Charakterisierung von Helicobacter pylori-Stämmen unter Berücksichtigung der äusseren Zellmembranproteine:
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I
INHALTSVERZEICHNIS
1. EINLEITUNG 1
1.1 EINFUEHRUNG 1
1.2 DIE ENTDECKUNG VON HELICOBACTER PYLORI 2
1.2.1. BIOCHEMISCHE CHARAKTERISIERUNG 3
1.2.2. VIRULENZFAKTOREN 4
1.2.2.1. UREASE 4
1.2.2.2 CYTOTOXIN 5
1.2.2.3 MOBILITAET 5
1.2.2.4. PROTEASE 6
1.2.2.5. ADHAERENZ 7
1.2.2.6. INHIBITOR DER SAEURESEKRETION ._ 7
1.3. PHYSIOLOGIE DES MAGEN UND DES DUODENUMS 8
1.3.1. ERKRANKUNGEN DES MAGEN UND DUODENUMS 9
1.3.1.1. GASTRITIS 9
1.3.1.2. GASTRITIS TYP-A 10
1.3.1.3. GASTRITIS TYP-B 10
1.3.1.4. GASTRITIS TYP-C 11
1.3.1.5. DAS ULCUS-LEIDEN 11
1.4. DER AUFBAU DER BAKTERIENZELLWAND 12
1.4.1. DIE CYTOPLASMAMEMBRAN 13
1.4.1.2. DAS PEPTIDOGLYKAN 13
1.4.1.3. DER PERIPLASMATISCHE RAUM 14
1.4.2. DIE AEUSSERE MEMBRAN 14
1.4.2.1. DIE STRUKTUR DER AEUSSEREN MEMBRAN 14
1.5. DIVERSITAET VON H.PYLORI 15
1.6. EPIDEMIOLOGIE 16
1.7. FRAGESTELLUNG 18
2. MATERIAL UND METHODEN 20
2.1. MATERIAL 20
2.1.1. CHEMIKALIEN 20
2.1.2. ANTIKOERPER 20
2.1.3. PUFFER 20
2.1.3.1. PBS ( PHOSPHATE BUFFERED SALINE ) 20
2.1.3.2 TBS ( PHOSPHATE BUFFERED SALINE ) 20
2.1.3.3. PROBENPUFFER FUER DIE SDS-PAGE 20
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN
HTTP://D-NB.INFO/942462165
II
2.1.3.4. ELEKTRODENPUFFER FUER DIE SDS-PAGE 21
2.1.3.5. BLOTTING-PUFFER FUER WESTERN BLOTS 21
2.1.3.6. KATHODEN- UND ANODENPUFFER 21
2.1.3.7. OVERLAYPUFFER 21
2.1.3.8. LYSISPUFFER 22
2.1.4. LOESUNGEN 22
2.1.4.1. REDUKTIONSLOESUNG 22
2.1.4.2. ALKYLIERUNGSLOESUNG 22
2.1.4.3. HAEMINLOESUNG 22
2.1.4.4. LOESUNG ZUR ANFAERBUNG VON PROTEINEN NACH 22
POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE
2.1.4.5. ENTFAERBELOESUNG FUER POLYACRYLAMIDGELE 23
2.1.4.6. SILBERFAERBUNG FUER DIE ZWEI-DIMENSIONALE 23
GELELEKTROPHORESE
2.1.4.7. TRENNGEL FUER SDS-POLYACRYLAMIDGELE 23
2.1.4.8. SAMMELGEL FUER SDS-POLYACRYLAMIDGELE 24
2.1.4.9. GELLOESUNG FUER DIE ZWEI-DIMENSIONALE GEL- 24
ELEKTROPHORESE
2.1.4.10. SUBSTRATLOESUNG FUER WESTERN BLOTS 24
2.1.5. NAEHRMEDIUM 24
2.1.5.1. BLUTAGARPLATTEN 24
2.1.5.2. BHI-AGAR 25
2.1.5.3. BRUCELLA BROTH AGAR 25
2.1.5.4. BHLBOUILLON 25
2.1.5.5. BRUCELLA BROTH-BOUILLON 25
2.1.5.6. MUELLER HINTON-BOUILLON 26
2.1.6. BAKTERIEN 26
2.2. METHODEN 26
2.2.1. ISOLIERUNG UND IDENTIFIZIERUNG DER KEIME 26
2.2.2. PROTEINBESTIMMUNG 27
2.2.3. SDS-POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE (SDS-PAGE) 27
2.2.4. ZWEI-DIMENSIONALE GELELEKTROPHORESE 27
2.2.5. WESTERN BLOTTING 28
2.2.6. ULTRASCHALLBEHANDLUNG 29
2.2.7. MEMBRANISOLIERUNG DURCH SARKOSYLEXTRAKTION 29
2.2.8. STATISTISCHE METHODEN 29
2.2.8.1. DER STUDENT-T-TEST 29
2.2.8.2. DIE DISKRIMINANZ-ANALYSE 30
111
2.2.8.3. DIE CLUSTER-ANALYSE 31
2.2.8.4. METHODE FUER SDS-PAGE-AUSWERTUNG 31
3. ERGEBNISSE 33
3.1. VERGLEICH DES PROTEINPROFILS VON H.PYLORI-STAEMMEN 33
VON PATIENTEN MIT CHRONISCHER GASTRITIS UND ULCUS
DUODENI
3.1.1. UNTERSUCHUNGSGUT 33
3.1.2. STABILITAET DES PROTEINPROFILS DER AEUSSEREN MEMBRAN 35
3.1.3. ALLGEMEINE MERKMALE DES PROTEINMUSTERS NACH SDS-PAGE 38
3.1.4. ALLGEMEINE MERKMALE VON IMMUNOBLOT VON H.PYLORI- 41
STAEMMEN
3.1.5. VERGLEICH DER PROTEINPROFILE VON GASTRITIS- UND 45
ULCUSSTAEMMEN
3.1.6. AUSWERTUNG DER ZWEI-DIMENSIONALEN GELELEKTROPHORESE 54
3.1.7. NUMERISCHE ANALYSE 56
3.1.8. DISKRIMINANZ-ANALYSE 58
3.1.9. UNTERSUCHUNG DER EINWIRKUNG VON SUPPLEMENTEN AUF 60
DIE REAKTIVIERUNG VON RUNDZELLFORMEN VON H. PYLORI
3.1.10. UNTERSUCHUNG DER PROTEINZUSAMMENSETZUNG VON SPIRAL- 61
BZW. RUNDZELLFORMEN
4. DISKUSSION 62
5. ZUSAMMENFASSUNG 72
6. LITERATURVERZEICHNIS 74 |
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