Tex aus Bordetella pertussis definiert eine neue Familie von Nukleinsäure-Bindeproteinen:
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INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS
ZUSAMMENFASSUNG.1
ABSTRACT.2
EINLEITUNG. 3
TEX AUS BORDETELLA PERTUSSIS DEFINIERT EINE NEUE FAMILIE VON
PROKARYONTISCHEN
PROTEINEN.3
DER MANNITOL-REPRESSOR VON
E. COLI.6
DAS RIBOSOMALE PROTEIN S1 UND ANDERE PROTEINE MIT DER SL-DOMAENE.7
ERGEBNISSE.12
VERBREITUNG VON TEX IN ANDEREN BAKTERIEN.12
DELETION VON TEX IN E. COLI.15
PHAENOTYPANALYSE DER TEX-MUTANTEN IN E. COLI.17
TRANSKRIPTION VON TEX IN E. COLI.~.20
REINIGUNG VON TEX AUS E. COLI. 22
DIE BINDUNG VON TEX AN NUKLEINSAEUREN. 25
GELRETARDATIONSEXPERIMENTE.25
FESTPHASEN-BINDEASSAYS.26
ANREICHERUNG UND KLONIERUNG VON BINDESEQUENZEN.31
DISKUSSION.33
VERBREITUNG VON TEX IN ANDEREN BAKTERIEN.33
DELETION VON TEX IN E. COLI.34
TRANSKRIPTION VON TEX IN E. COLI.35
BINDUNG VON TEX AUS E. COLI AN NUKLEINSAEUREN.36
ANREICHERUNG UND KLONIERUNG VON BINDESEQUENZEN.39
MATERIAL UND METHODEN.41
GERAETE.41
CHEMIKALIEN, ENZYME UND FERTIGSAETZE ("KITS").41
BAKTERIENSTAEMME. 41
VEKTOREN UND PLASMIDE.42
OLIGONUKLEOTIDE.43
KULTURMEDIEN.43
ARBEITEN MIT DNA.44
AGAROSEGELELEKTROPHORESE.44
PRAEPARATION CHROMOSOMALER DNA AUS GRAM' BAKTERIEN.46
PRAEPARATION VON PLASMID-DNA AUS E. COLI IM KLEINEN MASS STAB
(MINIPREP).47
PRAEPARATION VON PLASMID-DNA AUS E. COLI IM MITTLEREM MASS STAB
(MIDIPREP).48
PRAEPARATION VON A, PHAGEN-DNA AUS FLUESSIGEN LYSATEN.48
PRAEPARATION VON DNA AUS AGAROSEGELEN.48
V
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
HTTP://D-NB.INFO/963088939
INHALTSVERZEICHNIS
POLYMERASE-KETTENREAKTION (PCR).48
GLAETTEN UND PHOSPHORYLIEREN VON PCR-PRODUKTEN.49
VERDAU VON DNA MIT RESTRIKTIONSENDONUKLEASEN.50
ALKALISCHE PHOSPHATASE-BEHANDLUNG.50
LIGATION.50
TRANSFORMATION VON KOMPETENTEN
E. COLI.51
KONJUGATION VON PLASMIDEN IN BORDETELLA-STAEMME.51
HYBRIDISIERUNG VON DNA-FRAGMENTEN MIT MARKIERTEN DNA-SONDEN (SOUTHERN
BLOT). 51
SEQUENZIERUNG VON DOPPELSTRAENGIGER PLASMID DNA (T7SEQUENCING
YY
KIT,
PHARMACIA).52
ALLELAUSTAUSCHMUTAGENESE.53
ARBEITEN MIT RNA.54
EIN-SCHRITT-RNA-PRAE PARATION AUS BAKTERIEN ABGEWANDELT NACH CHOMCZYNSKI,
P.
UND SACCHI, N. (1987). 54
DREI-DETERGENZIEN-METHODE ZUR PRAEPARATION VON RNA AUS GRAM" BAKTERIEN
(SYN
ET AL., 1999). 55
FORMALDEHYD-AGAROSEGELELEKTROPHORESE.56
PRIMER EXTENSION.57
ARBEITEN MIT PROTEINEN.58
SDS-POLYACRYLAMID-GELELEKTROPHORESE (SDS-PAGE).58
ZWEIDIMENSIONALE (2 D-) GELELEKTROPHORESE.59
SILBER-FAERBUNG VON SDS-PAA-GELEN.60
UEBEREXPRESSION UND REINIGUNG MIT DEM QIAEXPRESSIONIST-SYSTEM (QIAGEN).61
KONZENTRATIONSBESTIMMUNG VON PROTEINEN.63
WESTERN BLOT.63
GELRETARDATIONSEXPERIMENTE.64
FESTPHASEN BINDEASSAYS.66
LITERATUR.68
LEBENSLAUF./.76
PUBLIKATIONSLISTE.77
ABKUE RZUNGS VERZEICHNIS.78
ANHANG.81
DNA SEQUENZ DES TEX-LOCUS IN E.
COLI K12 UND LAGE DER VERWENDETEN
OLIGONUKLEOTIDE.81
DATEN DER BINDUNG VON NUKLEINSAEUREN AN VERSCHIEDENE CTEX DERIVATE.84
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