Markerkarten für acht Chromosomen und erste QTL-Analyse an deutschen Milchrinder-Familien:
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Kiel
Inst. für Tierzucht und Tierhaltung d. Agrarwiss. Fak. d. Univ.
1997
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INHALTSVERZEICHNIS:
SEITE
VERZEICHNIS
DER
ABKUERZUNGEN
I
VERZEICHNIS
DER
ABBILDUNGEN
UI
VERZEICHNIS
DER
TABELLEN
IV
SEITE
1
EINLEITUNG
1
2
LITERATURUEBERSICHT
3
2.1
MIKROSATELLITEN
3
2.1.1
DEFINITION
UND
EIGENSCHAFTEN
3
2.1.2
AMPLIFIKATION
DER
MIKROSATELLITEN
6
2.1.3
DETEKTION
DER
PCR-PRODUKTE
8
2.1.3.1
POLYACRYLAMIDGEL
-
ELEKTROPHORESE
8
2.1.3.2
AUTOMATISIERTE
DETEKTION
FLUORESZENZMARKIERTER
PCR-PRODUKTE
9
2.1.3.3
AUSWERTUNG
DER
ELEKTROPHORESEERGEBNISSE
10
2.1.4
GENKARTEN
DES
RINDES
10
2.2.
QTL-KARTIERUNG
13
2.2.1
BIOMETRISCHE
GRUNDLAGEN
13
2.2.1.1
UNTERSUCHUNG
VON
SAX
13
2.2.1.2
KREUZUNG
ZWISCHEN
INZUCHTLINIEN
14
2.2.1.3
KREUZUNG
ZWISCHEN
FREI
SEGREGIERENDEN
POPULATIONEN
16
2.2.2
GRUNDSCHAETZVERLAHREN
17
2.2.2.1
ANNAHME
FIIR
QTL
ANALYSE
17
2.2.2.2
LINEARES
MODELL
17
2.2.23
MAXIMIUM-LIKELIHOOD-METHODE
18
2.2.3
DESIGN
20
2.2.3.1
INZUCHTLINIEN
ALS
AUSGANGSPOPULATION
20
2.2.3.2
FREI
SEGREGIERENDE
POPULATIONEN
21
2.2.4
WEITERE
METHODEN
DER
QTL-ANALYSE
24
2.2.4.1
HASEMAN-ELSTON
REGRESSION
24
2.2.4.2
HALEY-KNOTT
REGRESSION
25
2.2.4.3
LIKELIHOOD
FUNKTION
MIT
ZWEI
MARKERN
27
2.2.5
QTL
BEIM
RIND
28
2.3
MARKERGESTUETZTE
SELEKTION
29
3
MATERIAL
UND
METHODEN
31
3.1
DAS
ADR
PROJEKT
"
GENOMANALYSE
RIND
"
31
3.2
TIERE
32
3.3
MERKMALE
33
3.4
MATERIALIEN
FUER
DIE
MOLEKULARGENETISCHE
UNTERSUCHUNG
36
3.5
EXTRAKTION
DER
DNA
AUS
SPERMA
38
3.6
AUSWAHL
DER
MIKROSATELLITEN
39
3.7
PCR-BEDINGUNGEN
42
3.7.1
PCR-PROGRAMM
42
3.7.2
OPTIMIERUNG
DER
REAKTIONSBEDINGUNGEN
DER
MIKROSATELLITEN
43
3.7.3
OPTIMIERUNG
DER
MULTIPLEX-PCR
REAKTIONSBEDINGUNGEN
44
3.8
DARSTELLUNG
DER
MIKROSATELLITEN
44
3.9
TYPISIERUNG
DER
MIKROSATELLITEN
47
3.10
METHODE
DER
AUSWERTUNG
49
3.10.1
DATENBANK
49
3.10.2
INFOMATIONSGEHALT
DER
MIKROSATELLITEN
49
3.10.3
GENETISCHE
KARTEN
DER
TYPISIERUNGSERGEBNISSE
50
3.10.4
QTL-ANALYSE
51
4
ERGEBNIS
53
4.1
OPTIMIERUNG
DER
PCR-BEDINGUNGEN
53
4.2
VORKOMMEN
DER
MUETTERLICHEN
ALLELE
UND
DEREN
FREQUENZEN
DER
UNTERSUCHTEN
MIKROSATELLITEN
56
4.3
POLYMORPHIEGRAD
DER
MIKRSATELLITEN
61
4.4
ABSTAMMUNGSUEBERPRUEFUNG
DER
RESSOURCE-FAMILIE
63
4.5
GENETISCHE
KARTEN
63
4.6
INTERVAL
MAPPING
DER
QTL
73
5
DISKUSSION
78
5.1
OPTIMIERUNG
DER
MIKROSATELLITEN
78
5.1.1
EINZELANALYSE
DER
MIKROSATELLIT
78
5.1.2
MULTIPLEX-ANALYSE
DER
MIKROSATELLITEN
79
5.2
FRAGMENTLAENGENBESTIMMUNG
80
5.3
INFORMATIONSGEHALT
81
5.4
VERGLEICH
DER
GENETISCHEN
KARTEN
82
5.5
BEHANDLUNG
VON
FAMILIEN
MIT
NULLALLELEN
83
5.6
QTL
ANALYSE
84
6
ZUSAMMENFASSUNG
86
7
SUMMARY
88
8
LITERATURVERZEICHNIS
89
9
ANHANG
104 |
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