Untersuchungen an mutmaßlichen Virulenzfaktoren von Trueperella bonasi und Trueperella bialowiezensis:
Gespeichert in:
1. Verfasser: | |
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Format: | Abschlussarbeit Buch |
Sprache: | German |
Veröffentlicht: |
Berlin
Mensch und Buch Verl.
2013 [erschienen] 2014
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Beschreibung: | Nebentitel: Investigations of possible virulence factors in Trueperella bonasi and Trueperella bialowiezensis |
Beschreibung: | XII, 179 S. Ill., graph. Darst. |
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adam_text | INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS
INHALTSVERZEICHNIS V
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS IX
1. EINFUEHRUNG - 1 -
2. LITERATUR - 3 -
2.1. WISENT - 3 -
2.1.1. DIE GESCHICHTE DES WISENTS - 3 -
2.1.2. WISENTE IM NATIONALPARK BIATOWIEZA, POLEN - 4 -
2.1.3. BIOLOGIE UND VERHALTEN DER WISENTE IM NATIONALPARK BIALOWIEZA - 4
-
2.1.4. BALANOPOSTHITIS BEIM WISENT - 5 -
2.1.5. MOEGLICHE AETIOLOGIE DER BALANOPOSTHITIS BEIM WISENT UND BEDEUTUNG
VON
T. BONASI UND T. BIALOWIEZENSIS FUER DAS KRANKHEITSGESCHEHEN - 7 -
2.2. TRUEPERELLA BONASI, TRUEPERELLA BIALOWIEZENSIS, TRUEPERELLA
PYOGENES UND
ARCANOBACTERIUM HAEMOLYTICUM - 10 -
2.2.1. TAXONOMIE UND PHYLOGENETISCHE EINORDNUNG - 10 -
2.2.2. ERSCHEINUNGSBILD DER BAKTERIELLEN KULTUREN - 13 -
2.2.3. METHODEN ZUR ARTBESTIMMUNG VON ARCANOBACTERIUM UND TRUEPERELLA -
14 -
2.2.4. DURCH TRUEPERELLA UND ARCANOBACTERIUM VERURSACHTE KRANKHEITEN -
15 -
2. 3. BAKTERIELLE VIRULENZFAKTOREN - 20 -
2.3.1. UEBERBLICK - 20 -
2.3.2. CHOLESTEROL-ABHAENGIGE ZYTOLYSINE (CDCS) - 23 -
2.3.3. PHOSPHOLIPASEN - 26 -
2.3.4. DNASEN -29-
2.3.5. NEURAMINIDASEN - 30 -
2.3.6. UPF0027/RTCB-PROTEINE - 33 -
2.3.7. UEBERSICHT UEBER DIE VIRULENZFAKTOREN VON ARCANOBACTERIUM
HAEMOLYTICUM
UND TRUEPERELLA PYOGENES - 34 -
3. PROBLEMSTELLUNG UND ZIELE - 35 -
4. MATERIAL UND METHODEN - 36 -
4.1. MATERIAL - 36 -
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INHALTSVERZEICHNIS
4.1.1. REFERENZ-BAKTERIENSTAEMME -36-
4.1.2. NAEHRMEDIEN - 36 -
4.1.3. CHEMIKALIEN UND REAGENZIEN - 37 -
4.1.4. TESTKITS - 38 -
4.1.5. RESTRIKTIONSENDONUKLEASEN UND DEREN PUFFER - 39 -
4.1.6. VERBRAUCHSMATERIALIEN - 39 -
4.1.7. GERAETE - 40 -
4.1.8. COMPUTERPROGRAMME - 42 -
4.2. METHODEN - 42 -
4.2.1. NAEHRMEDIEN FUER BAKTERIEN - 42 -
4.2.2. DNA-EXTRAKTION AUS BAKTERIEN - 45 -
4.2.3. AGAROSE-GELELEKTROPHORESE - 48 -
4.2.4. FILTERPAPIER-TEST ZUM NACHWEIS VON NEURAMINIDASE-/
SIALIDASE-AKTIVITAET - 50 -
4.2.5. HERSTELLUNG VON
T. BONASI-
UND
T.
TO/OW/EZENSZ S-COSMID-BIBLIOTHEKEN - 50 -
4.2.6. COSMIDEXTRAKTION/PLASMIDEXTRAKTION - 59 -
4.2.7. SUBKLONIERUNGEN VON GESCHNITTENEN COSMID-INSERTS IN DEN
PLASMID-VEKTOR
PJET 1.2 -60-
4.2.8. AUSWERTEN ERMITTELTER SEQUENZEN - 63 -
4.2.9. HAEMOLYSEAKTIVITAET-ASSAY - 63 -
4.2.10. POLYMERASE-KETTENREAKTION (PCR) - 65 -
4.2.11. DNA-BLOTTING (DOTBLOT-HYBRIDISIERUNG, SOUTHERN BLOTTING) - 73 -
4.2.12. DNASE-TEST -80-
4.2.13. ERSTELLUNG PHYLOGENETISCHER STAMMBAEUME - 80 -
4.2.14. ERSTELLUNG RAEUMLICHER PROTEINSTRUKTUR-MODELLE - 82 -
5. ERGEBNISSE - 83 -
5.1.1. MUAN-TEST DER BAKTERIEN AUF FILTERPAPIER - 86 -
5.1.2. SCREENING DER COSMID-BIBLIOTHEKEN AUF NEURAMINIDASE-AKTIVITAET -
86 -
5.1.3. SUBKLONIERUNG DES COSMID-KLONES BON/COS6A IN DEN PLASMIDVEKTOR
PJET 1.2. UND IDENTIFIZIERUNG ZWEIER NEURAMINIDASE-POSITIVER PLASMID-
KLONE - 87-
5.1.4. SEQUENZIERUNG DES NEURAMINIDASE-POSITIVEN PLASMID-KLONS
BON/COS6A/PJET4A - 89 -
5.1.5. DIE TRUEPERELLA AONAS; -NEURAMINIDASE - 89 -
5.1.6. DAS TRUEPERELLA BONASI *UPF-AEHNLICHE PROTEIN - 96 -
VI
INHALTSVERZEICHNIS
5.1.7. UEBERPRUEFUNG DER ERGEBNISSE - 98 -
5.2. HAEMOLYSIN - 101 -
5.2.1. HAEMOLYSE VON TRUEPERELLA BONASI DSM 17163 UND TRUEPERELLA
BIALOWIEZENSIS DSM 17162 AUF TIERBLUT-AGARPLATTEN - 101 -
5.2.2. HAEMOLYSEAKTIVITAET-ASSAY - 103 -
5.2.3. DOTBLOT UND SOUTHERN BLOT-HYBRIDISIERUNGEN - 104 -
5.2.4. PCR - 108 -
5.2.5. SCREENING DER COSMID-BIBLIOTHEKEN AUF SELEKTIVPLATTEN,
SUBKLONIERUNG IN
PLASMIDVEKTOR PJET 1.2. UND SEQUENZIERUNG - 113 -
5.3. PHOSPHOLIPASE D - 117 -
5.3.1. DOTBLOT HYBRIDISIERUNG - 117 -
5.3.2. SPEZIFISCHE PCR - 118-
5.3.3. SCREENING DER COSMID-BIBLIOTHEKEN AUF PLD-AKTIVITAET - 118-
5.4. DESOXYRIBONUKLEASE -119-
5.4.1. UNTERSUCHUNG DER COSMID-BIBLIOTHEKEN AUF DNASE-AKTIVITAET - 119-
6. DISKUSSION - 120 -
6.1. RELEVANZ DER UNTERSUCHUNGEN - 120 -
6.2. STUDIENDESIGN: AUSWAHL DER VERGLEICHSORGANISMEN UND PRINZIPIELLE
VORGEHENSWEISE - 121 -
6.3. NEURAMINIDASE-AKTIVITAET - 123 -
6.4. HAEMOLYSE - 126 -
6.5. PHOSPHOLIPASE-AKTIVITAET - 130 -
6.6. DNASE-AKTIVITAET - 131 -
6.7. SCHLUSSFOLGERUNGEN UND AUSBLICK - 132 -
7. ZUSAMMENFASSUNG - 134 -
8. SUMMARY - 136 -
9. LITERATURVERZEICHNIS - 138 -
ANHANG A: -166-
VEKTORKARTE DES COSMID-VEKTORS SUPERCOS 1 (AGILENT TECHNOLOGIES) - 166 -
ANHANG B: - 167 -
VEKTORKARTE DES PLASMID-VEKTORS PJET1.2/BLUNT (FERMENTAS) - 167 -
ANHANG C: -168-
NUKLEOTIDSEQUENZ DES INSERTS DES NEURAMINIDASE-POSITIVEN T. BONASI-KXONS
BON/COS6A/PJET4A - 168 -
VII
INHALTSVERZEICHNIS
ANHANG D: - 170 -
ALIGNMENT NEURAMINIDASEN - 170 -
DANKSAGUNG - 177 -
SELBSTAENDIGKEITSERKLAERUNG - 179 -
VIII
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