Identifizierung und Unterscheidung von Bakterien mit der Infrarot-Fourier-Transformations-Spektroskopie:
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1997
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INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS
.5
1
EINLEITUNG
.7
1.1 VORBEMERKUNGEN.7
1.2 AUFGABENSTELLUNG.9
2
MATERIAL
UND
METHODEN
.11
2.1 FT-IR-SPEKTROSKOPIE.11
2.1.1 PRINZIP DER FT-IR-SPEKTROSKOPIE.11
2.1.2 FT-IR-SPEKTROMETER.7.14
2.1.3 KONTROLLEN ZUR SPEKTRENMESSUNG.14
2.1.4 PROBENANZUCHT UND -PRAEPARATION.15
2.1.5 SPEKTRENMESSUNG.16
2.1.6 WELLENZAHLBEREICHE (SPEKTRALE FENSTER).16
2.1.7 ABLEITUNG DER SPEKTREN.17
2.1.8 QUALITAETSPRUEFUNG DER SPEKTREN.17
2.1.9 DIE SPEKTRALE DISTANZ D.18
2.1.10 CLUSTERANALYSE.20
2.1.11 IDENTITAETSANALYSE.22
2.1.12 REPRODUKTIONSNIVEAU.23
2.2 KONVENTIONELLE DIFFERENZIERUNGSMETHODE.23
2.2.1 MIKROSKOPISCHE UND BIOCHEMISCHE STANDARDUNTERSUCHUNGEN.23
2.2.1.1 KULTURMEDIEN UND -BEDINGUNGEN.24
2.2.1.2'REAGENZIEN FUER MIKROSKOPISCHE UND BIOCHEMISCHE
STANDARDUNTERSUCHUNGEN.24
2.2.1.3 MIKROSKOPISCHE STANDARDUNTERSUCHUNGEN.25
2.2.1.4 BIOCHEMISCHE STANDARDUNTERSUCHUNGEN.26
2.2.1.5 AUSWERTUNG DER MIKROSKOPISCHEN UND BIOCHEMISCHEN
STANDARD-UNTERSUCHUNGEN.27
2.2.2 API
YY
-DIFFERENZIERUNGSSYSTEME.28
2.2.2.1 KULTURMEDIEN UND -BEDINGUNGEN.29
2.2.2.2 REAGENZIEN.29
2.2.2.3 PRINZIP DER API-DIFFERENZIERUNGSSYSTEME.30
2.3 BAKTERIEN UND BAKTERIEN-SPEKTREN.35
2.3.1 BAKTERIEN UND BAKTERIENSPEKTREN ZUR ERSTELLUNG EINER
REFERENZKEIM-DATENBANK.35
2.3.2 BAKTERIEN UND BAKTERIENSPEKTREN ZUR ERPROBUNG DES SYSTEMATISIERTEN
FT-IR-
IDENTIFIZIERUNGSVORGANGES.40
2.3.3 BAKTERIEN AUS BETRIEBSHYGIENISCHEN UNTERSUCHUNGEN.41
2.3 .4 BAKTERIEN FUER EPIDEMIOLOGISCHE UNTERSUCHUNGEN MIT DER
FT-IR-SPEKTROSKOPIE.42
2.3.5 AUFBEWAHRUNG DER BAKTERIEN.42
1
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
HTTP://D-NB.INFO/952786966
3 ERGEBNISSE.
_.43
3.1. AUFBAU DER REFERENZKEIM-DATENBANK.
43
3.1.1. KOMPATIBILITAET VON FREMDSPEKTREN MIT LABOREIGENEN SPEKTREN.43
3 .1.2. KORRELATION DER SPEKTRALEN DISTANZEN ZU TAXONOMISCHEN EBENEN.46
3.1.2.1 TAXONOMISCHE PROBLEMSTELLUNG.46
3.1.2.2 AUSWERTUNGSPARAMETER.
48
3.1.2.3 REPRODUKTIONSNIVEAU UND DURCHSCHNITTLICHE SPEKTROSKOPISCHE
VARIANZ VON SPEKTREN AUF UNTER
SCHIEDLICHEN TAXONOMISCHEN HIERARCHIESTUFEN. 48
3.1.3 SYSTEMATISIERUNG DER FT-IR-IDENTIFIZIERUNG.54
3.1.3.1 DEFINITIONEN. 54
3.1.3.2 FT-IR-SPEKTROSKOPISCHE VORUNTERSUCHUNGEN.56
3.1.3.3 IDENTIFIZIERUNGSSCHEMA AUF DER BASIS SPEKTRALER GRUPPEN.61
3.1.3.4 ERPROBUNG DER SYSTEMATISIERTEN FT-IR-IDENTIFIZIERUNG MIT
MIKROORGANISMEN BEKANNTER IDENTITAET80
3.2 ANWENDUNG DER FT-IR-SPEKTROSKOPIE IM ROUTINEBETRIEB DER
PHARMAZEUTISCHEN INDUSTRIE.
88
3.2.1 IDENTIFIZIERUNG VON KEIMEN AUS REINRAEUMEN.88
3.2.1.1 KONVENTIONELLE KEIMDIFFERENZIERUNG.90
3.2.1.2 FT-IR-SPEKTROSKOPISCHE IDENTIFIZIERUNG.90
3.2.1.3 GEGENUEBERSTELLUNG DA ERGEBNISSE.
90
3.2.1.4 KEIMPROFILE DER REINRAEUME.92
3.2.2 IDENTIFIZIERUNG VON KEIMEN AUS EINEM ZU QUALIFIZIERENDEN RAUM.97
3.2.3 WIEDERERKENNUNG VON MIKROORGANISMEN ZUR ERFASSUNG VON
KONTAMINATIONSQUELLEN.101
3.2.3.1 WIEDERERKENNUNG VON MIKROORGANISMEN NACH LYOPHILISIERUNG EINER
BEIMPFTEN PRODUKTLOESUNG 101
3.2.3.2 ERKENNUNG VON SEKUNDAERKONTAMINATIONEN.103
3.3 EPIDEMIOLOGISCHE UNTERSUCHUNGEN MIT DER FT-IR-SPEKTROSKOPIE.105
3.3.1 IDENTIFIZIERUNG UND UNTERSCHEIDUNG VON STAPHYLOCOCCUS
AUREUS-STAEMMEN.105
3.3.1.1 BESTIMMUNG DER WIEDERFUNDQUOTEN VON S.AUREUS-STAEMMEN ANHAND VON
IDENTITAETSANALYSEN. 105
3.3.1.2 UNTERSCHEIDUNG VON S.AUREUS-STAEMMEN MIT DA CLUSTERANALYSE.108
3.3.2 UNTERSCHEIDUNG UND IDENTIFIZIERUNG VON KLEBSIELLEN.114
3.3.2
.1 UNTERSCHEIDUNG DER KLEBSIELLEN MIT DER CLUSTOANALYSE.115
3.3.2 2 BESTIMMUNG DER WIEDERFUNDQUOTEN ANHAND VON
IDENTITAETSANALYSEN.118
4 DISKUSSION.
121
4.1 DISKUSSION ZUM AUFBAU DER REFERENZKEIM-DATENBANK.121
4.1.1. KOMPATIBILITAET VON FREMDSPEKTREN MIT LABOREIGENEN SPEKTREN.121
4.1.2. BEURTEILUNG DER BEZIEHUNG ZWISCHEN SPEKTRALEN DISTANZEN ZU
TAXONOMISCHEN EBENEN . 122
4.1.3 DIE SYSTEMATISIERTE FT-IR-IDENTIFIZIERUNG.125
4.1.3.1 FT-IR-SPEKTROSKOPISCHE VORUNTERSUCHUNGEN.125
4.1.3.2 DAS IDENTIFIZIERUNGSSCHEMA UND DIE IHM ZUGRUNDELIEGENDEN
SPEKTRALEN GRUPPEN.126
4.1.3.4 ZUORDNUNGSGRENZEN ZU SPEKTRALEN GRUPPEN.134
4.1.3.4 MOEGLICHKEITEN UND GRENZEN DA FT-IR-IDENTIFIZIERUNG.135
4.2 DISKUSSION ZUR ANWENDUNG DER FT-IR-SPEKTROSKOPIE IM ROUTINEBETRIEB
DER PH
ARMAZEUTISCHEN
INDUSTRIE.138
4.2.1 DISKUSSION ZUR IDENTIFIZIERUNG VON KEIMEN AUS REINRAEUMEN.138
4.2.1.1 BEURTEILUNG DA KONVENTIONELLEN KEIMDIFFERENZIERUNGSMETHODE.138
4.2.1.2 BEURTEILUNG DA FT-IR-SPEKTROSKOPIE.140
4.2.1.3 LEISTUNGSFAEHIGKEIT DA FT-IR-SPEKTROSKOPIE IM VAGLEICH ZUR
KONVENTIONELLEN DIFFERENZIERUNGL40
4.2.1.4 KEIMPROFILE.141
2
4.2.2 IDENTIFIZIERUNG VON KEIMEN AUS EINEM ZU QUALIFIZIERENDEN RAUM.147
4.2.2.1 LEISTUNGSFAEHIGKEIT DER FT-IR-SPEKTROSKOPIE.147
4.2.2.2 KEIMPROFILE.148
4.2.3 WIEDEREIKENNUNG VON MIKROORGANISMEN ZUR ERFASSUNG VON
KONTAMINATIONSQUELLEN.149
4.3 DISKUSSION DER EPIDEMIOLOGISCHEN UNTERSUCHUNGEN MIT DER
FT-IR-SPEKTROSKOPIE.150
4.3.1 IDENTIFIZIERUNG UND UNTERSCHEIDUNG VON S.AUREUS-STAEMMEN.150
4.3.2 UNTERSCHEIDUNG UND IDENTIFIZIERUNG VON KLEBSIELLEN.151
5 SCHLUSSFOLGERUNG.155
\
6 ZUSAMMENFASSUNG.159
7 LITERATURVERZEICHNIS. .163
\
8 LEBENSLAUF.181
9 DANKSAGUNG.183
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