Die kleinen Untereinheiten der DNA-abhängigen RNA-Polymerase von Sulfolobus acidocaldarius: Ähnlichkeiten zwischen den Transkriptionsapparaten der Archaea und der Eucarya
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|---|---|
| Format: | Thesis Book |
| Language: | German |
| Published: |
Egelsbach u.a.
Hänsel-Hohenhausen
1994
|
| Series: | Deutsche Hochschulschriften
1040 |
| Subjects: | |
| Online Access: | Inhaltsverzeichnis |
| Physical Description: | 89 S. graph. Darst. |
| ISBN: | 3826710401 |
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|---|---|
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A.
ZUSAMMENFASSUNG
.
1
B.
EINLEITUNG
.
3
C.
ERGEBNISSE
.
9
1.
STRATEGIE
DER
KLONIERUNG
DER
GENE
DER
RNAP-UNTEREINHEITEN
UND
DER
ABLEITUNG
UND
BETRACHTUNG
DER
AMINOSAEURESEQUENZEN
.
9
1.1.
AUFTRENNUNG
DER
UNTEREINHEITEN
.
9
1.2.
ANSEQUENZIERUNG
DER
PEPTIDE
.
10
1.3.
ABLEITUNG
VON
SONDEN
.
11
1.4.
DETEKTION
GENOMISCHER
DNA-FRAGMENTE
MITTELS
DER
ABGELEITETEN
SONDEN
.
11
1.5.
HERSTELLUNG
EINER
ANGEREICHERTEN
GENBANK
.
11
1.6.
IDENTIFIZIERUNG
DES
GEWUENSCHTEN
REKOMBINANTEN
PHASMIDES
.
12
1.7.
IDENTIFIZIERUNG
DER
MONIERTEN
GENE
.
12
1.8.
ABLEITUNG
DER
AMINOSAEURESEQUENZEN
.
12
1.9.
BETRACHTUNG
DER
PRIMAERSTRUKTUREN
DER
ABGELEITETEN
PROTEINE
.
12
2.
DIE
RNAP-UNTEREINHEITEN:
KLONIERUNG
DER
GENE
UND
BETRACHTUNG
DER
VON
IHNEN
ABGELEITETEN
PROTEINE
.
13
2.1.
DIE
UNTEREINHEITEN
D
UND
N
.
13
2.1.1.
KLONIERUNG
DER
GENE
DER
UNTEREINHEITEN
D
UND
N
.
13
2.1.2.
ABLEITUNG
DER
KODIERTEN
PROTEINE
.
14
2.1.3.
DIE
ORGANISATION
DER
GENE
RPOD
UND
RPON
.
19
2.1.4.
DIE
UNTEREINHEIT
D
IM
VERGLEICH
MIT
VERWANDTEN
PROTEINEN
.
20
2.1.5.
DIE
UNTEREINHEIT
N
IM
VERGLEICH
MIT
VERWANDTEN
PROTEINEN
.
24
2.2.
DIE
RNAP-UNTEREINHEIT
E
.
25
2.2.1.
KLONIERUNG
DES
GENS
DER
UNTEREINHEIT
E
.
25
2.2.2.
NUKLEOTIDSEQUENZ
UND
IDENTIFIZIERUNG
DES
GENS
RPOE.
.
26
2.2.3.
E
IM
VERGLEICH
MIT
DEN
RNAP-UNTEREINHEITEN
B16
UND
C25
.
27
2.2.4.
E
IM
VERGLEICH
MIT
DEN
PROTEINEN
DER
SL-FAMILIE
.
28
2.3.
DIE
UNTEREINHEIT
F
.
30
2.3.1.
KLONIERUNG
DES
GENS
RPOF
.
30
2.3.2.
NUKLEOTIDSEQUENZ
UND
ABGELEITETE
AMINOSAEURESEQUENZ
.
30
T
2.3.3.
BETRACHTUNG
DER
PRIMAERSTRUKTUR
DER
KOMPONENTE
F
.
31
2.4.
DIE
UNTEREINHEIT
K
.
33
2.4.1.
KLONIERUNG
DES
GENS
DER
UNTEREINHEIT
K
.
33
2.4.2.
NUKLEOTIDSEQUENZ
UND
IDENTIFIZIERUNG
DER
ABGELEITETEN
PROTEINE
.
34
2.4.3.
DIE
LAGE
DES
GENS
RPOK
VON
S.
ACIDOCALDARIUS
IM
VERGLEICH
MIT
DER
LAGE
DES
HOMOLOGEN
GENS
VON
H.
MARISMORTUI
.
36
2.4.4.
VERGLEICH
DER
UNTEREINHEIT
K
MIT
DER
HOMOLOGEN,
EUKARYALEN
RNAP
UNTEREINHEIT
ABC23
.
36
2.5.
DIE
UNTEREINHEIT
L
.
37
2.5.1.
KLONIERUNG
DES
GENS
DER
UNTEREINHEIT
L
.
38
2.5.2.
NUKEINSAEURESEQUENZ
UND
IDENTIFIZIERUNG
DER
KODIERTEN
PROTEINE
.
38
2.5.3.
DIE
UNTEREINHEIT
L
IM
VERGLEICH
MIT
DEN
HOMOLOGEN
RNAP-UNTEREINHEITEN
AC19
UND
B
12,5
DER
EUCARYA
.
40
2.6.
DIE
UNTEREINHEIT
M
.
41
3.
ANALYSE
DER
GENPRODUKTE,
DEREN
GENE
BENACHBART
DEN
GENEN
DER
RNAP
UNTEREINHEITEN
LOKALISIERT
SIND
.
42
3.1.
GENPRODUKTE
DES
RPOZMV-GENCLUSTERS
.
42
3.1.1.
DAS
RIBOSOMALE
PROTEIN
S13
IM
VERGLEICH
MIT
DEN
HOMOLOGEN
PROTEINEN
S13
DER
BACTERIA UND
S
18
DER
EUCARYA
.
43
3.1.2.
DAS
RIBOSOMALE
PROTEIN
S4
IM
VERGLEICH
MIT
DEN
HOMOLOGEN
PROTEINEN
S4
DER
BACTERIA
UND
S9
DER
EUCARYA
.
44
3.1.3.
DAS
RIBOSOMALE
PROTEIN
SIL
IM
VERGLEICH
MIT
DEN
HOMOLOGEN
PROTEINEN
SIL
DER
BACTERIA
UND
S
14
DER
EUCARYA
.
45
3.1.4.
DAS
RIBOSOMALE
PROTEIN
HL29E
IM
VERGLEICH
.
46
2.1.5.
DAS
RIBOSOMALE
PROTEIN
L13
AUS
S.
ACIDOCALDARIUS
IM
VERGLEICH
MIT
HOMOLOGEN
PROTEINEN
AUS
BACTERIA
.
46
3.1.6.
DAS
RIBOSOMALE
PROTEIN
S9
AUS
S.
ACIDOCALDARIUS
IM
VERGLEICH
MIT
DEN
HOMOLOGEN
PROTEINEN
S16
DER
EUCARYA
UND
S9
DER
BACTERIA.
.
47
3.1.7.
DAS
N-TERMINALE
FRAGMENT
DES
ORF
MSE
AUS
5.
ACIDOCALDARIUS
.
48
3.2.
DIE
GENPRODUKTE
DER
GENE
IN
DER
NACHBARSCHAFT
VON
RPOF
.
49
3.2.1.
ORF
MYL
.
49
3.2.2.
ORF
MIK
.
49
3.3.
DAS
GENPRODUKT
DES
ORFS
STROMAUF
VON
RPOK,
EINE
HYPOTHETISCHE
HYDROGENASE
.
49
3.4.
DAS
GENPRODUKT
DES
ORF
STROMAB
VON
RPOL,
EIN
HYPOTHETISCHER
TRANSKRIPTIONSFAKTOR
.
49
4.
DIE
SUCHE
NACH
GENEN
FUER
ARCHAEALE
TRANSKRIPTIONSFAKTOREN
.
52
D.
DISKUSSION
.
53
1.
ANORDNUNG
DER
GENE,
DIE
FUER
DIE
RNAP-UNTEREINHEITEN
AUS
S.
ACIDOCALDARIUS
KODIEREN
.
54
1.1.
GENE
MEHRERER
RNAP-UNTEREINHEITEN
IN
EINEM
GENCLUSTER
.
54
1.2.
DIE
GENFOLGE
VON
RPOL
UND
DEM
ORF
MKF,
DER
EINEN
HYPOTHETISCHEN
TRANSKRIPTIONSFAKTOR
KODIERT
.
56
1.3L
ISOLIERT
KODIERTE
GENE
VON
RNAP-UNTEREINHEITEN
.
56
2.
DIE
RIBOSOMALEN
PROTEINE
S13,
S4,
S1
1,
HL29E,
L13
UND
S9
DES
RPOD/RPON
GENCLUSTERS
.
57
3.
HOMOLOGIEN
DER
UNTEREINHEITEN
DER
RNAP
AUS
S.
ACIDOCALDARIUS
.
58
3.1.
D
UND
L,
DIE
UNTEREINHEITEN
MIT
DEM
A-MOTIV
.
60
3.2.
H,
K,
N,
DIE
UNTEREINHEITEN,
DEREN
HOMOLOGE
IN
POL
I,
POL
II
UND
POL
III
IDENTISCH
SIND
.
60
3.3.
E,
DIE
UNTEREINHEIT
DIE
HOMOLOGE
IN
POL
II
UND
POL
III
HAT,
NICHT
ABER
IN
POLL
.
61
3.4.
F,
DIE
KOMPONENTE
OHNE
HOMOLOGE
ENTSPRECHUNG
.
62
4.
TRANSKRIPTIONSFAKTOREN
AUS
S.
ACIDOCALDARIUS
.
63
4.1.
DER
ORF
MFK
KODIERT
EINEN
HYPOTHETISCHEN
TRANSKRIPTIONSFAKTOR
.
63
4.2.
HYPOTHETISCHE
TRANSKRIPTIONSFAKTOREN
BEI
S.
ACIDOCALDARIUS,
DIE
HOMOLOG
ZU
TBP
UND
TFIIB
SIND
.
65
E.
MATERIAL
UND
METHODEN
.
66
1.
MATERIAL
.
66
1.1.
BAKTERIENSTAEMME
.
66
1.2.
VEKTOREN
.
66
1.3.
BESONDERE
CHEMIKALIEN
UND
HILFSMITTEL
.
66
1.4.
ENZYME
.
67
2.
METHODEN
.
68
2.1.
PROTEINARBEITEN
.
68
2.1.1.
ISOLIERUNG
DER
RNA-POLYMERASE
AUS
S.
ACIDOCALDARIUS
.
68
2.1.2.
SDS-POLYACRYLAMID-GELELEKTROPHORESE
(PAGE)
NACH
SCHAEGGER
.
68
2.1.3.
CELLOGELELEKTROPHORESE
.
69
2.2.
KLONIERUNGEN
.
69
2.2.1.
ISOLIERUNG
VON
GESAMT-DNA
AUS
SULFOLOBUS
ACIDOCALDARIUS
.
69
2.2.2.
AGAROSEGELELEKTROPHORESE
UND
RESTRIKTIONSSPALTUNGEN
.
70
2.2.3.
SOUTHERN
TRANSFER
UND
"DOT
BLOT"
-
ANALYSE
.
70
2.2.4.
5
'-TERMINALE
MARKIERUNG
VON
OLIGONUKLEOTIDEN
.
71
2.2.5.
MARKIERUNG
DER
DNA
DURCH
RANDOM
PRIMING
.
71
2.2.6.
FILTERHYBRIDISIERUNGEN
.
71
2.2.7.
AUTORADIOGRAPHIE
.
72
2.2.8.
ISOLIERUNG
VON
DNA-FRAGMENTEN
AUS
AGAROSEGELEN
.
72
2.2.9.
DEPHOSPHORYLIERUNG
VON
VEKTOREN
.
72
2.2.10.
LIGATION
VON
DNA-FRAGMENTEN
.
73
2.2.11.
TRANSFORMATION
VON
E.
COLI
.
73
2.2.12.
KOLONIETRANSFER
UND
-HYBRDISIERUNG
.
74
2.2.13.
ISOLIERUNG
VON
PLASMID-DNA
.
74
2.2.
DNA-SEQENZIERUG
.
74
2.3.1.
ERZEUGUNG
VON
BA/-31-DELETIONSMUTANTEN
.
74
2.3.2.
EINZELSTRANGMATRITZEN
.
75
2.3.3.
DOPPELSTRANGMATRITZEN
.
75
2.3.4.
DNA-SEQUENZANALYSE
.
75
2.3.5.
SEQUENZGELE
.
76
F.
SPEZIELLE
TERMINI,
KONVENTIONEN
UND
ABKUERZUNGEN
.
77
1.
SPEZIELLE
TERMINI
.
77
2.
KONVENTIONEN
.
77
3.
ABKUERZUNGEN
.
78
3.1.
CHEMISCHE
UND
PHYSIKALISCHE
ABKUERZUNGEN
.
78
3.2.
ABKUERZUNGEN
VON
ORGANISMEN
UND
ORGANELLEN
.
79
3.3.
ABKUERZUNGEN
VON
GENEN
UND
IHRER
PRODUKTE
.
80
G.
LITERATUR
.
81
H.
LEBENSLAUF
.
89 |
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