Diagnostik der Gattung Burkholderia: eine Bestandsaufnahme ; Untersuchung einer vermeintlichen nosokomialen Infektion mit Burkholderia cepacia
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2005
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adam_text | Inhaltsverzeichnis
1 Zusammenfassung 7
2 Einleitung 9
2.1 Die Burkholderia cepac/a Infektion 10
2.1.1 Auftreten von Infektionen mit Burkholderia cepacia 10
2.1.2 Reservoir und Übertragung von Burkholderia cepacia 11
2.1.3 Pathologie der Infektionen mit Burkholderia cepacia 12
2.1.4 Klinik der Infektionen mit Burkholderia cepacia 12
2.1.5 Kommerzieller Einsatz von Burkholderia cepacia 13
2.2 Das Genus Burkholderia 14
2.2.1 Taxonomie der Burkholderien 14
2.2.2 Burkholderien und deren phänotypische Charakteristika 15
2.3 Resistenzverhalten von und Therapie der Infektion mit Burkholderia cepacia 20
2.3.1 Art und Ursachen der Resistenz von Burkholderia cepacia 20
2.3.2 Therapieempfehlung beim Nachweis von Burkholderia cepacia 20
2.4 PCR und Sequenzanalyse von Bakterien DNA 21
2.4.1 Technik und Auswertung der Polymerase Kettenreaktion 21
2.4.2 Verwendungsmöklichkeiten der Polymerase Kettenreaktion 22
2.5 Pulsfeldgelelektrophorese 23
2.5.1 Prinzip und Auswertung der Pulsfeldgelelektrophorese 23
2.5.2 Einsatzmöglichkeiten und Grenzen der Pulsfeldgelelektrophorese 26
2.6 Alternative Untersuchungsmethoden zu PCR und PFGE 27
3 Ziele der Arbeit 29
4 Material und Methoden 30
4.1 Patientenkollektiv 30
4.2 Bakterienstämme und deren phänotypische Identifizierung 30
4.3 Resistenzbestimmung 33
4.4 PCR zum Nachweis des recA Gens 34
4.5 Spe Enzym Restriktion und Pulsfeldgelelektrophorese 35
4.6 Zitierweise 37
5 Ergebnisse 38
5.1 Charakterisierung der mit Burkholderia cepacia kolonisierten Patienten 38
5.2 Phänotypische Untersuchung der untersuchten Bakterienstämme 42
5.3 Resistenzverhalten der untersuchten Bakterienstämme 52
5.4 Nachweis des recA Gens mittels PCR und Sequenzierung 66
5.5 Ergebnis der Pulsfeldgelelektrophorese nach Spe Enzym Restriktion 73
6 Diskussion 77
6.1 Nosokomiale Infektion oder zufällige Häufung einer Kolonisation? 77
6.2 Beurteilung der Probensammlung und der eingesetzten Methodik 80
6.3 Bedeutung der Burkholderien in der Klinik 86
6.4 Umgang mit Burkholderien im Krankenhaus 89
7 Schlussfolgerungen 92
8 Literaturverzeichnis 94
9 Anhang 109
9.1 Schreiben der Firma Becton Dickinson vom 26.08.2002 109
9.2 Schreiben der Firma bio Merieux vom 11.10.2002 111
Danksagung 112
Lebenslauf 113
Ehrenwörtliche Erklärung 115
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Inhaltsverzeichnis
1 Zusammenfassung 7
2 Einleitung 9
2.1 Die Burkholderia cepac/a Infektion 10
2.1.1 Auftreten von Infektionen mit Burkholderia cepacia 10
2.1.2 Reservoir und Übertragung von Burkholderia cepacia 11
2.1.3 Pathologie der Infektionen mit Burkholderia cepacia 12
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2.2.2 Burkholderien und deren phänotypische Charakteristika 15
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2.3.1 Art und Ursachen der Resistenz von Burkholderia cepacia 20
2.3.2 Therapieempfehlung beim Nachweis von Burkholderia cepacia 20
2.4 PCR und Sequenzanalyse von Bakterien DNA 21
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2.4.2 Verwendungsmöklichkeiten der Polymerase Kettenreaktion 22
2.5 Pulsfeldgelelektrophorese 23
2.5.1 Prinzip und Auswertung der Pulsfeldgelelektrophorese 23
2.5.2 Einsatzmöglichkeiten und Grenzen der Pulsfeldgelelektrophorese 26
2.6 Alternative Untersuchungsmethoden zu PCR und PFGE 27
3 Ziele der Arbeit 29
4 Material und Methoden 30
4.1 Patientenkollektiv 30
4.2 Bakterienstämme und deren phänotypische Identifizierung 30
4.3 Resistenzbestimmung 33
4.4 PCR zum Nachweis des recA Gens 34
4.5 Spe Enzym Restriktion und Pulsfeldgelelektrophorese 35
4.6 Zitierweise 37
5 Ergebnisse 38
5.1 Charakterisierung der mit Burkholderia cepacia kolonisierten Patienten 38
5.2 Phänotypische Untersuchung der untersuchten Bakterienstämme 42
5.3 Resistenzverhalten der untersuchten Bakterienstämme 52
5.4 Nachweis des recA Gens mittels PCR und Sequenzierung 66
5.5 Ergebnis der Pulsfeldgelelektrophorese nach Spe Enzym Restriktion 73
6 Diskussion 77
6.1 Nosokomiale Infektion oder zufällige Häufung einer Kolonisation? 77
6.2 Beurteilung der Probensammlung und der eingesetzten Methodik 80
6.3 Bedeutung der Burkholderien in der Klinik 86
6.4 Umgang mit Burkholderien im Krankenhaus 89
7 Schlussfolgerungen 92
8 Literaturverzeichnis 94
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