Quantenchemische und molekülmechanische Untersuchungen an Coenzym-Substrat-Addukten des Thiamindiphosphat-Systems:
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INHALTSVERZEICHNIS
1 EINLEITUNG I
2 THEORETISCHE METHODEN ZUR BEHANDLUNG MOLEKULARER SYSTEME 5
2.1 AB INITIO-VERFAHREN 7
2.2 SEMIEMPIRISCHE METHODEN 8
2.3 MOLEKUELMECHANISCHE ANSAETZE 11
2.4 MOLEKUELDYNAMIK 13
3 VERGLEICH DER LEISTUNGSFAEHIGKEIT UND AUSSAGEKRAFT DER VERWENDETEN
METHODEN 15
3.1 PIMM- UND PM3 -UNTERSUCHUNGEN AN IONENSOLVATEN 16
3.2 BERECHNUNGEN ZUR STRUKTUR VON PHOSPHAT- UND DIPHOSPHATGRUPPEN IM
PIMM-UND PM3-VERFAHREN 19
3.3 ANPASSEN EINES MAGNESIUMPARAMETERS AN DAS CVFF-KRAFTFELD 22
4 ERGEBNISSE UND DISKUSSION ' 25
4.1 KONFORMATIVE CHARAKTERISIERUNG DER MODELLSYSTEME DURCH MOLEKUEL
MECHANISCHE UND SEMIEMPIRISCHE BERECHNUNGEN 25
4.1.1 DIE STRUKTUR DES THIAMIN-KATIONS 25
4.1.2 DAS THIAMINDIPHOSPHAT (THDP)-SYSTEM 30
4.1.3 MG2+-THIAMINDIPHOSPHAT 38
4.1.4 COENZYM-SUBSTRAT-ADDUKT-SYSTEME 43
4.1.4.1 THIAMIN-PYRUVAT- UND THIAMIN-GLYOXY LAT-ADDUKT-
STRUKTUREN 43
4.1.4.2 THIAMINDIPHOSPHAT-SUBSTRAT-ADDUKTE 49
4.1.5 THIAMIN-ANALOGA 51
4.1.5.1 6 '-METHYL-THDP-INHIBITOR-SYSTEME
DER PYRUVATDECARBOXYLASE 51
4.1.5.2 KRAFTFELDBERECHNUNGEN AN 6' -CH3 -4-H-THIAMIN-
MODELLSYSTEMEN 54
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
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4.1.5.3 PYRIDYL-THIAMIN-SYSTEME
55
4.1.6 BERECHNUNGEN PROTONIERTER THIAMIN-SYSTEME 55
4.1.6.1 MODELLBERECHNUNGEN ZUR REAKTIVITAET DES 4 -AMINO-
PYRIMIDINRINGES 56
4.1.6.2 THIAMIN- UND THDP-PROTONIERTE MODELLSYSTEME 59
4.1.6.3 TAUTOMERE STRUKTUREN DES 4'-AMINO-PYRIMIDIN-
SYSTEMS. 64
4.2 BERECHNUNG VON REAKTIONSKOORDINATEN 67
4.2.1 COENZYM-SUBSTRAT-WECHSELWIRKUNG 67
4.2.2 DIE YLIDBILDUNGSREAKTION 76
4.2.3 DIE MODELLIERUNG DER DECARBOXYLIERUNGSREAKTION 82
4.3 VERGLEICHENDE AB INITIO-, SEMIEMPIRISCHE - UND MOLEKUELMECHANISCHE
BERECHNUNGEN AN THIAZOLIUM-MODELLSYSTEMEN 92
4.4 MOLEKUELDYNAMISCHE BERECHNUNGEN 94
5 ZUSAMMENFASSUNG 100
LITERATUR
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