Mikrobielle Populationsstruktur und -dynamik in einer nitrifizierenden, denitrifizierenden Belebtschlammanlage:
Gespeichert in:
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| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
2000
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A
EINLEITUNG.
1
B
MATERIAL
&
METHODEN
.
.10
B.1
U
NTERSUCHTE
K
LAERANLAGEN
.
10
B.2
V
ERWENDETE
O
RGANISMEN
.
.
YY
.
11
B.3
A
NZUCHT
UND
S
TAMMHALTUNG
.
12
B.3.
1
NAEHRMEDIEN
ZUR
ANZUCHT
VON
ORGANISMEN
.
12
B.3.
2
KULTURFUHRUNG
DER
AMMONIAK-OXIDANTEN
.
14
B.3
3
REINHEITSKONLROLLE
.14
B
3.4
A
BERNTEN
DER
BAKTERIENZELLEN
.
14
B.4
ZELLFI.XIERUNGEN
.
.
.
14
B.4.1
PARAFORMALDEHYDFIXIERUNG
.
14
B.4
2
ETHANOLFIXIERUNG
.15
B.5
I
SOLIERUNG
VON
N
UKLEINSAEUREN
.
.
16
B.5
/
ISOLIERUNG
CHROMOSOMALER
DNS
NACH
CHAN
UND
GOODWIN
(1995)
(A-METHODE)
.
16
B.5
2
ISOLIERUNG
CHROMOSOMALER
DNS
NACH
ZHOU
ET
AL.
(1996)
(H~METHODE)
.
17
B.5
3
VERBESSERTE
METHODE
ZUR
ISOLIERUNG
CHROMOSOMALER
DNS (S-METHODE)
.
18
B.6
AMPLIFIZIERUNG
VON
RIBOSOMALEN
DNS-FRAG
MENTEN
.
19
B6.1
PCR-AMPLIFLKATIONSPNMER
.19
B.6
2
KAPIILAR-PCR
.
19
B.6.
3
GRADIENLEN-PCR
.20
B.6.4
QUALITATIVE
ANALYSE
DER
AMPLIFLKATE DURCH
HORIZONTALE
AGAROSEGELELEKTROPHORESE
.
21
B.6.5
REINIGUNG
DER
PCR-AMPLIFIKATE
.
22
B.7
K
LONIERUNG
VON
PCR-A
MPLIFIKATEN
.
22
B.7.1
TA
CLONING
KIT
.
22
B.
7.2
TOPO
TA
CLOMNG*
KIT
.
23
B.8
I
SOLIERUNG
VON
P
LASMID
-DNS
UND
R
ESTRIKTIONSANALYSE
.
23
B.8.
1
PLASMIDISOLIERUNG
MIT
QIAGEN-SPIN
PLASMIDISOLIERUNGSKIT
.
23
B.8.2
RESTRIKTIONS-ANALYSE
.24
B.9
DNS-S
EQUENZANALYSE
MITTELS
AUTOMATISCHER
DNS-S
EQUENZIEREINIIEIT
.
24
B.9.1
SEQUENZIERPRIMER
.24
B.
9.2
'CYCLE
SEQUENCING
'
-STANDARDREAKTIONSANSATZ
.
25
B.
9.3
POLYACRYLAMID-GELELEKTROPHORESE
.
26
B.9.
4
DETEKTION
UND
ANALYSE
VON
DNS-SEQUENZEN
.
27
B.I0
A
USWERTUNG
DER
S
EQUENZDATEN
UND
S
ONDENKONSTRUKTION
.
27
B.
10
L
VERGLEICHENDE
ANORDNUNG
DER
SEQUENZEN
(AHGNMENT)
.
27
B
10.2
REKONSTRUKTION
VON
STAMMBAEUMEN
.
27
B
10.3
ENTWICKLUNG
VON
L6S-RRNS
GERICHTETEN
SONDEN
.
.
.
27
B.11
M
ARKIERUNG
DER
O
LIGONUKLEOTIDE
.
28
B.L
1.1
OLIGONUKLEOTIDE,
GEKOPPELT
MIT
FLUORESZENZFARBSTOJFEN
.
28
B.L
1
2
MARKIERUNG
DER
OLIGONUKLEOTIDE
MIT
MEERETTICH-PEROXIDASE
(POD)
.
28
B.12
I
N
SITU
E
INZELZELLHYBRIDISIERUNGEN
.
31
B.L
2
1
HERSTELLUNGGELATINEBESCHICHTETER
OBJEKTTRAEGER
.31
B.L
2.2
LYSOZYM-VORBEHANDLUNG
.
32
B.L
2.3
HYBRIDISIERUNGSPROZEDUR
.
32
B
12.4
HYBRIDISIERUNG
MIT
KOMPETITORSONDEN
.
34
B.
12.5
SIMULTANE
DOPPEL
UND
DREIFACHHYBRIDISIERUNG
MIT
UNTERSCHIEDLICH
MARKIERTEN
SONDEN
.
34
B
12.6
SUKZESSIVE
HYBRIDISIERUNG
.
34
B.13
MIKROSKOPISCHE
T
ECHNIKEN
.
34
B
13
1
DETEKTION
FLUORESZENZMARKIERTER
ZELLEN
DURCH
EPIFLUORESZENZMIKROSKOPIE.
.
34
B.L
3.2
KONFOKALE
LASER-SCANNING-MIKROSKOPIE
(CLSM)
.
35
B.
13.3
QUANTIFIZIERUNG
VON
FLUORESZENZSIGNALEN
.
36
B.I4
M
IKROAUTORADIOGRAPHIE
(MAR)
.
36
B.L
4.1
PRINZIP
DER
MIKROAUTORADIOGRAPHIE
.
36
B.L
4.2
TROCKENGEWICHTSBESTIMMUNG
DER
SCHLAMMPROBE
.
37
B.
14.3
VERWENDETE
RADIOAKTIV
MARKIERTE
SUBSTRATE
.
38
B.
14
4
INKUBATION
MIT
RADIOAKTIV
MARKIERTEN
SUBSTRATEN
.
38
B.14.5
KONTROLLEN
.
38
B.
14
6
FIXIERUNG
MIT
PARAFORMALDEHYD,
ETHANOL;
WASCHSCHRITTE
.
39
B.
14.7
FLUSSIG-SCINTILLATOR-MESSUNGEN
.
39
B.
14.8
HOMOGENISIERUNG
DER
VERDUENNTEN
PROBE
.
40
B.
14.9
SCHNEIDEN
DER
PROBE
MIT
DEM
KRYOMIKROTOM
.
40
B.
14.10
KOMBINATION
MIT
FLUORESZENZ
IN
SITU
HYBRIDISIERUNG
(FISH)
.
40
B.
14.11
A
UTORADIOGRAPHIE-PROZEDUR
.
.
.
40
B.
14.12
ENTWICKLUNG
DES
FILMES
.
42
C
ERGEBNISSE
.
43
C.L
M
IKROBIELLE
P
OPULATIONSANALYSE
DER
K
LAERANLAGE
K
RAFTISRIED
.
43
C.
1.1
BESCHREIBUNG
DER
KLAERANLAGE
KRAFTISRIED
.
43
C.
1.2
ERSTELLUNG
VON
16S~RDNS
GENBANK
UNTER
VERWENDUNG
UNTERSCHIEDLICHER
DNS
EXTRAKTIONSMETHODEN
.
.44
C.
1.3
PHYLOGENETISCHE
ANALYSEN
DER
SEQUENZEN
AUS
DEN
VERSCHIEDENEN
!6S-RDNS
GENBANKEN
(A,H,S).44
C.
1.3.1
EINTEILUNG
DER
KLONSEQUENZEN
IN
OTUS
("OPERATIONAL
TAXONOMIC
UNITS")
.
44
C.
1.3.2
VERTRETER
DER
SS-UNTERGRUPPE
DER
PROTEOBACTENA
IN
KRAFTISRIED
.
45
C.
1.3.3
VERTRETER
DER
A-UNTERGRUPPE
DER
PROTEOBACTENA
IN
KRAFTISRIED
.
48
C.
1.3.4
VERTRETER
DER
8-UNTERGRUPPE
DER
PROTEOBACTENA
IN
KRAFTISRIED
.
48
C.
1.3.5
VERTRETER
DER
PLANCTOMYCETALES
IN
KRAFTISRIED
.
48
C.L.
3.6
VERTRETER
DER
HOLOPHAGA
/
ACIDOBACTERIUM,
VERRUCOMICROBIA
UND
NITROSPIRA
IN
KRAFTISRIED
.
49
C.
1
.3
7
VERTRETER
DER
GRUENEN,
NICHT-SCHWEFELHALTIGEN
BAKTERIEN
(GNS)
IN
KRAFTISRIED
.49
C.
1
.3.8
VERTRETER
DER
GRAM-POSITIVEN
UND
GRUENEN
SCHWEFELHALTIGEN
BAKTERIEN
IN
KRAFTISRIED
.49
C.T.3.9
CHIMAEREN
.
50
C.2
K
LASSISCHE
K
ULTIVIERUNG
VON
N
ITRIFIKANTEN
AUS
DEM
B
ELEBTSCHLAMM
VON
K
RAFTISRIED
.51
C.3
I
N
SITU
U
NTERSUCHUNGEN
DER
M
IKROORGANISMEN
IN
K
RAFTISRIED
.
52
C.
3.1
QUALITATIVE
IN
SITU
UNTERSUCHUNGEN
DER
MIKROORGANISMEN
IN
KRAFTISRIED.
.
52
C.3
I
I
VERTRETER
DER
SS-UNTERGRUPPE
DER
PROTEOBACTENA
.55
C.3.
1.2
VERTRETER
DER
A-UNTERGRUPPE
DER
PROTEOBACTENA
.
.
.
58
C.3.
1
.3
VERTRETER
DES
HOLOPHAGA
/
ACIDOBACTERIUM-PHYLUMS.
60
C.3.1
4
VERTRETER
DER
PLANCTOMYCETALES
.
60
C.3.1
.5
NITROSPIRA
.
61
C.3
1.6
GRUENE,
NICHT-SCHWEFELHALTIGE
BAKTERIEN.
61
C.
3.2
IN
SITU
QUANTIFIZIERUNG
DER
MIKROBIELLEN
POPULATIONSSTRUKTUR
MITTELS
DIGITALER
BILDVERARBEITUNG
.
62
C.
3.3
KOMBINATION
VON
FISH
UND
MIKROAUTORADIOGRAPHIE
(MA
R)
.
66
C.3.
3.1
,4
[C]
BICARBONAT
ALS
RADIOAKTIV
MARKIERTES
SUBSTRAT
.67
C
3,3.2
L4
JCJ
ACETAT
,
J
[H]
ACETAT,
,4
[C}
BUTYRAL
UND
L4
(C]
PROPIONAT
ALS
RADIOAKTIV
MARKIERTE
SUBSTRATE
.69
C.4
K
ONSTRUKTION
EINES
S
ONDENSATZ
ZUR
I
DENTIFIZIERUNG
ALLER
N
ITRIT
-O
XIDANTEN
.
71
C.5
UE
BERPRUEFUNG
UND
E
RWEITERUNG
DES
S
ONDENSATZES
ZUR
I
DENTIFIZIERUNG
DER
A
MMONIAK
-
OXIDANTEN
.
72
D
DISKUSSION
.
80
D.I
A
NALYSE
DER
MIKROBIELLEN
P
OPULATIONSSTRUKTUR
IN
DER
K
LAERANLAGE
K
RAFTISRIED
.
80
D.
I.1
POPULATIONSANALYSE
IN
HINSICHT
AUF
NITRIFIKATION
UND
DENITRIFIKATION
.
81
D.I.
1.1
AMMONIAK-OXIDANTEN
IN
DER
KLAERANLAGE
KRAFTISRIED
.
81
D.
I
.
I
2
NITRIT-OXIDANTEN
IN
DER
KLAERANLAGE
KRAFTISRIED
.
82
D.
1.
1
.2
NITRIT-OXIDANTEN
IN
DER
KLAERANLAGE
KRAFTISRIED
.
82
D.I.
1.3
POTENTIELLE
DENITRIFIKANTEN
IN
DER
KLAERANLAGE
KRAFTISRIED
.
84
D.
1.2
POPULATIONSANALYSE
WEITERER
IN
DEN
16S-RDNS-GENBANKEN
NACHGEWIESENER
BAKTERIENGRUPPEN
.
89
D.
1.
1
.2
GRUENE,
NICHT-SCHWEFELHALTIGE
BAKTERIEN
IN
DER
KLAERANLAGE
KRAFTISRIED
.
89
D.L.L
2
HOLPHAGA
/
ACIDOBACTERIUM
UND
PLANCTOMYCIETALES
IN
DER
KLAERANLAGE
KRAFTISRIED
.
91
D.2
I
N
SITU
Q
UANTIFIZIERUNG
DER
MIKROBIELLEN
P
OPULATIONSSTRUKTUR
MITTELS
DIGITALER
B
ILDVERARBEITUNG
IM
V
ERGLEICH
ZU
DEN
K
LONBANKEN
.93
D.3
U
NTERSUCHUNGEN
DER
D
IVERSITAET
DER
16S
R
RNS-G
ENBANKEN
(A,
H,
S)
.
95
D.4
V
ERGLEICHENDE
A
NALYSEN
ZUR
MIKROBIELLEN
P
OPULATIONSSTRUKTUR
UNTERSCHIEDLICHER
K
LAERANLAGEN
.
97
E
ZUSAMMENFASSUNG.,.,.,,.,.,
.,.,.
YY.,
.
.
.
.99
F
ANHANG
.
100
G
BIBLIOGRAPHIE
_
_
_
101
H
PUBLIKATIONSLISTE
.
114
II |
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