Strategien zur Markersättigung im Bereich des rym4-Resistenzlocus bei der Gerste:
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| Published: |
Aachen
Shaker
2000
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| Edition: | Als Ms. gedr. |
| Series: | Berichte aus der Agrarwissenschaft
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| Item Description: | Zugl.: München, Techn. Univ., Diss., 1999 |
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|---|---|
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INHALTSVERZEICHNIS
_
VII
INHALTSVERZEICHNIS
1
EINLEITUNG
.
1
2
LITERATURUEBERSICHT
.
2
2.1
DIE
GELBMOSAIKVIROSE
DER
GERSTE
UND
IHRE
BEKAEMPFUNG
.
2
2.2
MOLEKULARE
MARKER
UND IHRE
EINSATZMOEGLICHKEITEN
.
5
2.3
GENOMISCHE
DNA-BANKEN
.
11
2.4
KLONIERTE
RESISTENZGENE
BEI
PFLANZEN
.
13
3
MATERIAL
UND
METHODEN
.
18
3.1
PFLANZENMATERIAL
.
18
3.2
GENOMISCHE
DNA-BANKEN
.
20
33
DNA-LAENGENSTANDARDS
.
20
3.4
HYBRIDISIERUNGSSONDEN
UND
PCR-PRIMER
.
21
3.5
STANDARDMETHODEN
.
21
3.5.1
ISOLIERUNG GENOMISCHER
DNA
.
21
3.5.2
RESTRIKTIONSVERDAUUNG,
AGAROSE-GEL-ELEKTROPHORESE
UND
SOUTHERN-TRANSFER
.
22
3.5.3
HERSTELLUNG
UND
TRANSFORMATION
GEFRIERKOMPETENTER
ZELLEN
.
22
3.5.4
PLASMIDISOLATION
.
23
3.5.5
SONDENPRAEPARATION
UND
RADIOAKTIVE
MARKIERUNG
.
23
3.5.6
DNA-HYBRIDISIERUNG
.
24
3.5.7
POLYMERASE-KETTEN-REAKTION
(PCR)
.
25
3.5.8
KLONIERUNG VON
PCR-FRAGMENTEN
IN
PLASMIDE
.
25
3.5.9
SEQUENZANALYSE
.
26
3.6
AFLP-ANALYSE
.
26
3.6.1
AFLP-ANALYSE
MIT
RADIOAKTIV
MARKIERTEM
PRIMER
.
27
3.6.2
MULTIFLUOROPHORE AFLP-ANALYSE
.
29
3.6.3
KLONIERUNG VON
AFLP-FRAGMENTEN
.
29
3.6.4
KONVERTIERUNG VON
AFLP-FRAGMENTEN
IN
STS-MARKER
.
30
3.7
YAC
UND
BAC-TECHNIKEN
.
32
3.7.1
SCREENING
VON
YAC-POOLS
.
32
3.7.2
YAC-GROESSENBESTIMMUNG
.
32
3.7.3
ISOLATION VON
GENOMISCHER
HEFE-DNA
.
33
3.7.4
ANALYSE
VON
YAC-ENDEN
.
33
3.7.5
BAC-SCREENING
.
35
3.7.6
BAC-ISOLATION
.
35
3.7.7
ISOLIERUNG VON
BAC-END
SEQUENZEN
.
36
INHALTSVERZEICHNIS
_
VIII
4
ERGEBNISSE
.37
4.1
AFLP-ANALYSE
.
37
4.1.1
MARKERSCREENING
NACH
DER
YYBULKED
SEGREGANT
"
METHODE
.
37
4.1.1.1
SCREENING
MIT
POOLINDIVIDUEN
DER
IF-DH
POPULATION
.
37
4.1.1.2
SCREENING
MIT
DNA-POOLS
DER
HOCHAUFLOESENDEN
IF
POPULATION
.
40
4.1.2
AFLP
SCREENING
MIT
NILS
.
41
4.1.3
ANALYSE
VON
AFLP-FRAGMENTEN
.
47
4.1.3.1
KLONIERUNG
UND
SEQUENZIERUNG
VON
AFLP-FRAGMENTEN
.
48
4.1.3.2
VERLAENGERUNG
DER
AFLP-FRAGMENTE
.
51
4.1.3.3
UMWANDLUNG
VON
AFLPS
IN
STS-MARKER
.
52
4.2
PHYSIKALISCHE
KARTIERUNG
.
58
4.2.1
SICHTUNG
GENOMISCHER
DNA-BANKEN
.
58
4.2.1.1
YAC-BIBLIOTHEK
.
58
4.2.1.2
BAC-BIBLIOTHEK
.
61
4.2.2
CONTIG-ERSTELLUNG
.
63
4.2.2.1
YACS
.
63
4.2.2.1.1
ISOLATION
UND
ANALYSE
DER
YAC-ENDEN
.
63
4.2.2.1.2
KONVERSION
VON
YAC-ENDEN
IN
PCR-MARKER
.
66
4.2.2.1.3
ERSTELLUNG
EINES
YAC-CONTIGS
.
67
4.2.2.2
BACS
.
68
4.2.2.2.
1
ISOLATION
UND
ANALYSE
DER
BAC-ENDSEQUENZEN
.
68
4.2.2.2.2
KONVERSION
VON
BAC-ENDEN
IN
PCR-MARKER
.
69
4.2.2.2.3
ERSTELLUNG
EINES
BAC-CONTIG
.
71
4.3
GENETISCHE
KARTIERUNG
.
72
4.4
GENETISCH-PHYSIKALISCHE
BEZIEHUNGEN
IM
BEREICH
DES
RYNTI
RESISTENZLOCUS
.
73
5
DISKUSSION.
76
5.1
HOCHAUFLOESENDE
KARTIERUNG
DER
RYM4
REGION
.
76
5.1.1
STRATEGIEN
ZUR
MARKERSAETTIGUNG
.
76
5.1.2
MARKERSELEKTION
MIT
PFLANZENMATERIAL
UNTERSCHIEDLICHER
GENOMISCHER
KONSTITUTUION
79
5.1.3
KONVERSION
VON
AFLPS,
YAC
UND
BAC-ENDSEQUENZEN
IN
POLYMORPHE
STSS
.
84
5.1.4
MOEGLICHKEITEN
ZUR
PHYSIKALISCHEN
ANALYSE
VON
DEFINIERTEN
OENOMREGIONEN
.
86
5.2
INTEGRATION
PHYSIKALISCHER
UND
GENETISCHER
KARTEN
.
90
5.3
STRATEGIEN
ZUR
ISOLIERUNG
DES
RPM4
RESISTENZGENS
.
92
6
ZUSAMMENFASSUNG
.95
7
LITERATURVERZEICHNIS.
96
8
ANHANG
.
111 |
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