLLE
8
DETEKTION
DER
ENTEROKOKKEN
10
ZIELE
DIESER
ARBEIT
13
B
M
ATERIAL
UND
M
ETHODEN
14
1
2
3
4
4.1
4.2
4.3
4.4
4.5
5
6
7
7.1
7.2
8
MIKROORGANISMEN
14
NAEHRMEDIEN
15
ZELLANZUCHT
UND
STAMMHALTUNG
17
DNS-ISOLIERUNG
17
DNS-ISOLIERUNG
NACH
MARMUR
(1961,
MOD.)
17
DNS-ISOLIERUNG
NACH
WISOTZKEY
ET
AL.
(1990,
MOD.)
19
DNS-ISOLIERUNG
NACH
STAHL
UND
FLESHER
(1987,
MOD.)
20
DNS-ISOLIERUNG
NACH
ZHOU
ET
AL.
(1996,
MOD.)
21
DNS-ISOLIERUNG
MIT
FASTDNAYYKIT
MH
/
BEADBEATING
22
PHOTOMETRISCHE
KONZENTRATIONSBESTIMMUNG
VON
NUKLEINSAEUREN
22
AGAROSEGELELEKTROPHORESE
23
OLIGONUKLEOTIDE
FUER
PCR
UND
SEQUENZIERTECHNIKEN
25
PCR-PRIMER
25
SEQUENZIERPRIMER
26
IN
VITRO
AMPLIFIKATION
UND
MARKIERUNG
VON
DNS
MITTELS
DER
POLYMERASEKETTENREAKTION
(PCR)
NACH
SAIKI
ET
AL.
(1988)
26
8.1
8.2
8.2.1
8.2.2
8.2.3
8.3
8.3.1
8.3.2
8.3.3
8.3.4
8.4
9
9.1
9.2
10
ALLGEMEINES
26
PCR-SYSTEME
27
TAQPCR
CORE
KITYY
(QIAGEN,
HILDEN,
D)
27
EXPAND
HIGH
FIDELITYYY
(ROCHE,
MANNHEIM,
D)
28
EX
TAQYY
(TAKARA
SHUZO
CO.,
OTSU,
J)
28
MARKIERUNG
DER
DNS
WAEHREND
DER
PCR
29
MARKIERUNG
MIT
DIGOXIGENIN
(DIG)
29
MARKIERUNG
MIT
FLUORESCEIN
(FLUOS)
29
MARKIERUNG
MIT
CY3
BZW.
CY5
29
MARKIERUNG
MIT
BIOTIN
30
AUFREINIGUNG
DER
PCR-PRODUKTE
30
SEQUENZANALYSE
VON
DNS
30
SEQUENZIERREAKTION
30
POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE
31
AUSWERTUNG
DER
SEQUENZDATEN
UND
SONDENKONSTRUKTION
32
II
I
NHALTSVERZEICHNIS
10.1
ALIGNMENTERSTELLUNG
32
10.2
STAMMBAUMREKONSTRUKTION
32
10.3
SONDENKONSTRUKTION
33
11
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
IN
DER
MIKROTITERPLATTE
34
11.1
SYSTEM
1A:
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
OHNE
TETRAMETHYLAMMONIUMCHLORID
(TMACI)
(KOOB,
1997,
MOD.)
34
11.2
SYSTEM
2:
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
MIT
TMACI
IN
DER
WASCHLOESUNG
(KOOB,
1997,
MOD.)
36
11.3
SYSTEM
3:
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
MIT
TMACI
IN
HYBRIDISIERUNGS
UND
WASCHLOESUNG
(GRAF,
1998,
MOD.)
37
11.4
DENATURIERUNG
DER
AMPLIFIKATE
38
11.4.1
THERMISCHE
DENATURIERUNG
38
11.4.2
ALKALISCHE
DENATURIERUNG
38
11.4.3
THERMISCHE
DENATURIERUNG
IN
DER
MIKROTITERPLATTE
38
12
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
AUF
DNS-CHIPS
39
12.1
SYSTEM
1B:
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
OHNE
TMACI
(ANONYM,
2000,
MOD.)
39
12.2
SYSTEM
2:
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
MIT
TMACI
IN
DER
WASCHLOESUNG
42
12.3
SYSTEM
3:
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
MIT
TMACI
IN
HYBRIDISIERUNGS
UND
WASCHLOESUNG
43
13
FLUORESZENZ-IN-SFTU-HYBRIDISIERUNG
(FISH)
(MANZ
ET
AL.,
1992,
MOD.)
44
14
ANALYSE
VON
SPEISEEISPROBEN
46
C
E
RGEBNISSE
47
1
SEQUENZANALYSE
RIBOSOMALER
DNS
47
2
ENTWICKLUNG
EINES
RRNS-GERICHTETEN
SONDENSATZES
FUER
ENTEROKOKKEN
49
3
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
IN
DER
MIKROTITERPLATTE
56
3.1
IMMOBILISIERUNG
56
3.1.1
TRAEGERMATERIAL
56
3.1.2
MODIFIKATION
DER
OLIGONUKLEOTIDE
56
3.1.3
IMMOBILISIERUNGSBEDINGUNGEN
58
3.2
DENATURIERUNGSBEDINGUNGEN
58
3.3
HYBRIDISIERUNGS
UND
WASCHBEDINGUNGEN
59
3.4
AUTOMATISCHES
WASCHEN
63
4
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
AUF
DNS-CHIPS
63
4.1
SONDENVERLAENGERUNG
AM
5
'
-ENDE
64
4.2
HYBRIDISIERUNGS
UND
WASCHBEDINGUNGEN
65
4.3
DETEKTION
68
4.3.1
CY-MARKIERTES
DUTP
68
4.3.2
BIOTINMARKIERTES
DUTP
69
5
EVALUIERUNG
DER
ENTEROKOKKENSONDEN
IN
DER
MIKROTITERPLATTE
UND
AUF
DNS-CHIPS
70
6
EVALUIERUNG
VON
SONDEN
FUER
IN
KLAERANLAGEN
RELEVANTE
BAKTERIEN
76
7
UNTERSUCHUNG
VON
REALPROBEN
84
7.1
UNTERSUCHUNG
VON
KLAERSCHLAMMPROBEN
84
7.1.1
UNTERSUCHUNG
AUF
ENTEROKOKKEN
84
7.1.2
UNTERSUCHUNG
AUF
AMMONIUM
UND
NITRITOXIDIERER
86
7.2
UNTERSUCHUNG
VON
QUELLWASSER
91
7.3
UNTERSUCHUNG
VON
SPEISEEIS
95
III
I
NHALTSVERZEICHNIS
D
D
ISKUSSION
99
1
SEQUENZANALYSE
99
2
HIERARCHISCHER
SONDENSATZ
FUER
ENTEROKOKKEN
101
2.1
ALLGEMEINES
101
2.2
SONDENKONSTRUKTION
UND
-EVALUIERUNG
103
2.3
BESONDERHEITEN
107
2.3.1
BESONDERHEITEN
EINIGER
SONDEN
IN
DER
MIKROTITERPLATTE
107
2.3.2
BESONDERHEITEN
EINIGER
SONDEN
AUF
DNS-CHIPS
108
2.3.3
BESONDERHEITEN
EINIGER
SONDEN
108
3
SONDEN
FUER
IN
KLAERANLAGEN
RELEVANTE
BAKTERIEN
110
4
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
IN
DER
MIKROTITERPLATTE
111
4.1
IMMOBILISIERUNG
111
4.1.1
TRAEGERMATERIAL
111
4.1.2
MODIFIKATION
DER
OLIGONUKLEOTIDE
113
4.2
DENATURIERUNGSBEDINGUNGEN
115
4.3
HYBRIDISIERUNGS
UND
WASCHBEDINGUNGEN
115
4.4
HYBRIDISIERUNGSDAUER
117
4.5
DETEKTION
117
4.6
LAGERFAEHIGKEIT
UND
REHYBRIDISIERUNG
117
5
REVERSE
HYBRIDISIERUNG
AUF
DNS-CHIPS
118
5.1
ARRAYER
118
5.2
IMMOBILISIERUNG
118
5.3
SONDENVERLAENGERUNG
AM
5
'
-ENDE
119
5.4
HYBRIDISIERUNGS
UND
WASCHBEDINGUNGEN
120
5.5
DETEKTION
121
6
UNTERSUCHUNG
VON
REALPROBEN
121
7
AUSBLICK
124
E
Z
USAMMENFASSUNG
125
F
L
ITERATUR
G
A
NHANG
126
138 |
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| spelling | Behr, Thomas Michael Verfasser aut Entwicklung und Anwendung von Mikrohybridisierungsverfahren zur Detektion und Identifizierung von Enterokokken in der Wasser- und Lebensmittelanalytik Thomas Behr 1. Aufl. München Verl. Dr. Hut 2002 V, 142 S. Ill., graph. Darst. : 21 cm txt rdacontent n rdamedia nc rdacarrier Molekularbiologie Zugl.: München, Techn. Univ., Diss., 2002 Enterococcus (DE-588)4152340-4 gnd rswk-swf DNS-Sonde (DE-588)4253911-0 gnd rswk-swf Identifikation (DE-588)4072712-9 gnd rswk-swf (DE-588)4113937-9 Hochschulschrift gnd-content Enterococcus (DE-588)4152340-4 s Identifikation (DE-588)4072712-9 s DNS-Sonde (DE-588)4253911-0 s DE-604 DNB Datenaustausch application/pdf http://bvbr.bib-bvb.de:8991/F?func=service&doc_library=BVB01&local_base=BVB01&doc_number=009873543&sequence=000001&line_number=0001&func_code=DB_RECORDS&service_type=MEDIA Inhaltsverzeichnis |
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| title | Entwicklung und Anwendung von Mikrohybridisierungsverfahren zur Detektion und Identifizierung von Enterokokken in der Wasser- und Lebensmittelanalytik |
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| title_full | Entwicklung und Anwendung von Mikrohybridisierungsverfahren zur Detektion und Identifizierung von Enterokokken in der Wasser- und Lebensmittelanalytik Thomas Behr |
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