Analyse der 5'-flankierenden Region von kernkodierten Untereinheiten der plastidären ATP-Synthase aus Spinat (Spinacia oleracea L.):
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adam_text | ANALYSE DER 5 -FLANKIERENDEN REGION VON KERNKODIERTEN UNTEREINHEITEN DER
PLASTIDAEREN ATP-SYNTHASE AUS SPINAT (SPINACIA OLERACEA L.)
INAUGURAL-DISSERTATION ZUR ERLANGUNG DES DOKTORGRADES DER FAKULTAET FUER
BIOLOGIE DER LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN VORGELEGT VON
CORDELIA BOLLE AUS MUENCHEN 1995 INHALTSVERZEICHNIS INHALTSVERZEICHNIS
ABKUERZUNGEN 5 1 ZUSAMMENFASSUNG . 7 2 EINLEITUNG 10 2.1 DIE PLASTIDAERE
ATP-SYNTHASE UND DEREN KERNKODIERTE UNTEREINHEITEN 10 2.2
LICHTPERZEPTION UND SIGNALTRANSDUKTION 13 2.3 REGULATION DER
GENEXPRESSION DURCH CIS-ELEMENTE UND TRANSFAKTOREN 18 3 MATERIAL UND
METHODEN 24 3.1 CHEMIKALIEN UND ENZYME 24 3.2 BAKTERIENSTAEMME 24 3.3
VEKTOREN 24 3.4 PFLANZENMATERIAL .- 24 5.5 METHODEN ZUR ANALYSE VON DNA
25 3.5.1 CHARAKTERISIERUNG UND REINIGUNGVON DNA 25 3.5.1.1 ALLGEMEINE
METHODEN 25 3.5.1.2 REINIGUNG UND ELUTION VON DNA MIT HILFE VON
GLASMILCH 25 3.5.1.3 SEQUENZREAKTIONEN 25 3.5.1.4 ISOLATION VON
GENOMISCHER DNA 26 3.5.2 HERSTELLUNG UND ANALYSE REKOMBINANTER KLONE 26
3.5.2.1 ALLGEMEINE METHODEN 26 3.5.2.2 KOLONIEHYBRIDISIERUNG (VERAENDERT
NACH GRUNSTEIN UND HOGNESS 1975) . 26 3.5.2.3 HERSTELLUNG VON
EINZELSTRAENGIGER ODER DOPPELSTRAENGIGER RADIOAKTIV MARKIERTER DNA MITTELS
DER PCR 27 3.5.2.4 RADIOAKTIVE MARKIERUNG DER DNA-FRAGMENTE MIT HILFE
DES KLENOW-ENZYMS 28 3.5.2.5 REINIGUNG DER MARKIERTEN FRAGMENTE 28
3.5.2.5.1 ABTRENNUNG NICHT-EINGEBAUTER NUKLEOTIDE MITTELS EINER SAEULE
... 28 3.5.2.5.2 REINIGUNG UEBER EIN POLYACRYLAMID-GEL 29 3.5.2.6
HYBRIDISIEREN VON FILTERN MIT IMMOBILISIERTER DNA ODER RNA 29 3.5.2.7
EINFUEHREN VON SEQUENZSPEZIFISCHEN MUTATIONEN 30 3.5.2.8 ISOLATION UND
ANALYSE VON PHAGEN-DNA 31 3.5.2.8.1 SICHTEN VON CDNA UND GENOMISCHEN
PHAGENBAENKEN (BENTON UND DAVIS 1977) 31 3.5.2.8.2 ISOLATION VON
PHAGEN-DNA 32 INHALTSVERZEICHNIS 3.6 METHODEN ZUR ANALYSE VON RNA 33
3.6.1 CHARAKTERISIERUNG UND REINIGUNG VON RNA 33 3.6.1.1 ISOLATION VON
RNA AUS PFLANZENGEWEBE 33 3.6.1.2 ANREICHERUNG VON POLY(A) + - RNA 34
3.6.1.3 GELSYSTEM 34 3.6.2 QUANTIFIZIERUNG VON RNA 34 3.6.2.1 DOT
BLOT -ANALYSE 34 3.6.2.2 NORTHERN BLOT -ANALYSE 34 3.6.2.3 QUANTITATIVE
PCR (QPCR) 35 3.6.2.4 ISOLATION VON KERNEN UND RUN ON -TRANSKRIPTION 37
3.7 ANALYSE VON DNA-PROTEIN WECHSELWIRKUNGEN 39 3.7.1 PROTEINEXTRAKTE 39
3.7.1.1 KERNPROTEINEXTRAKTION AUS TABAK NACH TITTGEN (1985), VERAENDERT
VON PROF. DR. S. SOPORY 39 . 3.7.1.2 KERNPROTEINEXTRAKTION AUS
BLUMENKOHLINFLORESZENZEN 40 3.7.1.3 UEBEREXPRESSION VON PROTEINEN IN
PHAGEN 41 3.7.2 GELRETARDIERUNG 42 3.7.3 SOUTH-WESTERN -ANALYSE (SINGH
ET AL. 1988) :.....-... 43 3.7.4 SICHTEN EINER CDNA-BANK MIT ANTIKOERPERN
ODER DER SOUTH-WESTERN - METHODE 44 3.8 HERSTELLUNG UND ANALYSE VON
TRANSGENEM PFLANZENMATERIAL 45 3.8.1 TABAK-TRANSFORMATION 45 3.8.1.1
KONJUGATIVER TRANSFER EINES PLASMIDS VON E. COLI IN AGROBACTERIUM
TUMEFACIENS TTRIPARENTAL MATING , BEVAN 1984) 45 3.8.1.2 TRANSFORMATION
VON TABAKPFLANZEN NACH DER LEAF-DISC -METHODE (HORSCH ET AL. 1985) 46
3.8.1.3 TRANSIENTE TRANSFORMATION VON TABAKKEIMLINGEN (ROSSI ET AL.
1993) . . 47 3.8.2 ANALYSE DES TRANSGENEN TABAKS 48 3.8.2.1
PHYSIOLOGISCHE ANALYSE DER KEIMLINGE 48 3.8.2.2 FLUOROMETRISCHER
GUS-TEST 49 3.8.2.3 IN WVO-FAERBUNG VON KEIMLINGEN 49 3.9
COMPUTERANALYSEN 50 INHALTSVERZEICHNIS 4 ERGEBNISSE 51 4.1
PROMOTOR-ANALYSE DES ATPC-GENS 51 4.1.1 CHARAKTERISIERUNG EINES
GENOMISCHEN /IRPC-KLONS AUS SPINAT 51 4.1.2 IDENTIFIKATION ESSENTIELLER
PROMOTORBEREICHE DURCH FUSION VON 5 -VERKUERZTEN PROMOTORFRAGMENTEN VON
ATPC MIT EINEM REPORTERGEN 51 4.1.3 PHYSIOLOGISCHE UNTERSUCHUNGEN DER
PROMOTORDELETIONEN VON ATPC 56 4.1.3.1 LICHTABHAENGIGE EXPRESSION 56
4.1.3.2 UNTERSUCHUNGEN ZUR WIRKUNG VON BLAULICHT UND ROTLICHT BEI DER
INDUKTION DER GUS-AKTIVITAET 58 4.1.3.3. ABHAENGIGKEIT DER
GUS-GENEXPRESSION VOM ENTWICKLUNGSZUSTAND DER PIASTIDEN 59 4.1.3.4
ENTWICKLUNGSSPEZIFISCHE UNTERSCHIEDE BEI DER EXPRESSION DER CHIMAEREN
/4RPC/GUS-FUSIONEN 60 4.1.3.5 GEWEBE- UND ORGANSPEZIFISCHE EXPRESSION 60
4.1.3.6 CHROMOSOMALE UMGEBUNG 62 4.1.4 NAEHERE CHARAKTERISIERUNG DES
BEREICHS -73/ + 173 . . ., 63 4.1.5 PHYSIOLOGISCHE UNTERSUCHUNGEN AN DEN
PROMOTOR-/MINIMALPROMOTORFUSIONEN UND DEN MUTANTEN IN DER F,-GENERATION
65 4.1.6 INTERAKTION VON EXPRESSIONSRELEVANTEN ,4# C-PROMOTORFRAGMENTEN
MIT KERNPROTEINEN IN VITRO . 70 4.2 VERGLEICH VON ATPC UND ATPD AUF DER
MRNA-EBENE . . 73 4.3 PHYSIOLOGISCHE ANALYSEN AN KEIMLINGEN MIT
PROMOTORFRAGMENTEN UND 5 -DELETIONEN VON ATPD 74 4.3.1 LICHTABHAENGIGE
EXPRESSION 74 4.3.2 GEWEBESPEZIFISCHE EXPRESSION 76 4.3.3
PLASTIDENABHAENGIGE EXPRESSION 76 4.4 UNTERSUCHUNGEN AN LEADER
SEQUENZEN 78 4.4.1 3 -DELETIONEN VON -4FPC- LEADER -SEQUENZEN 78 4.4.2
3 -DELETIONEN DER LEADER -REGION VON VERSCHIEDENEN GENEN FUER PROTEINE
DER THYLAKOIDMEMBRAN 80 4.4.3 SEQUENZVERGLEICHE 80 4.4.4 ANALYSE DER
STABILEN AKKUMULATION DER GUS-MRNA IN TRANSGENEM TABAK . . 82 4.4.5
ANALYSE DER TRANSKRIPTIONSAKTIVITAET 84 4.4.6 WEITERE EVIDENZ FUER DIE
TRANSKRIPTIONELLE WIRKUNG DER LEADER -REGION DES PSAF-GENA 85 4.4.7
INSERTION DER LEADER -SEQUENZ VON ATPC ZWISCHEN DEN CAMV-PROMOTOR UND
DAS GUS-GEN 86 4.4.8 MUTATION DES CT-REICHEN LEADER -MOTIVS 87 4.4.9
INTERAKTION DER LEADER -SEQUENZEN MIT KERNPROTEINEN IN VITRO 87 4.4.10
3 -DELETIONEN DER PEFE- LEADER -SEQUENZEN 89 4.5 VERGLEICH VON STABILER
UND TRANSIENTER TRANSFORMATION 90 INHALTSVERZEICHNIS 4.6 ANALYSE
DNA-BINDENDER FAKTOREN 90 4.6.1 SEQUENZIERUNG VON GENOMISCHEN
LEUZIN- ZIPPER -KLONEN 90 4.6.2 IDENTIFIZIERUNG VON PROTEINEN, DIE AN
DIE LEADER -BEREICHE VON ATPC BINDEN . 97 4.6.2.1
SOUTH-WESTERN -ANALYSE 97 4.6.2.2 SICHTEN EINER CDNA-BANK MIT EINEM
CT-LB OLIGONUKLEOTID 97 4.6.2.3 FUNKTIONELLE ANALYSE VON CT4 102 4.6.2.4
NORTHERN - UND SOUTHERN -ANALYSE 102 4.6.3 ISOLIERUNG VON CDNAS FUER
KERNPROTEINE 103 4.6.3.1 SICHTEN VON CDNA-BANKEN MIT ANTIKOERPERN 103
4.6.3.2 ANALYSE DER SEQUENZ DER ISOLIERTEN KLONE 103 4.6.3.3
FUNKTIONELLE ANALYSE DER CDNAS FUER KERNPROTEINE 107 4.6.3.4 NORTHERN -
UND SOUTHERN -ANALYSE 108 5 DISKUSSION 109 5./ ZIELE DIESER ARBEIT .,
109 5.2 CH-ELEMENTE BEI ATPC UND ATPD 110 5.3- QUANTITATIVE EXPRESSION
VON ATPC UND ATPD 110 5.4 QUALITATIVE EXPRESSION VON ATPC UND ATPD 112
5.5 DIE FUNKTION DER TRANSKRIBIERTEN, ABER NICHT TRANSLATIERTEN
LEADER -SEQUENZEN 117 5.6 EVOLUTIONAERE ASPEKTE 121 5.7 DIE GRENZEN DER
UNTERSUCHUNGEN MIT DEM GUS-REPORTERGEN IN TRANSGENEN PFLANZEN 122 5.8
ANALYSE DNA-BINDENDER PROTEINE 123 5.8.1 LEUZIN- ZIPPER -PROTEINE 123
5.8.2 CT-BINDENDE PROTEINE 124 5.8.3 RGG-PROTEINE 125 5.9
POSTTRANSKRIPTIONELLE REGULATION 127 ANHANG 129 AI SEQUENZIEREN EINER
S-ADENOSYTMETHIONIN-DECARBOXYLASE 12 9 A2 AUFLISTUNG DER PFLANZENGENE IN
DER EMBL-DATENBANK (AUSGABE 41), DIE DAS CT-LB-MOTIV ZU MINDESTENS 80%
KONSERVIERT ENTHALTEN 132 A3 UEBERSICHT UEBER DIE VERWENDETEN KLONE 136 A4
UEBERSICHT UEBER DIE VERWENDETEN OLIGONUKLEOTIDE 140 LITERATURVERZEICHNIS
142 DANKSAGUNG 162 LEBENSLAUF 163 PUBLIKATIONSLISTE 164
|
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