Die Organisation des Transkriptoms im stickstofffixierenden Alphaproteobakterium Sinorhizobium meliloti:
Gespeichert in:
| 1. Verfasser: | |
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
2013
|
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| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | Enth. 6 Sonderabdr. aus verscheidenen Zeitschr. und Publ. - Beitr. engl. |
| Beschreibung: | 225 S. in getr. Zählung Ill., graph. Darst. 30 cm 1 CD-ROM |
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| adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS I
ABKUERZUNGEN III
ABBILDUNGEN IV
1 ZUSAMMENFASSUNG 1
2 EINLEITUNG 3
2.1 SINORHIZOBIUM. MCLILOTI 1021 3
2.2 REGULATION DER TRANSKRIPTION 4
2.3 NICHTKODIERENDE RNA UND RIBOREGULATION 5
2.4 SUCHE NACH REGULATORISCHEN RNA 6
2.5 SUCHE NACH NCRNA IN S. MELILOTI 7
2.6 ZIELE DIESER ARBEIT S
3 ERGEBNISSE UND DISKUSSION 9
3.1 CHIP-ANALYSEN ZUR IDENTIFIZIERUNG VON NCRNA 9
3.2 RNA-SEQ 11
3.2.1 RNA-SEQ ZUR IDENTIFIZIERUNG VON NCRNA 11
3.2.2 RNA-SEQ ZUR ANALYSE VON TSS 12
3.2.3 RNA-SEQ DES HFQ-GEBUNDENEN TRANSKRIPTOMS 12
3.3 KLASSIFIZIERUNG IDENTIFIZIERTER TRANSKRIPTE 13
3.4 INRNA-VARIANTEN 14
3.4.1 MRNA MIT 5
:
-UTR 14
3.4.2 MRNA OHNE 5
:
-UTR 15
3.4.3 MRNA MIT FUNKTIONALEN 5
:
-UTR-ELEMENTEN 15
3.5 INTERNE TRANSKRIPTE (IRNA) 17
3.6 CIS-KODIERTE ANTISENSC NCRNA (ASRNA) 17
3.6.1 FUNKTIONEN VON ASRNA IS
3.7 TNMS-KODIERTE NCRNA (SRNA) 20
3.7.1 FUNKTIONEN VON SRNA 21
3.7.2 KOMPARATIVE ANALYSEN KONSERVIERTER SRNA-DOMAENEN 23
3.7.3 EVOLUTION VON SRNA INNERHALB DER RHIZOBIALES 24
3.S HFQ-ASSOZIIERTE NCRNA UND MRNA 26
I
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INHALTSVERZEICHNIS
3.9 NICHTIDENTIFIZIERTE RNA-KLASSEN 28
3.10 TRANSKRIPTIONSSTARTS UND PROMOTORANALVSEN 28
3.11 DAS S. MELILOTI A
K2
-REGULON 29
3.12 TRANSKRIPTIONSREGULATOREN 30
4 FAZIT 32
LITERATURVERZEICHNIS 35
5 PREDICTION OF SINORHIZOBIUM MELILOTI SRNA GENES AND EXPERIMENTAL
DETECTION IN STRAIN 2011
61
5.1 EIGENER BEITRAG ZUR STUDIE 61
6 A GENOME-WIDE SURVEY OF SRNA IN THE SYMBIOTIC NITROGEN-FIXING
ALPHA-PROTEOBACTERIUM
SINORHIZOBIUM MELILOTI 87
6.1 EIGENER BEITRAG ZUR STUDIE S7
7 GLOBAL MAPPING OF TRANSCRIPTION START SITES AND PROMOTOR MOTIFS IN THE
SYMBIOTIC ALPHA-
PROTEOBACTERIUM SINORHIZOBIUM MELILOTI 1021 125
7.1 EIGENER BEITRAG ZUR STUDIE 125
8 HIGH-THROUGHPUT SEQUENCING OF THE HFQ-BONDED TRANSCRIPTOME IN THE
SYMBIOTIC
ALPHAPROTEOBACTERIUM SINORHIZOBIUM MELILOTI STRAIN 2011 (MANUSCRIPT IN
PREPARATION) 149
S.L EIGENER BEITRAG ZUR STUDIE 149
9 CONSERVATION AND OCCURRENCE OF TRANS-ENCODED SRNA IN THE RHIZOBIALES
175
9.1 EIGENER BEITRAG ZUR STUDIE 175
10 QUANTITATIVE PROTEOMIC ANALYSIS OF THE HFQ-REGULON IN SINORHIZOBIUM
MELILOTI 2011 209
10.1 EIGENER BEITRAG ZUR STUDIE 209
DANKSAGUNG 223
EIDESTATTLICHE ERKLAERUNG 225
II
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