Poisson-Approximationen für genetische Fingerabdrücke:
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1999
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INHALTSVERZEICHNIS
EINLEITUNG
S
0.1
FRAGESTELLUNG
.
5
0.2
ABHAENGIGKEITEN
ZWISCHEN
DEN
RAPD-BANDEN,
IM
JUKES-CANTOR-MODELL
.
6
0.3
VORGEHENSWEISE
.
8
DANKSAGUNG
.
10
1
POISSON-APPROXIMATION
FUER
DIE
EVOLUTION
DER
MUSTER
11
1.1
ZWEI
MODELLE
FUER
DIE
EVOLUTION
DER
MUSTER
.
11
1.1.1
ALLGEMEINES
.
11
1.1.2
DIE
EVOLUTION
DER
MUSTER
IM
JUKES-CANTOR-MODELL
.
12
1.1.3
EIN
MODELL
MIT
UNABHAENGIG
EVOLVIERENDEN
MUSTERN
.
12
1.2
EXKURS
UEBER
POISSON-APPROXIMATIONEN
UND
DEN
TOTALVARIATIONSABSTAND
.
13
1.3
ABSTAND
DER
BEIDEN
MODELLE
IN
HINBLICK
AUF
DIE
GENETISCHEN
FINGERABDRUECKE
DER
BLAETTER
.
15
1.3.1
EINE
ABSCHAETZUNG
FUER
^
A
^((Z ))
.
23
1.3.2
EIN
BEISPIEL
.
25
1.4
FAZIT
.
31
2
POISSON-APPROXIMATION
FUER
DIE
BANDENKONFLGURATION
32
2.1
EIN
BEISPIEL
ZUR
PROBLEMATIK
.
32
2.2
EIN
POISSON-MODELL
FUER
DIE
BANDENKONFIGURATIONEN
.
33
2.2.1
ZUR
APPROXIMATIONSGUETE
DES
POISSON-MODELLS
.
34
2.2.2
DIE
BERECHNUNG
VON
G,
EI
UND
EJ
.
36
2.3
EIN
POISSON-CLUSTER-MODELL
FUER
DIE
BANDENKONFIGURATIONEN
.
42
2.3.1
VERNACHLAESSIGBARE
ABHAENGIGKEITEN
ZWISCHEN
DEN
KLUMPEN
.
43
2.3.2
WIEVIELE
KLUMPEN
GIBT
ES
VON
WELCHEM
TYP?
.
46
2.3.3
SCHRANKEN
FUER
DEN
ERWARTETEN
ANTEIL
AN
KLUMPEN
MIT
MEHR
ALS
EINER
BANDE
46
2.3.4
SIMULATION
VON
KLUMPEN
.
49
2.4
FAZIT
.
51
3
STAMMBAUMREKONSTRUKTION
MIT
RAPD-DATEN
52
3.1
MOEGLICHE
PROBLEME
DER
STAMMBAUMREKONSTRUKTION
MIT
RAPD-DATEN
.
53
3.2
SZENARIO
UND
ART
DER
SIMULIERTEN
DATEN
.
53
3.3
METHODEN
DER
TOPOLOGIESCHAETZUNG
.
54
3.4
SIMULATIONSERGEBNISSE
UND
ERSTE
INTERPRETATIONEN
.
57
3.4.1
ZUR
ROBUSTHEIT
VON
MLJ
.
58
3.4.2
VERGLEICH
DER
METHODEN
ZUR
TOPOLOGIESCHAETZUNG
AUF
DER
BASIS
VON
D
111
61
3.5
FAZIT
.
70
A
MOLEKULARGENETISCHE
GRUNDLAGEN
72
A.L
DIE
DESOXYRIBONUKLEINSAEURE
(DNA)
.
72
A.2
DIE
POLYMERASEKETTENREAKTION
(PCR)
.
.
.
.
73
A.3
GENETISCHE
FINGERABRUECKE
MIT
DER
RAPD-PCR
.
74
B
SPIELEN
KONKURRIERENDE
RAPD-BANDEN
EINE
ROLLE?
76
B.L
MODELL
EINER
PCR
MIT
UEBERLAPPENDEN
BANDEN
.
76
B.2
ERWARTUNGSWERTE
UND
ASYMPTOTISCHE
BETRACHTUNGEN
.
78
B.3
ERWARTUNGSWERTE
UND
VARIANZEN
NACH
40
ZYKLEN
.
80
B.4
FAZIT
.
84
C
MUSTER
UND
BANDEN
AUF
EINEM
DNA-STRANG
86
C.L
POISSON-APPROXIMATION
FUER
MUSTER-KONFIGURATIONEN
AUF
DER
DNA
.
86
C.2
POISSON-APPROXIMATIONEN
FUER
KLUMPEN
VON
MUSTERN
.
88
C.3
ABSTAENDE
ZWISCHEN
MUSTERN
AUF
DER
DNA
.
91
C.3.1
APPROXIMATION
VON
N
AB
M
T
HILFE
VON
X
UND
Y
.
92
C.3.2
DIE
VERTEILUNGSGEWICHTE
P
N
VON
N
AB
.
94
C.3.3
BEISPIEL
.
100
C.4
BANDEN
AUF
EINEM
DNA-STRANG
.
101
C.5
FAZIT
.
103
LITERATUR
104
4 |
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