Genetische Charakterisierung der gefährdeten Schafrasse Rouge du Roussillon und Erstellung eines Erhaltungszuchtprogramms:
Gespeichert in:
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|---|---|
| Format: | Abschlussarbeit Buch |
| Sprache: | German |
| Veröffentlicht: |
Gießen
DVG-Service
2011
|
| Ausgabe: | 1. Aufl. |
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| Online-Zugang: | Inhaltsverzeichnis |
| Beschreibung: | VII, 100 S. Ill., graph. Darst. 21 cm |
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INHALTSVERZEICHNIS
SEITE
ABBILDUNGSVERZEICHNIS HI
TABELLENVERZEICHNIS IV
ABKUERZUNGSVERZEICHNIS VI
1. EINLEITUNG 1
2. LITERATURUEBERSICHT 2
2.1. GEFAEHRDETE HAUSTIERRASSEN 2
2.1.1. GEFAEHRDETE SCHAFRASSEN 4
2.1.2. GRUENDE FUER DIE ERHALTUNG VON RASSEN 4
2.1.3. STRATEGIEN ZUR ERHALTUNG VON RASSEN 5
2.1.4. AUSWAHL VON RASSEN ZUR ERHALTUNG 6
2.2. ERHALTUNGSZUCHTPROGRAMME 8
2.3. DAS ROUGE DU ROUSSILLON-SCHAF 9
2.4. REFERENZRASSEN 12
2.4.1. COBURGER FUCHSSCHAF (CF) 12
2.4.2. MOUREROUS (MOU) 12
2.4.3. LACAUNE VIANDE (LV) 12
2.5. MIKROSATELLITEN 13
2.5.1. ANWENDUNGSGEBIETE 13
2.5.2. MUTATIONSMODELLE 14
2.5.3. NACHTEILE VON MIKROSATELLITEN 15
2.5.3.1. NULLALLELE 15
2.5.3.2. ASCERTAINMENT BIAS 16
2.6. UNTERSUCHUNGEN ZUR GENETISCHEN DIVERSITAET BEI SCHAFEN 16
2.7. EINFLUSSFAKTOREN AUF DIE GENETISCHE VARIATION 17
2.8. GENETISCHE DISTANZEN 18
2.9. WRIGHTS F-STATISTIK 19
2.10. ZUORDNUNG VON INDIVIDUEN ZU IHRER URSPRUNGSPOPULATION 21
3. MATERIAL UND METHODEN 22
3.1. PROBENMATERIAL 22
3.1.1. TIERMATERIAL 22
3.1.2. STANDARDPROBEN 23
3.2. VERBRAUCHSMATERIALIEN 23
3.2.1. CHEMIKALIEN, PUFFER UND REAKTIONSKITS 23
3.2.2. ENZYME 24
3.2.3. OLIGONUKLEOTIDE 24
3.2.4. LAENGENSTANDARDS 24
3.2.5. PLASTIKWAREN, FILTER, TUECHER 24
3.3. GERAETE UND ZUBEHOER 25
3.4. COMPUTERPROGRAMME 26
3.5. MOLEKULARBIOLOGISCHE METHODEN 26
3.5.1. GEWINNUNG VON BUFFY COAT AUS VOLLBLUT 26
3.5.2. ISOLATION VON DNA AUS BUFFY COAT 26
3.5.3. BESTIMMUNG DER DNA-KONZENTRATION 26
3.5.4. POLYMERASEKETTENREAKTION 26
3.5.4.1. MIKROSATELLITENMARKER 26
3.5.4.2. PCR-BEDINGUNGEN 27
3.5.5. UEBERPRUEFUNG DES PCR-ERFOLGES DURCH AGAROSEGELELEKTROPHORESE 29
3.5.6. DENATURIERENDE POLYACRYLAMIDGELELEKTROPHORESE AM DNA- SEQUENCER
29 3.6. STATISTISCHE METHODEN 30
3.6.1. DESKRIPTIVE STATISTIK 30
I
BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN HTTP://D-NB.INFO/1018150323
DIGITALISIERT DURCH
IMAGE 2
INHALTSVERZEICHNIS
SEITE
3.6.2. DIVERSITAETSANALYSEN 31
3.6.3. ANALYSE VON POPULATIONSSTRUKTUREN 31
4. ERGEBNISSE 35
4.1. PHAENOTYPISCHE DATEN 35
4.2. PEDIGREEDATEN 36
4.2.1. ZUCHTPLANUNG 37
4.3. GENETISCHE DATEN 38
4.3.1. MIKROSATELLITEN 38
4.3.1.1. ALLELZAHL UND PIC-WERTE 38
4.3.1.2. PRIVATE (RASSESPEZIFISCHE) ALLELE 39
4.3.1.3. HARDY-WEINBERG-GLEICHGEWICHT 40
4.3.2. GENETISCHE VARIABILITAET INNERHALB DER POPULATIONEN 41
4.3.2.1. F-STATISTIK 41
4.3.3. GENETISCHE DIFFERENZIERUNG ZWISCHEN DEN POPULATIONEN 42
4.3.3.1. GENETISCHE DISTANZEN ZWISCHEN DEN POPULATIONEN 43
4.3.4. EINORDNUNG DER RASSEN IN DEN EUROPAEISCHEN KONTEXT 43
4.3.4.1. HAUPTKOMPONENTENANALYSE 44
4.3.4.2. NEIGHBOUR-JOINING- BAEUME 45
4.3.4.3. BAYESIAN MODEL-BASED CLUSTERING ANALYSE 48
4.3.5. ZUORDNUNG VON INDIVIDUEN ZU IHRER URSPRUNGSPOPULATION 52
5. DISKUSSION 54
5.1. EIGNUNG DER MIKROSATELLITEN 54
5.1.1. ABWEICHUNGEN VOM HARDY-WEINBERG-GLEICHGEWICHT 55
5.1.2. PRIVATE (RASSESPEZIFISCHE) ALLELE 55
5.2. DIVERSITAET INNERHALB DER POPULATIONEN 56
5.3. GENETISCHE DISTANZEN ZWISCHEN DEN POPULATIONEN 57
5.3.1. F-STATISTIK 58
5.4. EINORDNUNG DER RASSEN IN DEN EUROPAEISCHEN KONTEXT 58
5.4.1. HAUPTKOMPONENTENANALYSE 58
5.4.2. PHYLOGENETISCHE BAEUME 59
5.5. ZUORDNUNG VON INDIVIDUEN ZU IHREN URSPRUNGSPOPULATIONEN 60
5.6. DEUTSCHE POPULATION DES ROUGE DU ROUSSILLON-SCHAFES 61
5.7. ALTER FRANZOESISCHER TYP DES ROUGE DU ROUSSILLON-SCHAFES 61
5.8. NEUER FRANZOESISCHER TYP DES ROUGE DU ROUSSILLON-SCHAFES 62
5.9. BEZIEHUNG ZWISCHEN DEM ALTEN FRANZOESISCHEN UND DEM DEUTSCHEN TYP
DER 63 ROUGE DU ROUSSILLON-SCHAFE 5.10. VOLLSTAENDIGKEIT DER
PEDIGREEDATEN UND INZUCHTKOEFFIZIENT 64
5.11. ZUCHTPLANUNG 64
5.12. SITUATION DER RASSE IN DEUTSCHLAND UND FRANKREICH 66
5.13. TIERSEUCHENSITUATION IN DER DEUTSCHEN POPULATION 68
5.14. AUSBLICK FUER DIE RASSE 69
6. ZUSAMMENFASSUNG 70
7. SUMMARY 72
8. LITERATURVERZEICHNIS 74
9. ANHANG 87
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